Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15647
- Subject:
- NR_110145.1
- Aligned Length:
- 2134
- Identities:
- 1330
- Gaps:
- 790
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AAGAAGAAAAATGATGATAAAGTAAAAGGCCAGTAACTGGCAGCCACATGTTATGCAAACATTCTCCCCTCTGT 74
Query 1 ---------------------------------------------------ATGGTCACTTCCTCTTTTCCAAT 23
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAATACTACATGAATGTTATTTTTGCTTTCAGAAATCACTAAACCTTGGCCATGGTCACTTCCTCTTTTCCAAT 148
Query 24 CTCTGTGGCAGTTTTTGCCCTAATAACCCTGCAGGTTGGTACTCAGGACAGTTTTATAGCTGCAGTGTATGAAC 97
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTCTGTGGCAGTTTTTGCCCTAATAACCCTGCAGGTTGGTACTCAGGACAGTTTTATAGCTGCAGTGTATGAAC 222
Query 98 ATGCTGTCATTTTGCCAAATAAAACAGAAACACCAGTTTCTCAGGAGGATGCCTTGAATCTCATGAACGAGAAT 171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATGCTGTCATTTTGCCAAATAAAACAGAAACACCAGTTTCTCAGGAGGATGCCTTGAATCTCATGAACGAGAAT 296
Query 172 ATAGACATTCTGGAGACAGCGATCAAGCAGGCAGCTGAGCAGGGTGCTCGAATCATTGTGACTCCAGAAGATGC 245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATAGACATTCTGGAGACAGCGATCAAGCAGGCAGCTGAGCAGGGTGCTCGAATCATTGTGACTCCAGAAGATGC 370
Query 246 ACTTTATGGATGGAAATTTACCAGGGAAACTGTTTTCCCTTATCTGGAGGATATCCCAGACCCTCAGGTGAACT 319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACTTTATGGATGGAAATTTACCAGGGAAACTGTTTTCCCTTATCTGGAGGATATCCCAGACCCTCAGGTGAACT 444
Query 320 GGATTCCGTGTCAAGACCCCCACAGATTTGGTCACACACCAGTACAAGCAAGACTCAGCTGCCTGGCCAAGGAC 393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGATTCCGTGTCAAGACCCCCACAGATTTGGTCACACACCAGTACAAGCAAGACTCAGCTGCCTGGCCAAGGAC 518
Query 394 AACTCTATCTATGTCTTGGCAAATTTGGGGGACAAAAAGCCATGTAATTCCCGTGACTCCACGTGTCCTCCTAA 467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 519 AACTCTATCTATGTCTTGGCAAATTTGGGGGACAAAAAGCCATGTAATTCCCGTGACTCCACATGTCCTCCTAA 592
Query 468 TGGCTACTTTCAATACAATACCAATGTGGTGTATAATACAGAAGGAAAACTCGTGGCACGTTACCATAAGTACC 541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGCTACTTTCAATACAATACCAATGTGGTGTATAATACAGAAGGAAAACTCGTGGCACGTTACCATAAG---- 662
Query 542 ACCTGTACTCTGAGCCTCAGTTTAATGTCCCTGAAAAGCCGGAGTTGGTGACTTTCAACACCGCATTTGGAAGG 615
||.|| |||.|
Sbjct 663 -------------------------------------------GTGGG-------CAAGA-------------- 672
Query 616 TTTGGCATTTTCACGTGCTTTGATATATTCTTCTATGATCCTGGTGTTACCCTGGTGAAAGATTTCCATGTGGA 689
.|||| |||.||
Sbjct 673 ---------GTCAC------TGAGAT------------------------------------------------ 683
Query 690 CACCATACTGTTTCCCACAGCTTGGATGAACGTTTTGCCCCTTTTGACAGCTATTGAATTCCATTCAGCTTGGG 763
|||| ||||||| .|||| |||..||
Sbjct 684 -----TACT------------TTGGATG----------------GGACA-CTAAAGA----------------- 706
Query 764 CAATGGGA-ATGGGAGTTAATCTTCTTGTGGCCAACACACATCATGTCAGCCTAAATATGACAGGAAGTGGCAT 836
|.|| ||| ||||| |.||| |||.| .|.|||||||||||.||
Sbjct 707 ----GAGAGATG--------------------------ACATC-TCTCA-CCTGA--CTTACAGGAAGTGGTAT 746
Query 837 TTATGCACCAAATGGTCCCAAAGTGTATCATTATGACATGAAGACAGAGTTGGGAAAACTTCTCCTTTCAGAGG 910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 747 TTATGCACCAAATGGTCCCAAAGTGTATCATTATGACATGAAGACAGAGTTGGGAAAACTTCTCCTTTCAGAGG 820
