Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15588
• Subject: NR_029416.2
• Aligned Length: 2159
• Identities: 1425
• Gaps: 727

Alignment

Query    1  ---------------------------ATGCTGTA------CTTCTCT--TTGTTTTGGGC-------------  26
                                       |||.||.|      ||||.||  |||..|..|||             
Sbjct    1  CTTTCCGGCCAGCTCTGAGCCCTGCAGATGATGCAACCGAGCTTCACTGCTTGCATCAGGCAGGGGTCCCGGCG  74

Query   27  --------GGCT--------------CGGCCTCTGCAGAGATGTGGGCAGCTGGTCAGGATGGCCATTCGGGCT  78
                    ||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGTGAGGGCTGGAAGGAGGTGGAACGGCCTCTGCAGAGATGTGGGCAGCTGGTCAGGATGGCCATTCGGGCT  148

Query   79  CAGCACAGCAACGCAGCCCAGACTCAGACTGGGGAAGCAAACAGGGGCTGGACAGGCCAGGAGAGCCTGTCGGA  152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCACAGCAACGCAGCCCAGACTCAGACTGGGGAAGCAAACAGGGGCTGGACAGGCCAGGAGAGCCTGTCGGA  222

Query  153  CAGTGATCCTGAGATGTGGGAGTTGCTGCAGAGGGAGAAGGACAGGCAGTGTCGTGGCCTGGAGCTCATTGCCT  226
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGTGATCCTGAGATGTGGGAGTTGCTGCAGAGGGAGAAGGACAGGCAGTGTCGTGGCCTGGAGCTCATTGCCT  296

Query  227  CAGAGAACTTCTGCAGCCGAGCTGCGCTGGAGGCCCTGGGGTCCTGTCTGAACAACAAGTACTCGGAGGGTTAT  300
            |                                                                         
Sbjct  297  C-------------------------------------------------------------------------  297

Query  301  CCTGGCAAGAGATACTATGGGGGAGCAGAGGTGGTGGATGAAATTGAGCTGCTGTGCCAGCGCCGGGCCTTGGA  374
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  298  -------AGAGATACTATGGGGGAGCAGAGGTGGTGGATGAAATTGAGCTGCTGTGCCAGCGCCGGGCCTTGGA  364

Query  375  AGCCTTTGACCTGGATCCTGCACAGTGGGGAGTCAATGTCCAGCCCTACTCCGGGTCCCCAGCCAACCTGGCCG  448
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  AGCCTTTGACCTGGATCCTGCACAGTGGGGAGTCAATGTCCAGCCCTACTCCGGGTCCCCAGCCAACCTGGCCG  438

Query  449  TCTACACAGCCCTTCTGCAACCTCACGACCGGATCATGGGGCTGGACCTGCCCGATGGGGGCCATCTCACCCAC  522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  TCTACACAGCCCTTCTGCAACCTCACGACCGGATCATGGGGCTGGACCTGCCCGATGGGGGCCATCTCACCCAC  512

Query  523  GGCTACATGTCTGACGTCAAGCGGATATCAGCCACGTCCATCTTCTTCGAGTCTATGCCCTATAAGCTCAACCC  596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  GGCTACATGTCTGACGTCAAGCGGATATCAGCCACGTCCATCTTCTTCGAGTCTATGCCCTATAAGCTCAACCC  586

Query  597  CAAAACTGGCCTCATTGACTACAACCAGCTGGCACTGACTGCTCGACTTTTCCGGCCACGGCTCATCATAGCTG  670
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  CAAAACTGGCCTCATTGACTACAACCAGCTGGCACTGACTGCTCGACTTTTCCGGCCACGGCTCATCATAGCTG  660

Query  671  GCACCAGCGCCTATGCTCGCCTCATTGACTACGCCCGCATGAGAGAGGTGTGTGATGAAGTCAAAGCACACCTG  744
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GCACCAGCGCCTATGCTCGCCTCATTGACTACGCCCGCATGAGAGAGGTGTGTGATGAAGTCAAAGCACACCTG  734

Query  745  CTGGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAGGTGATTCCCTCGCCTTTCAAGCACGCGGACAT  818
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  CTGGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAGGTGATTCCCTCGCCTTTCAAGCACGCGGACAT  808

Query  819  CGTCACCACCACTACTCACAAGACTCTTCGAGGGGCCAGGTCAGGGCTCATCTTCTACCGGAAAGGGGTGAAGG  892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  CGTCACCACCACTACTCACAAGACTCTTCGAGGGGCCAGGTCAGGGCTCATCTTCTACCGGAAAGGGGTGAAGG  882

