Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15588
• Subject: NR_029417.2
• Aligned Length: 2157
• Identities: 1432
• Gaps: 725

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------ATGCTG  6
                                                                                ||||||
Sbjct    1  CTTCTTCCGACAGCTTGCTGCCCTAGACCAGAGTTGGTGGCTGGACCTCCTGCGACTTCCGAGTTGCGATGCTG  74

Query    7  TACTTCTCTTTGTTTTGGGCGGCTCGGCCTCTGCAGAGATGTGGGCAGCTGGTCAGGATGGCCATTCGGGCTCA  80
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TACTTCTCTTTGTTTTGGGCGGCTCGGCCTCTGCAGAGATGTGGGCAGCTGGTCAGGATGGCCATTCGGGCTCA  148

Query   81  GCACAGCAACGCAGCCCAGACTCAGACTGGGGAAGCAAACAGGGGCTGGACAGGCCAGGAGAGCCTGTCGGACA  154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCACAGCAACGCAGCCCAGACTCAGACTGGGGAAGCAAACAGGGGCTGGACAGGCCAGGAGAGCCTGTCGGACA  222

Query  155  GTGATCCTGAGATGTGGGAGTTGCTGCAGAGGGAGAAGGACAGGCAGTGTCGTGGCCTGGAGCTCATTGCCTCA  228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  223  GTGATCCTGAGATGTGGGAGTTGCTGCAGAGGGAGAAGGACAGGCAGTGTCGTGGCCTGGAGCTCATTGCCTC-  295

Query  229  GAGAACTTCTGCAGCCGAGCTGCGCTGGAGGCCCTGGGGTCCTGTCTGAACAACAAGTACTCGGAGGGTTATCC  302
                                                                                      
Sbjct  296  --------------------------------------------------------------------------  295

Query  303  TGGCAAGAGATACTATGGGGGAGCAGAGGTGGTGGATGAAATTGAGCTGCTGTGCCAGCGCCGGGCCTTGGAAG  376
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  -----AGAGATACTATGGGGGAGCAGAGGTGGTGGATGAAATTGAGCTGCTGTGCCAGCGCCGGGCCTTGGAAG  364

Query  377  CCTTTGACCTGGATCCTGCACAGTGGGGAGTCAATGTCCAGCCCTACTCCGGGTCCCCAGCCAACCTGGCCGTC  450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  CCTTTGACCTGGATCCTGCACAGTGGGGAGTCAATGTCCAGCCCTACTCCGGGTCCCCAGCCAACCTGGCCGTC  438

Query  451  TACACAGCCCTTCTGCAACCTCACGACCGGATCATGGGGCTGGACCTGCCCGATGGGGGCCATCTCACCCACGG  524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  TACACAGCCCTTCTGCAACCTCACGACCGGATCATGGGGCTGGACCTGCCCGATGGGGGCCATCTCACCCACGG  512

Query  525  CTACATGTCTGACGTCAAGCGGATATCAGCCACGTCCATCTTCTTCGAGTCTATGCCCTATAAGCTCAACCCCA  598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  CTACATGTCTGACGTCAAGCGGATATCAGCCACGTCCATCTTCTTCGAGTCTATGCCCTATAAGCTCAACCCCA  586

Query  599  AAACTGGCCTCATTGACTACAACCAGCTGGCACTGACTGCTCGACTTTTCCGGCCACGGCTCATCATAGCTGGC  672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  AAACTGGCCTCATTGACTACAACCAGCTGGCACTGACTGCTCGACTTTTCCGGCCACGGCTCATCATAGCTGGC  660

Query  673  ACCAGCGCCTATGCTCGCCTCATTGACTACGCCCGCATGAGAGAGGTGTGTGATGAAGTCAAAGCACACCTGCT  746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  ACCAGCGCCTATGCTCGCCTCATTGACTACGCCCGCATGAGAGAGGTGTGTGATGAAGTCAAAGCACACCTGCT  734

Query  747  GGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAGGTGATTCCCTCGCCTTTCAAGCACGCGGACATCG  820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  GGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAGGTGATTCCCTCGCCTTTCAAGCACGCGGACATCG  808

Query  821  TCACCACCACTACTCACAAGACTCTTCGAGGGGCCAGGTCAGGGCTCATCTTCTACCGGAAAGGGGTGAAGGCT  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  TCACCACCACTACTCACAAGACTCTTCGAGGGGCCAGGTCAGGGCTCATCTTCTACCGGAAAGGGGTGAAGGCT  882