Query 911 TGGATTCACATCCCCTATCCTCGCTTGCCTACCCAACAGCTGTTAATTGGAATGCCTACGCCACCACCATCAAA 984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 TGGATTCACATCCCCTATCCTCGCTTGCCTACCCAACAGCTGTTAATTGGAATGCCTACGCCACCACCATCAAA 894
Query 985 CCATTTCCAGTACAGAAAAACACTTTCAGGGGATTTATTTCCAGGGATGGGTTCAACTTCACAGAACTTTTTGA 1058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 CCATTTCCAGTACAGAAAAACACTTTCAGGGGATTTATTTCCAGGGATGGGTTCAACTTCACAGAACTTTTTGA 968
Query 1059 AAATGCAGGAAACCTTACAGTCTGTCAAAAGGAGCTTTGCTGTCATTTAAGCTACAGAATGTTACAAAAAGAAG 1132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 969 AAATGCAGGAAACCTTACAGTCTGTCAAAAGGAGCTTTGCTGTCATTTAAGCTACAGAATGTTACAAAAAGAAG 1042
Query 1133 AGAATGAAGTATACGTTCTAGGAGCTTTTACAGGATTACATGGCCGAAGGAGAAGAGAGTACTGGCAGGTCTGC 1206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043 AGAATGAAGTATACGTTCTAGGAGCTTTTACAGGATTACATGGCCGAAGGAGAAGAGAGTACTGGCAGGTCTGC 1116
Query 1207 ACAATGCTGAAGTGCAAAACTACTAATTTGACAACTTGTGGACGGCCAGTAGAAACTGCTTCTACAAGATTTGA 1280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117 ACAATGCTGAAGTGCAAAACTACTAATTTGACAACTTGTGGACGGCCAGTAGAAACTGCTTCTACAAGATTTGA 1190
Query 1281 AATGTTCTCCCTCAGTGGCACATTTGGAACAGAGTATGTTTTTCCTGAAGTGCTACTTACCGAAATTCATCTGT 1354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 AATGTTCTCCCTCAGTGGCACATTTGGAACAGAGTATGTTTTTCCTGAAGTGCTACTTACCGAAATTCATCTGT 1264
Query 1355 CACCTGGAAAATTTGAGGTGCTGAAAGATGGGCGTTTGGTAAACAAGAATGGATCATCTGGGCCTATACTAACA 1428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1265 CACCTGGAAAATTTGAGGTGCTGAAAGATGGGCGTTTGGTAAACAAGAATGGATCATCTGGGCCTATACTAACA 1338
Query 1429 GTGTCACTCTTTGGGAGGTGGTACACAAAGGACTCACTTTACAGCTCATGTGGGACCAGCAATTCAGCAATAAC 1502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1339 GTGTCACTCTTTGGGAGGTGGTACACAAAGGACTCACTTTACAGCTCATGTGGGACCAGCAATTCAGCAATAAC 1412
Query 1503 TTACCTGCTAATATTCATATTATTAATGATCATAGCTTTGCAAAATATTGTAATGTTA---------------- 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1413 TTACCTGCTAATATTCATATTATTAATGATCATAGCTTTGCAAAATATTGTAATGTTATAGGGCGTCTCTTTAT 1486
Query 1561 -------------------------------------------------------------------------- 1560
Sbjct 1487 CACTCAGCTTCTGCATCATATGCTTGGCTGAATGTGTTTATCGGCTTCCCAAGTTTACTAAGAAACTTTGAAGG 1560
Query 1561 -------------------------------------------------------------------------- 1560
Sbjct 1561 GCTATTTCAGTAGTATAGACCAGTGAGTCCTAAATATTTTTTCTCATCAATAATTATTTTTTAAGTATTATGAT 1634
Query 1561 -------------------------------------------------------------------------- 1560
Sbjct 1635 AATGTTGTCCATTTTTTTGGCTACTCTGAAATGTTGCAGTGTGGAACAATGGAAAGAGCCTGGGTGTTTGGGTC 1708
Query 1561 -------------------------------------------------------------------------- 1560
Sbjct 1709 AGATAAATGAAGATCAAACTCCAGCTCCAGCCTCATTTGCTTGAGACTTTGTGTGTATGGGGGACTTGTATGTA 1782
Query 1561 -------------------------------------------------------------------------- 1560
Sbjct 1783 TGGGAGTGAGGAGTTTCAGGGCCATTGCAAACATAGCTGTGCCCTTGAAGAGAATAGTAATGATGGGAATTTAG 1856
Query 1561 -------------------------------------------------------------- 1560
Sbjct 1857 AGGTTTATGACTGAATTCCCTTTGACATTAAAGACTATTTGAATTCAAAAAAAAAAAAAAAA 1918