Query  893  CTGTGGACCCCAAGACTGGCCGGGAGATCCCTTACACATTTGAGGACCGAATCAACTTTGCCGTGTTCCCATCC  966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  CTGTGGACCCCAAGACTGGCCGGGAGATCCCTTACACATTTGAGGACCGAATCAACTTTGCCGTGTTCCCATCC  956

Query  967  CTGCAGGGGGGCCCCCACAATCATGCCATTGCTGCAGTAGCTGTGGCCCTAAAGCAGGCCTGCACCCCCATGTT  1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  CTGCAGGGGGGCCCCCACAATCATGCCATTGCTGCAGTAGCTGTGGCCCTAAAGCAGGCCTGCACCCCCATGTT  1030

Query 1041  CCGGGAGTACTCCCTGCAGGTTCTGAAGAATGCTCGGGCCATGGCAGATGCCCTGCTAGAGCGAGGCTACTCAC  1114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  CCGGGAGTACTCCCTGCAGGTTCTGAAGAATGCTCGGGCCATGGCAGATGCCCTGCTAGAGCGAGGCTACTCAC  1104

Query 1115  TGGTATCAGGTGGTACTGACAACCACCTGGTGCTGGTGGACCTGCGGCCCAAGGGCCTGGATGGAGCTCGGGCT  1188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  TGGTATCAGGTGGTACTGACAACCACCTGGTGCTGGTGGACCTGCGGCCCAAGGGCCTGGATGGAGCTCGGGCT  1178

Query 1189  GAGCGGGTGCTAGAGCTTGTATCCATCACTGCCAACAAGAACACCTGTCCTGGAGACCGAAGTGCCATCACACC  1262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  GAGCGGGTGCTAGAGCTTGTATCCATCACTGCCAACAAGAACACCTGTCCTGGAGACCGAAGTGCCATCACACC  1252

Query 1263  GGGCGGCCTGCGGCTTGGGGCCCCAGCCTTAACTTCTCGACAGTTCCGTGAGGATGACTTCCGGAGAGTTGTGG  1336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253  GGGCGGCCTGCGGCTTGGGGCCCCAGCCTTAACTTCTCGACAGTTCCGTGAGGATGACTTCCGGAGAGTTGTGG  1326

Query 1337  ACTTTATAGATGAAGGGGTCAACATTGGCTTAGAGGTGAAGAGCAAGACTGCCAAGCTCCAGGATTTCAAATCC  1410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  ACTTTATAGATGAAGGGGTCAACATTGGCTTAGAGGTGAAGAGCAAGACTGCCAAGCTCCAGGATTTCAAATCC  1400

Query 1411  TTCCTGCTTAAGGACTCAGAAACAAGTCAGCGTCTGGCCAACCTCAGGCAACGGGTGGAGCAGTTTGCCAGGGC  1484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401  TTCCTGCTTAAGGACTCAGAAACAAGTCAGCGTCTGGCCAACCTCAGGCAACGGGTGGAGCAGTTTGCCAGGGC  1474

Query 1485  CTTCCCCATGCCTGGTTTTGATGAGCAT----------------------------------------------  1512
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct 1475  CTTCCCCATGCCTGGTTTTGATGAGCATTGAAGGCACCTGGGAAATGAGGCCCACAGACTCAAAGTTACTCTCC  1548

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1549  TTCCCCCTACCTGGGCCAGTGAAATAGAAAGCCTTTCTATTTTTTGGTGCGGGAGGGAAGACCTCTCACTTAGG  1622

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1623  GCAAGAGCCAGGTATAGTCTCCCTTCCCAGAATTTGTAACTGAGAAGATCTTTTCTTTTTCCTTTTTTTGGTAA  1696

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1697  CAAGACTTAGAAGGAGGGCCCAGGCACTTTCTGTTTGAACCCCTGTCATGATCACAGTGTCAGAGACGCGTCCT  1770

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1771  CTTTCTTGGGGAAGTTGAGGAGTGCCCTTCAGAGCCAGTAGCAGGCAGGGGTGGGTAGGCACCCTCCTTCCTGT  1844

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1845  TTTTATCTAATAAAATGCTAACCTGCCCTGAGTTTCCATTACTGTGGGTGGGGTTCCCCTGGGCCAAACAGTGA  1918

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1919  TTTGTCTCCCTCAATGTGTACACCGCTCCGCTCCCACCACCGCTACCACAAGGACCCCCGGGGCTGCAGCCTCC  1992

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1993  TCTTTCTGTCTCTGATCAGAGCCGACACCAGACGTGATTAGCAGGCGCAGCAAATTCAATTTGTTAAATGAAAT  2066

Query 1513  -------------  1512
                         
Sbjct 2067  TGTATTTTGCCCA  2079