Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15588
• Subject: NR_029415.1
• Aligned Length: 2177
• Identities: 1421
• Gaps: 745

Alignment

Query    1  ---------------------------------ATGCTGTA------------------CTT-----CTCTTTG  18
                                             .||||.||                  |||     ||||...
Sbjct    1  ACGGACTGCTAAAGGTCTCCCCTCCCACCTGCATTGCTCTACAATCTGTGGCCTCAGCCCTTGCCAACTCTGCC  74

Query   19  TTTT----GGGCGGCTCGGCCTCTGCAGAGATGTGGGCAGCTGGTCAGGATGGCCATTCGGGCTCAGCACAGCA  88
            |.||    .|..|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTTCCCCCGCTGACTGGGCCTCTGCAGAGATGTGGGCAGCTGGTCAGGATGGCCATTCGGGCTCAGCACAGCA  148

Query   89  ACGCAGCCCAGACTCAGACTGGGGAAGCAAACAGGGGCTGGACAGGCCAGGAGAGCCTGTCGGACAGTGATCCT  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGCAGCCCAGACTCAGACTGGGGAAGCAAACAGGGGCTGGACAGGCCAGGAGAGCCTGTCGGACAGTGATCCT  222

Query  163  GAGATGTGGGAGTTGCTGCAGAGGGAGAAGGACAGGCAGTGTCGTGGCCTGGAGCTCATTGCCTCAGAGAACTT  236
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct  223  GAGATGTGGGAGTTGCTGCAGAGGGAGAAGGACAGGCAGTGTCGTGGCCTGGAGCTCATTGCCTC---------  287

Query  237  CTGCAGCCGAGCTGCGCTGGAGGCCCTGGGGTCCTGTCTGAACAACAAGTACTCGGAGGGTTATCCTGGCAAGA  310
                                                                                   |||
Sbjct  288  -----------------------------------------------------------------------AGA  290

Query  311  GATACTATGGGGGAGCAGAGGTGGTGGATGAAATTGAGCTGCTGTGCCAGCGCCGGGCCTTGGAAGCCTTTGAC  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  GATACTATGGGGGAGCAGAGGTGGTGGATGAAATTGAGCTGCTGTGCCAGCGCCGGGCCTTGGAAGCCTTTGAC  364

Query  385  CTGGATCCTGCACAGTGGGGAGTCAATGTCCAGCCCTACTCCGGGTCCCCAGCCAACCTGGCCGTCTACACAGC  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  CTGGATCCTGCACAGTGGGGAGTCAATGTCCAGCCCTACTCCGGGTCCCCAGCCAACCTGGCCGTCTACACAGC  438

Query  459  CCTTCTGCAACCTCACGACCGGATCATGGGGCTGGACCTGCCCGATGGGGGCCATCTCACCCACGGCTACATGT  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  CCTTCTGCAACCTCACGACCGGATCATGGGGCTGGACCTGCCCGATGGGGGCCATCTCACCCACGGCTACATGT  512

Query  533  CTGACGTCAAGCGGATATCAGCCACGTCCATCTTCTTCGAGTCTATGCCCTATAAGCTCAAC------------  594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct  513  CTGACGTCAAGCGGATATCAGCCACGTCCATCTTCTTCGAGTCTATGCCCTATAAGCTCAACGGCTTTAGCTGT  586

Query  595  ----------------CCCAAAACTGGCCTCATTGACTACAACCAGCTGGCACTGACTGCTCGACTTTTCCGGC  652
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  TTGTGTGTCTGTCCAGCCCAAAACTGGCCTCATTGACTACAACCAGCTGGCACTGACTGCTCGACTTTTCCGGC  660

Query  653  CACGGCTCATCATAGCTGGCACCAGCGCCTATGCTCGCCTCATTGACTACGCCCGCATGAGAGAGGTGTGTGAT  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  CACGGCTCATCATAGCTGGCACCAGCGCCTATGCTCGCCTCATTGACTACGCCCGCATGAGAGAGGTGTGTGAT  734

Query  727  GAAGTCAAAGCACACCTGCTGGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAGGTGATTCCCTCGCC  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  GAAGTCAAAGCACACCTGCTGGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAGGTGATTCCCTCGCC  808

Query  801  TTTCAAGCACGCGGACATCGTCACCACCACTACTCACAAGACTCTTCGAGGGGCCAGGTCAGGGCTCATCTTCT  874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  TTTCAAGCACGCGGACATCGTCACCACCACTACTCACAAGACTCTTCGAGGGGCCAGGTCAGGGCTCATCTTCT  882

