Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15588
• Subject: NM_028230.4
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1333
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGCTGTACTTCTCTTTGTTTTGGGCGGCTCGGCCTCTGCAGAGATGTGGGCAGCTGGTCAGGATGGCCATTCG  74
            |||.|.|.||||||||||.||.||.|..||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|||||....||
Sbjct    1  ATGGTATCCTTCTCTTTGCTTCGGACCACTCGGCCTCTGCAGAGATGTGGTCAGCTGGTCTGCATGGCTGCCCG  74

Query   75  GGCTCAGCACAGCAACGCAGCCCAGACTCAGACTGGGGAAGCAAACAGG-GGCTGGACAGGCCAGGAGAGCCTG  147
            |||.|||||||||||.|..||||||||.|||.|||||||||| |.|.|| ||.|||||.|||||||||||..|.
Sbjct   75  GGCCCAGCACAGCAAGGTGGCCCAGACGCAGGCTGGGGAAGC-AGCTGGAGGTTGGACGGGCCAGGAGAGTTTA  147

Query  148  TCGGACAGTGATCCTGAGATGTGGGAGTTGCTGCAGAGGGAGAAGGACAGGCAGTGTCGTGGCCTGGAGCTCAT  221
            ||.||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  148  TCAGACAGTGACCCTGAGATGTGGGAGCTTCTGCAGAGGGAGAAGGACAGACAGTGTCGCGGCCTGGAGCTCAT  221

Query  222  TGCCTCAGAGAACTTCTGCAGCCGAGCTGCGCTGGAGGCCCTGGGGTCCTGTCTGAACAACAAGTACTCGGAGG  295
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  222  CGCCTCAGAGAACTTCTGCAGCCGAGCTGCGCTGGAGGCCCTGGGGTCCTGTCTCAACAACAAGTACTCGGAGG  295

Query  296  GTTATCCTGGCAAGAGATACTATGGGGGAGCAGAGGTGGTGGATGAAATTGAGCTGCTGTGCCAGCGCCGGGCC  369
            ||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  296  GTTACCCTGGCAAGAGATACTACGGAGGAGCGGAAGTGGTGGACGAGATCGAGCTGCTCTGCCAGCGCCGGGCC  369

Query  370  TTGGAAGCCTTTGACCTGGATCCTGCACAGTGGGGAGTCAATGTCCAGCCCTACTCCGGGTCCCCAGCCAACCT  443
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  370  TTGGAAGCCTTTGACCTGGATCCGGCACAGTGGGGAGTCAATGTGCAGCCATACTCAGGGTCCCCAGCCAATCT  443

Query  444  GGCCGTCTACACAGCCCTTCTGCAACCTCACGACCGGATCATGGGGCTGGACCTGCCCGATGGGGGCCATCTCA  517
            |||.|.|||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GGCTGCCTATACGGCCCTTCTGCAGCCTCATGATCGAATCATGGGGTTGGACCTGCCCGATGGGGGCCATCTCA  517

Query  518  CCCACGGCTACATGTCTGACGTCAAGCGGATATCAGCCACGTCCATCTTCTTCGAGTCTATGCCCTATAAGCTC  591
            ||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  CCCATGGCTACATGTCTGATGTCAAGCGGATCTCCGCCACATCCATTTTCTTCGAGTCTATGCCCTATAAGCTC  591

Query  592  AACCCCAAAACTGGCCTCATTGACTACAACCAGCTGGCACTGACTGCTCGACTTTTCCGGCCACGGCTCATCAT  665
            ||.|||.|||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  592  AATCCCCAAACTGGCCTCATCGACTACGACCAGCTGGCGCTGACCGCTCGGCTTTTCCGACCGCGGCTCATCAT  665

Query  666  AGCTGGCACCAGCGCCTATGCTCGCCTCATTGACTACGCCCGCATGAGAGAGGTGTGTGATGAAGTCAAAGCAC  739
            |||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||..||||
Sbjct  666  AGCTGGCACGAGTGCCTATGCCCGCCTCATTGACTATGCACGCATGAGAGAGGTCTGTGATGAGGTCAGGGCAC  739

Query  740  ACCTGCTGGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAGGTGATTCCCTCGCCTTTCAAGCACGCG  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|||||
Sbjct  740  ACCTGCTGGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAGGTGATCCCCTCCCCTTTCAAGTACGCG  813