Query  895  GTGGACCCCAAGACTGGCCGGGAGATCCCTTACACATTTGAGGACCGAATCAACTTTGCCGTGTTCCCATCCCT  968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  GTGGACCCCAAGACTGGCCGGGAGATCCCTTACACATTTGAGGACCGAATCAACTTTGCCGTGTTCCCATCCCT  956

Query  969  GCAGGGGGGCCCCCACAATCATGCCATTGCTGCAGTAGCTGTGGCCCTAAAGCAGGCCTGCACCCCCATGTTCC  1042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  GCAGGGGGGCCCCCACAATCATGCCATTGCTGCAGTAGCTGTGGCCCTAAAGCAGGCCTGCACCCCCATGTTCC  1030

Query 1043  GGGAGTACTCCCTGCAGGTTCTGAAGAATGCTCGGGCCATGGCAGATGCCCTGCTAGAGCGAGGCTACTCACTG  1116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  GGGAGTACTCCCTGCAGGTTCTGAAGAATGCTCGGGCCATGGCAGATGCCCTGCTAGAGCGAGGCTACTCACTG  1104

Query 1117  GTATCAGGTGGTACTGACAACCACCTGGTGCTGGTGGACCTGCGGCCCAAGGGCCTGGATGGAGCTCGGGCTGA  1190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  GTATCAGGTGGTACTGACAACCACCTGGTGCTGGTGGACCTGCGGCCCAAGGGCCTGGATGGAGCTCGGGCTGA  1178

Query 1191  GCGGGTGCTAGAGCTTGTATCCATCACTGCCAACAAGAACACCTGTCCTGGAGACCGAAGTGCCATCACACCGG  1264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  GCGGGTGCTAGAGCTTGTATCCATCACTGCCAACAAGAACACCTGTCCTGGAGACCGAAGTGCCATCACACCGG  1252

Query 1265  GCGGCCTGCGGCTTGGGGCCCCAGCCTTAACTTCTCGACAGTTCCGTGAGGATGACTTCCGGAGAGTTGTGGAC  1338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253  GCGGCCTGCGGCTTGGGGCCCCAGCCTTAACTTCTCGACAGTTCCGTGAGGATGACTTCCGGAGAGTTGTGGAC  1326

Query 1339  TTTATAGATGAAGGGGTCAACATTGGCTTAGAGGTGAAGAGCAAGACTGCCAAGCTCCAGGATTTCAAATCCTT  1412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  TTTATAGATGAAGGGGTCAACATTGGCTTAGAGGTGAAGAGCAAGACTGCCAAGCTCCAGGATTTCAAATCCTT  1400

Query 1413  CCTGCTTAAGGACTCAGAAACAAGTCAGCGTCTGGCCAACCTCAGGCAACGGGTGGAGCAGTTTGCCAGGGCCT  1486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401  CCTGCTTAAGGACTCAGAAACAAGTCAGCGTCTGGCCAACCTCAGGCAACGGGTGGAGCAGTTTGCCAGGGCCT  1474

Query 1487  TCCCCATGCCTGGTTTTGATGAGCAT------------------------------------------------  1512
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct 1475  TCCCCATGCCTGGTTTTGATGAGCATTGAAGGCACCTGGGAAATGAGGCCCACAGACTCAAAGTTACTCTCCTT  1548

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1549  CCCCCTACCTGGGCCAGTGAAATAGAAAGCCTTTCTATTTTTTGGTGCGGGAGGGAAGACCTCTCACTTAGGGC  1622

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1623  AAGAGCCAGGTATAGTCTCCCTTCCCAGAATTTGTAACTGAGAAGATCTTTTCTTTTTCCTTTTTTTGGTAACA  1696

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1697  AGACTTAGAAGGAGGGCCCAGGCACTTTCTGTTTGAACCCCTGTCATGATCACAGTGTCAGAGACGCGTCCTCT  1770

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1771  TTCTTGGGGAAGTTGAGGAGTGCCCTTCAGAGCCAGTAGCAGGCAGGGGTGGGTAGGCACCCTCCTTCCTGTTT  1844

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1845  TTATCTAATAAAATGCTAACCTGCCCTGAGTTTCCATTACTGTGGGTGGGGTTCCCCTGGGCCAAACAGTGATT  1918

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1919  TGTCTCCCTCAATGTGTACACCGCTCCGCTCCCACCACCGCTACCACAAGGACCCCCGGGGCTGCAGCCTCCTC  1992

Query 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512
                                                                                      
Sbjct 1993  TTTCTGTCTCTGATCAGAGCCGACACCAGACGTGATTAGCAGGCGCAGCAAATTCAATTTGTTAAATGAAATTG  2066

Query 1513  -----------  1512
                       
Sbjct 2067  TATTTTGCCCA  2077