Query  875  ACCGGAAAGGGGTGAAGGCTGTGGACCCCAAGACTGGCCGGGAGATCCCTTACACATTTGAGGACCGAATCAAC  948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  ACCGGAAAGGGGTGAAGGCTGTGGACCCCAAGACTGGCCGGGAGATCCCTTACACATTTGAGGACCGAATCAAC  956

Query  949  TTTGCCGTGTTCCCATCCCTGCAGGGGGGCCCCCACAATCATGCCATTGCTGCAGTAGCTGTGGCCCTAAAGCA  1022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  TTTGCCGTGTTCCCATCCCTGCAGGGGGGCCCCCACAATCATGCCATTGCTGCAGTAGCTGTGGCCCTAAAGCA  1030

Query 1023  GGCCTGCACCCCCATGTTCCGGGAGTACTCCCTGCAGGTTCTGAAGAATGCTCGGGCCATGGCAGATGCCCTGC  1096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  GGCCTGCACCCCCATGTTCCGGGAGTACTCCCTGCAGGTTCTGAAGAATGCTCGGGCCATGGCAGATGCCCTGC  1104

Query 1097  TAGAGCGAGGCTACTCACTGGTATCAGGTGGTACTGACAACCACCTGGTGCTGGTGGACCTGCGGCCCAAGGGC  1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  TAGAGCGAGGCTACTCACTGGTATCAGGTGGTACTGACAACCACCTGGTGCTGGTGGACCTGCGGCCCAAGGGC  1178

Query 1171  CTGGATGGAGCTCGGGCTGAGCGGGTGCTAGAGCTTGTATCCATCACTGCCAACAAGAACACCTGTCCTGGAGA  1244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  CTGGATGGAGCTCGGGCTGAGCGGGTGCTAGAGCTTGTATCCATCACTGCCAACAAGAACACCTGTCCTGGAGA  1252

Query 1245  CCGAAGTGCCATCACACCGGGCGGCCTGCGGCTTGGGGCCCCAGCCTTAACTTCTCGACAGTTCCGTGAGGATG  1318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253  CCGAAGTGCCATCACACCGGGCGGCCTGCGGCTTGGGGCCCCAGCCTTAACTTCTCGACAGTTCCGTGAGGATG  1326

Query 1319  ACTTCCGGAGAGTTGTGGACTTTATAGATGAAGGGGTCAACATTGGCTTAGAGGTGAAGAGCAAGACTGCCAAG  1392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  ACTTCCGGAGAGTTGTGGACTTTATAGATGAAGGGGTCAACATTGGCTTAGAGGTGAAGAGCAAGACTGCCAAG  1400

Query 1393  CTCCAGGATTTCAAATCCTTCCTGCTTAAGGACTCAGAAACAAGTCAGCGTCTGGCCAACCTCAGGCAACGGGT  1466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401  CTCCAGGATTTCAAATCCTTCCTGCTTAAGGACTCAGAAACAAGTCAGCGTCTGGCCAACCTCAGGCAACGGGT  1474

Query 1467  GGAGCAGTTTGCCAGGGCCTTCCCCATGCCTGGTTTTGATGAGCAT----------------------------  1512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct 1475  GGAGCAGTTTGCCAGGGCCTTCCCCATGCCTGGTTTTGATGAGCATTGAAGGCACCTGGGAAATGAGGCCCACA  1548

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1549  GACTCAAAGTTACTCTCCTTCCCCCTACCTGGGCCAGTGAAATAGAAAGCCTTTCTATTTTTTGGTGCGGGAGG  1622

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1623  GAAGACCTCTCACTTAGGGCAAGAGCCAGGTATAGTCTCCCTTCCCAGAATTTGTAACTGAGAAGATCTTTTCT  1696

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1697  TTTTCCTTTTTTTGGTAACAAGACTTAGAAGGAGGGCCCAGGCACTTTCTGTTTGAACCCCTGTCATGATCACA  1770

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1771  GTGTCAGAGACGCGTCCTCTTTCTTGGGGAAGTTGAGGAGTGCCCTTCAGAGCCAGTAGCAGGCAGGGGTGGGT  1844

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1845  AGGCACCCTCCTTCCTGTTTTTATCTAATAAAATGCTAACCTGCCCTGAGTTTCCATTACTGTGGGTGGGGTTC  1918

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1919  CCCTGGGCCAAACAGTGATTTGTCTCCCTCAATGTGTACACCGCTCCGCTCCCACCACCGCTACCACAAGGACC  1992

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1993  CCCGGGGCTGCAGCCTCCTCTTTCTGTCTCTGATCAGAGCCGACACCAGACGTGATTAGCAGGCGCAGCAAATT  2066

Query 1513  -------------------------------  1512
                                           
Sbjct 2067  CAATTTGTTAAATGAAATTGTATTTTGCCCA  2097