Query  814  GACATCGTCACCACCACTACTCACAAGACTCTTCGAGGGGCCAGGTCAGGGCTCATCTTCTACCGGAAAGGGGT  887
            ||..|.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  814  GATGTTGTTACCACCACCACTCACAAGACACTGCGAGGGGCCAGGTCAGGGCTCATCTTCTACCGGAAGGGAGT  887

Query  888  --GAAGGCTGTGGACCCCAAGACTGGCCGGGAGATCCCTTACACATTTGAGGACCGAATCAACTTTGCCGTGTT  959
              |||  |.||.|||||||||||||||...|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  888  ACGAA--CCGTAGACCCCAAGACTGGCAAAGAGATCCCTTATACCTTTGAGGACCGAATCAACTTCGCTGTGTT  959

Query  960  CCCATCCCTGCAGGGGGGCCCCCACAATCATGCCATTGCTGCAGTAGCTGTGGCCCTAAAGCAGGCCTGCACCC  1033
            |||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  960  CCCATCCCTACAGGGTGGCCCCCACAACCACGCCATTGCTGCAGTAGCCGTGGCTCTCAAGCAGGCCTGCACCC  1033

Query 1034  CCATGTTCCGGGAGTACTCCCTGCAGGTTCTGAAGAATGCTCGGGCCATGGCAGATGCCCTGCTAGAGCGAGGC  1107
            |.||||||||.|||||||||.|.||.||.||||.|||.||.|.|||||||||.|||||||||||..|||||||.
Sbjct 1034  CTATGTTCCGCGAGTACTCCTTACAAGTGCTGAGGAACGCCCAGGCCATGGCTGATGCCCTGCTCAAGCGAGGA  1107

Query 1108  TACTCACTGGTATCAGGTGGTACTGACAACCACCTGGTGCTGGTGGACCTGCGGCCCAAGGGCCTGGATGGAGC  1181
            |||||.|||||.||.|||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  TACTCGCTGGTGTCTGGTGGCACTGACACCCACCTGGTGCTGGTGGACCTGCGGCCCAAGGGCCTGGATGGAGC  1181

Query 1182  TCGGGCTGAGCGGGTGCTAGAGCTTGTATCCATCACTGCCAACAAGAACACCTGTCCTGGAGACCGAAGTGCCA  1255
            .||.||.||.||.|||.|.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1182  CCGAGCCGAACGCGTGTTGGAACTCGTCTCCATCACAGCCAACAAGAACACCTGTCCTGGAGACCGGAGCGCCA  1255

Query 1256  TCACACCGGGCGGCCTGCGGCTTGGGGCCCCAGCCTTAACTTCTCGACAGTTCCGTGAGGATGACTTCCGGAGA  1329
            |.||.|||||.|||.||.|||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1256  TTACTCCGGGGGGCTTGAGGCTTGGGGCCCCCGCGTTGACCTCTCGCCAGTTCCGTGAGGACGACTTCCGTAGA  1329

Query 1330  GTTGTGGACTTTATAGATGAAGGGGTCAACATTGGCTTAGAGGTGAAGAGCAAGACTGCCAAGCTCCAGGATTT  1403
            ||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  GTCGTCGATTTTATCGATGAGGGAGTCAACATTGGCTTGGAGGTGAAGCGCAAGACTGCCAAGCTCCAGGATTT  1403

Query 1404  CAAATCCTTCCTGCTTAAGGACTCAGAAACAAGTCAGCGTCTGGCCAACCTCAGGCAACGGGTGGAGCAGTTTG  1477
            |||||||||||||||.||.|||.||||.|||||.||||||.|||||||||||.||||||.||||||.|||||||
Sbjct 1404  CAAATCCTTCCTGCTCAAAGACCCAGAGACAAGCCAGCGTTTGGCCAACCTCCGGCAACAGGTGGAACAGTTTG  1477

Query 1478  CCAGGGCCTTCCCCATGCCTGGTTTTGATGAGCAT  1512
            ||||||.|||||||||||||||.||||||||.|.|
Sbjct 1478  CCAGGGGCTTCCCCATGCCTGGATTTGATGAACGT  1512