Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15665
• Subject: XM_006497401.1
• Aligned Length: 1086
• Identities: 725
• Gaps: 246

Alignment

Query    1  ------------------------------------ATGTCTTCCTTAAGTGGAAAAGTCCAAACCGTTTTGGG  38
                                                |||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||||
Sbjct    1  ATGAGTTCAAAGAAAATCCCTGAGACACTATCAGGAATGTCTTCCTTAAGTGGGAAAGTACAAACAGTTCTGGG  74

Query   39  CCTTGTAGAGCCAAGCAAACTGGGCCGTACCCTGACCCATGAACACCTGGCCATGACCTTTGACTGCTGTTACT  112
            |||||||||.||.|||.|||||||.||.|||||||||||.||.||.|||.|.||||||||||||.|.|.|||||
Sbjct   75  CCTTGTAGAACCCAGCCAACTGGGACGCACCCTGACCCACGAGCATCTGACAATGACCTTTGACAGTTTTTACT  148

Query  113  GTCCACCTCCCCCGTGCCAGGAAGCTATTTCCAAAGAACCTATCGTGATGAAAAATTTATATTGGATTCAGAAA  186
            |.||||||||.||.|||||.||||..|..|||||.|||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  149  GCCCACCTCCTCCATGCCACGAAGTCACCTCCAAGGAACCTATCATGATGAAAAATCTATTTTGGATTCAGAAA  222

Query  187  AACGCCTATTCCCATAAAGAAAACCTTCAATTAAATCAGGAGACAGAAGCCATAAAGGAAGAACTGTTGTATTT  260
            |||.|||||||||||..|||.||||||||.||.|||||||                                  
Sbjct  223  AACCCCTATTCCCATCGAGAGAACCTTCAGTTGAATCAGG----------------------------------  262

Query  261  TAAAGCTAATGGTGGAGGGGCTTTGGTGGAAAACACAACCACTGGGATTAGCCGAGACACACAGACGTTGAAGA  334
                                                                                      
Sbjct  263  --------------------------------------------------------------------------  262

Query  335  GGCTTGCAGAAGAGACTGGCGTCCATATCATATCTGGAGCCGGGTTTTATGTGGATGCAACTCACTCCTCAGAG  408
                                                                                      
Sbjct  263  --------------------------------------------------------------------------  262

Query  409  ACCAGGGCCATGTCAGTGGAGCAGCTTACCGATGTCCTTATGAATGAAATTCTCCATGGAGCTGATGGAACCAG  482
                                  |||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  263  ----------------------AGCTTACAGATGTCCTTATTAATGAAATTCTCCATGGAGCTGATGGCACCAG  314

Query  483  TATCAAGTGTGGCATTATTGGAGAAATTGGTTGCTCCTGGCCTTTGACTGAGAGTGAAAGAAAGGTTCTCCAGG  556
            .|||||||||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.||..|||
Sbjct  315  CATCAAGTGTGGAGTTATTGGAGAAATTGGCTGCTCCTGGCCTTTGACTGACAGCGAGAGAAAGATACTTGAGG  388

Query  557  CCACAGCTCATGCCCAGGCTCAGCTTGGTTGTCCTGTTATTATCCATCCTGGACGGAGCTCCAGG-GCACCATT  629
            |.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||.| ||||| ||||||||
Sbjct  389  CTACAGCTCACGCCCAGGCTCAGCTTGGCTGTCCTGTCATCATCCATCCTGGACGGAAC-CCAGGTGCACCATT  461

Query  630  CCAGATTATCCGAATATTGCAAGAAGCAGGCGCAGACATCTCCAAAACAGTCATGTCACACCTGGATAGGACTA  703
            ||||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct  462  CCAGATAATCCGTATACTGCAAGAAGCAGGAGCAGACATCTCCAAAACAGTCATGTCCCACCTTGACAGGACTA  535

Query  704  TTCTTGATAAGAAAGAGCTCTTGGAGTTTGCTCAGCTTGGCTGCTACTTGGAATATGATCTCTTTGGTACTGAA  777
            |..||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  536  TATTTGATAAGAAAGAGCTGCTGGAGTTTGCTCAACTTGGCTGCTACTTGGAATACGATCTCTTTGGTACGGAA  609

Query  778  CTACTTCATTACCAACTCGGCCCAGATATTGACATGCCTGATGATAACAAAAGAATTAGAAGGGTGCGTCTCCT  851
            ||.|||.|||||||..|..|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|.|.||
Sbjct  610  CTCCTTAATTACCAGTTGAGCCCAGATATTGATATGCCTGATGATAACAAAAGAATTAGAAGGGTCCATTTTCT  683

Query  852  GGTGGAAGAGGGCTGTGAAGATCGAATTCTGGTAGCACATGACATACATACGAAAACC--CGGCTGATGAAATA  923
            .|||||.|||||||.|||||||||.|||||..|.||||||||||||||.||  |||.|  |||.|||||||.||
Sbjct  684  AGTGGATGAGGGCTATGAAGATCGGATTCTCATGGCACATGACATACACAC--AAAGCATCGGTTGATGAAGTA  755

Query  924  TGGAGGTCACGGCTATTCTCATATACTCACCAATGTTGTTCCTAAAATGTTGCTGAGAGGCATAACTGAGAATG  997
            .||||||||||||||.||.||.||.||.|||||..||||||||||.|||.|.||.|||||..|.|||||||..|
Sbjct  756  CGGAGGTCACGGCTACTCACACATCCTTACCAACATTGTTCCTAAGATGCTCCTTAGAGGTCTGACTGAGAGGG  829

Query  998  TGCTTGATAAGATTCTAATAGAGAACCCTAAGCAATGGCTAACTTTCAAA  1047
            |||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  830  TGCTTGACAAGATACTCATAGAAAACCCTAAACAATGGCTGACTTTTAAA  879