Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15672
- Subject:
- NM_001242600.2
- Aligned Length:
- 1524
- Identities:
- 1506
- Gaps:
- 18
Alignment
Query 1 ATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCAATGCTTGAGGCTCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAGCAGTGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCAATGCTTGAGGCTCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAGCAGTGC 74
Query 75 CAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGGAAAAAAAGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAACGAAAGAGAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGGAAAAAAAGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAACGAAAGAGAA 148
Query 149 GCAAAAGTAAGGAACGGAAGCGAAGTAGAGACAGAGAAAGGAAAAAGAGCAAAAGCCGTGAAAGAAAGCGAAGT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAAAAGTAAGGAACGGAAGCGAAGTAGAGACAGAGAAAGGAAAAAGAGCAAAAGCCGTGAAAGAAAGCGAAGT 222
Query 223 AGAAGCAAAGAGAGGCGACGGAGCCGCTCAAGAAGTCGAGATCGAAGATTTAGAGGCCGCTACAGAAGTCCTTA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGAAGCAAAGAGAGGCGACGGAGCCGCTCAAGAAGTCGAGATCGAAGATTTAGAGGCCGCTACAGAAGTCCTTA 296
Query 297 CAGACGACGTTCCCGAAGCAAAAGTCCATTCAGAAAAGACAAGAGCCCTGTGAGAGAACCTATTGATAATTTAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGACGACGTTCCCGAAGCAAAAGTCCATTCAGAAAAGACAAGAGCCCTGTGAGAGAACCTATTGATAATTTAA 370
Query 371 CTCCTGAGGAAAGAGATGCAAGGACAGTCTTCTGTATGCAGCTGGCGGCAAGAATTCGACCAAGGGATTTGGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTCCTGAGGAAAGAGATGCAAGGACAGTCTTCTGTATGCAGCTGGCGGCAAGAATTCGACCAAGGGATTTGGAA 444
Query 445 GAGTTTTTCTCTACAGTAGGAAAGGTTCGAGATGTGAGGATGATTTCTGACAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGTTTTTCTCTACAGTAGGAAAGGTTCGAGATGTGAGGATGATTTCTGACAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGG 518
Query 519 AATTGCTTATGTGGAGTTCGTCGATGTTAGCTCAGTGCCTCTAGCAATAGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AATTGCTTATGTGGAGTTCGTCGATGTTAGCTCAGTGCCTCTAGCAATAGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAG 592
Query 593 GCGTGCCAATCATAGTACAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCAGCAATGGCAAACAATTTACAAAAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCGTGCCAATCATAGTACAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCAGCAATGGCAAACAATTTACAAAAG 666
Query 667 GGAAGTGCTGGACCTATGAGGCTTTATGTGGGCTCATTACACTTCAACATAACTGAAGATATGCTTCGTGGGAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGAAGTGCTGGACCTATGAGGCTTTATGTGGGCTCATTACACTTCAACATAACTGAAGATATGCTTCGTGGGAT 740
Query 741 CTTTGAGCCTTTTGGAAGAATTGAAAGTATCCAGCTGATGATGGACAGTGAAACTGGTCGATCCAAGGGATATG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTTTGAGCCTTTTGGAAGAATTGAAAGTATCCAGCTGATGATGGACAGTGAAACTGGTCGATCCAAGGGATATG 814
Query 815 GATTTATTACATTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTTAATGGATTTGAACTAGCAGGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GATTTATTACATTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTTAATGGATTTGAACTAGCAGGA 888
Query 889 AGACCAATGAAAGTTGGTCATGTTACTGAACGTACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGATGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGACCAATGAAAGTTGGTCATGTTACTGAACGTACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGATGA 962
Query 963 ACTGGAAAGGACTGGAATTGATTTGGGAACAACTGGTCGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCAGAGGGTACAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACTGGAAAGGACTGGAATTGATTTGGGAACAACTGGTCGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCAGAGGGTACAG 1036
Query 1037 GTTTGCAGATTCCGCCAGCAGCACAGCAAGCTCTACAGATGAGTGGCTCTTTGGCATTTGGTGCTGTGGCAGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTTTGCAGATTCCGCCAGCAGCACAGCAAGCTCTACAGATGAGTGGCTCTTTGGCATTTGGTGCTGTGGC---- 1106
Query 1111 TTCTCTTTTGTTATAGATTTGCAAACAAGACTTTCCCAGCAGACTGAAGCTTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCCTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107 --------------AGATTTGCAAACAAGACTTTCCCAGCAGACTGAAGCTTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCCTC 1166
Query 1185 TGTTCAGCCACTTGCAACACAATGTTTCCAACTCTCTAACATGTTTAACCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167 TGTTCAGCCACTTGCAACACAATGTTTCCAACTCTCTAACATGTTTAACCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGAT 1240
Query 1259 GGGATACCGAGATTAAGGATGATGTGATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTTATTCATATTTATGTTGAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241 GGGATACCGAGATTAAGGATGATGTGATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTTATTCATATTTATGTTGAC 1314
Query 1333 AAAAATTCAGCTCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCAATTGCTGCAGCTATTGCTGCTGTCAATGCATT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 AAAAATTCAGCTCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCAATTGCTGCAGCTATTGCTGCTGTCAATGCATT 1388
Query 1407 GCATGGCAGGTGGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCATATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTGTTTC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389 GCATGGCAGGTGGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCATATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTGTTTC 1462
Query 1481 CTGATTCTATGACAGCAACACAGCTACTGGTTCCAAGTAGACGA 1524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1463 CTGATTCTATGACAGCAACACAGCTACTGGTTCCAAGTAGACGA 1506