Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15588
• Subject: XM_011538676.3
• Aligned Length: 1540
• Identities: 1196
• Gaps: 344

Alignment

Query    1  ATGCTGTACTTCTCTTTGTTTTGGGCGGCTCGGCCTCTGCAGAGATGTGGGCAGCTGGTCAGGATGGCCATTCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGCTCAGCACAGCAACGCAGCCCAGACTCAGACTGGGGAAGCAAACAGGGGCTGGACAGGCCAGGAGAGCCTGT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CGGACAGTGATCCTGAGATGTGGGAGTTGCTGCAGAGGGAGAAGGACAGGCAGTGTCGTGGCCTGGAGCTCATT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCTCAGAGAACTTCTGCAGCCGAGCTGCGCTGGAGGCCCTGGGGTCCTGTCTGAACAACAAGTACTCGGAGGG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TTATCCTGGCAAGAGATACTATGGGGGAGCAGAGGTGGTGGATGAAATTGAGCTGCTGTGCCAGCGCCGGGCCT  370
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------ATGGGGGAGCAGAGGTGGTGGATGAAATTGAGCTGCTGTGCCAGCGCCGGGCCT  54

Query  371  TGGAAGCCTTTGACCTGGATCCTGCACAGTGGGGAGTCAATGTCCAGCCCTACTCCGGGTCCCCAGCCAACCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   55  TGGAAGCCTTTGACCTGGATCCTGCACAGTGGGGAGTCAATGTCCAGCCCTACTCCGGGTCCCCAGCCAACCTG  128

Query  445  GCCGTCTACACAGCCCTTCTGCAACCTCACGACCGGATCATGGGGCTGGACCTGCCCGATGGGGGCCATCTCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  129  GCCGTCTACACAGCCCTTCTGCAACCTCACGACCGGATCATGGGGCTGGACCTGCCCGATGGGGGCCATCTCAC  202

Query  519  CCACGGCTACATGTCTGACGTCAAGCGGATATCAGCCACGTCCATCTTCTTCGAGTCTATGCCCTATAAGCTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  203  CCACGGCTACATGTCTGACGTCAAGCGGATATCAGCCACGTCCATCTTCTTCGAGTCTATGCCCTATAAGCTCA  276

Query  593  AC----------------------------CCCAAAACTGGCCTCATTGACTACAACCAGCTGGCACTGACTGC  638
            ||                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277  ACGGCTTTAGCTGTTTGTGTGTCTGTCCAGCCCAAAACTGGCCTCATTGACTACAACCAGCTGGCACTGACTGC  350

Query  639  TCGACTTTTCCGGCCACGGCTCATCATAGCTGGCACCAGCGCCTATGCTCGCCTCATTGACTACGCCCGCATGA  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  351  TCGACTTTTCCGGCCACGGCTCATCATAGCTGGCACCAGCGCCTATGCTCGCCTCATTGACTACGCCCGCATGA  424

Query  713  GAGAGGTGTGTGATGAAGTCAAAGCACACCTGCTGGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAG  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425  GAGAGGTGTGTGATGAAGTCAAAGCACACCTGCTGGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAG  498

Query  787  GTGATTCCCTCGCCTTTCAAGCACGCGGACATCGTCACCACCACTACTCACAAGACTCTTCGAGGGGCCAGGTC  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  499  GTGATTCCCTCGCCTTTCAAGCACGCGGACATCGTCACCACCACTACTCACAAGACTCTTCGAGGGGCCAGGTC  572

Query  861  AGGGCTCATCTTCTACCGGAAAGGGGTGAAGGCTGTGGACCCCAAGACTGGCCGGGAGATCCCTTACACATTTG  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  573  AGGGCTCATCTTCTACCGGAAAGGGGTGAAGGCTGTGGACCCCAAGACTGGCCGGGAGATCCCTTACACATTTG  646

Query  935  AGGACCGAATCAACTTTGCCGTGTTCCCATCCCTGCAGGGGGGCCCCCACAATCATGCCATTGCTGCAGTAGCT  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  647  AGGACCGAATCAACTTTGCCGTGTTCCCATCCCTGCAGGGGGGCCCCCACAATCATGCCATTGCTGCAGTAGCT  720

Query 1009  GTGGCCCTAAAGCAGGCCTGCACCCCCATGTTCCGGGAGTACTCCCTGCAGGTTCTGAAGAATGCTCGGGCCAT  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  GTGGCCCTAAAGCAGGCCTGCACCCCCATGTTCCGGGAGTACTCCCTGCAGGTTCTGAAGAATGCTCGGGCCAT  794

Query 1083  GGCAGATGCCCTGCTAGAGCGAGGCTACTCACTGGTATCAGGTGGTACTGACAACCACCTGGTGCTGGTGGACC  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  795  GGCAGATGCCCTGCTAGAGCGAGGCTACTCACTGGTATCAGGTGGTACTGACAACCACCTGGTGCTGGTGGACC  868

Query 1157  TGCGGCCCAAGGGCCTGGATGGAGCTCGGGCTGAGCGGGTGCTAGAGCTTGTATCCATCACTGCCAACAAGAAC  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  869  TGCGGCCCAAGGGCCTGGATGGAGCTCGGGCTGAGCGGGTGCTAGAGCTTGTATCCATCACTGCCAACAAGAAC  942

Query 1231  ACCTGTCCTGGAGACCGAAGTGCCATCACACCGGGCGGCCTGCGGCTTGGGGCCCCAGCCTTAACTTCTCGACA  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  943  ACCTGTCCTGGAGACCGAAGTGCCATCACACCGGGCGGCCTGCGGCTTGGGGCCCCAGCCTTAACTTCTCGACA  1016

Query 1305  GTTCCGTGAGGATGACTTCCGGAGAGTTGTGGACTTTATAGATGAAGGGGTCAACATTGGCTTAGAGGTGAAGA  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017  GTTCCGTGAGGATGACTTCCGGAGAGTTGTGGACTTTATAGATGAAGGGGTCAACATTGGCTTAGAGGTGAAGA  1090

Query 1379  GCAAGACTGCCAAGCTCCAGGATTTCAAATCCTTCCTGCTTAAGGACTCAGAAACAAGTCAGCGTCTGGCCAAC  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091  GCAAGACTGCCAAGCTCCAGGATTTCAAATCCTTCCTGCTTAAGGACTCAGAAACAAGTCAGCGTCTGGCCAAC  1164

Query 1453  CTCAGGCAACGGGTGGAGCAGTTTGCCAGGGCCTTCCCCATGCCTGGTTTTGATGAGCAT  1512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1165  CTCAGGCAACGGGTGGAGCAGTTTGCCAGGGCCTTCCCCATGCCTGGTTTTGATGAGCAT  1224