Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15672
• Subject: NM_001291114.1
• Aligned Length: 1590
• Identities: 1397
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCAATGCTTGAGGCTCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAGCAGTGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct    1  ATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCCATGCTTGAGGCCCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAACAGTGC  74

Query   75  CAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGGAAAAAAAGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAACGAAAGAGAA  148
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||
Sbjct   75  TAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGAAAAAAAAGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAGAGAAAAAGAA  148

Query  149  GCAAAAGTAAGGAACGGAAGCGAAGTAGAGACAGAGAAAGGAAAAAGAGCAAAAGCCGTGAAAGAAAGCGAAGT  222
            ||||||||||.||||||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||..|.||.||||||
Sbjct  149  GCAAAAGTAAAGAACGGAAAAGAAGTAGAGATAGAGAAAGGAAAAAGAGCAAAAGTCGAGAGCGGAAACGAAGT  222

Query  223  AGAAGCAAAGAGAGGCGACGGAGCCGCTCAAGAAGTCGAGATCGAAGATTTAGAGGCCGCTACAGAAGTCCTTA  296
            |||||||||||.|||.||||.|||||||||.|.|||||.|||.|||||||..|||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  AGAAGCAAAGAAAGGAGACGAAGCCGCTCACGCAGTCGGGATAGAAGATTCCGAGGCCGCTACAGAAGTCCCTA  296

Query  297  ------------------------------------------------------------------CAGACGAC  304
                                                                              ||||.|||
Sbjct  297  CTCCGGACCAAAATTTAACAGTGCCATCCGAGGAAAGATTGGATTGCCTCATAGCATCAAATTAAGCAGAAGAC  370

Query  305  GTTCCCGAAGCAAAAGTCCATTCAGAAAAGACAAGAGCCCTGTGAGAGAACCTATTGATAATTTAACTCCTGAG  378
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct  371  GTTCCCGAAGCAAAAGTCCATTTAGGAAAGACAAGAGCCCTGTGAGGGAACCTATTGATAATCTCACTCCTGAG  444

Query  379  GAAAGAGATGCAAGGACAGTCTTCTGTATGCAGCTGGCGGCAAGAATTCGACCAAGGGATTTGGAAGAGTTTTT  452
            |||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAGGGATGCAAGGACTGTTTTCTGCATGCAACTGGCAGCAAGAATTCGACCGAGAGATTTGGAAGAGTTTTT  518

Query  453  CTCTACAGTAGGAAAGGTTCGAGATGTGAGGATGATTTCTGACAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGGAATTGCTT  526
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CTCTACAGTTGGAAAGGTTCGAGATGTGAGAATGATTTCTGATAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGGAATTGCAT  592

Query  527  ATGTGGAGTTCGTCGATGTTAGCTCAGTGCCTCTAGCAATAGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAGGCGTGCCA  600
            |||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  593  ATGTGGAATTTGTTGATGTCAGTTCAGTGCCTCTAGCAATTGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAGGAGTGCCA  666

Query  601  ATCATAGTACAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCAGCAATGGCAAACAATTTACAAAAGGGAAGTGC  674
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCATAGTTCAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCTGCAATGGCAAACAATTTACAAAAGGGAAGTGC  740

Query  675  TGGACCTATGAGGCTTTATGTGGGCTCATTACACTTCAACATAACTGAAGATATGCTTCGTGGGATCTTTGAGC  748
            |||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  741  TGGACCTATGAGGCTCTATGTAGGCTCATTACACTTTAACATAACTGAAGACATGCTTCGGGGGATCTTTGAAC  814

Query  749  CTTTTGGAAGAATTGAAAGTATCCAGCTGATGATGGACAGTGAAACTGGTCGATCCAAGGGATATGGATTTATT  822
            ||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTTTGGAAGGATTGAAAGTATTCAGCTCATGATGGATAGTGAAACTGGCCGATCTAAGGGATATGGATTTATT  888

Query  823  ACATTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTTAATGGATTTGAACTAGCAGGAAGACCAAT  896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||.||.||||||||
Sbjct  889  ACATTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTGAATGGATTTGAGTTAGCTGGGAGACCAAT  962

Query  897  GAAAGTTGGTCATGTTACTGAACGTACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGATGAACTGGAAA  970
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  963  GAAAGTTGGTCACGTTACTGAACGAACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGACGAACTAGAAA  1036

Query  971  GGACTGGAATTGATTTGGGAACAACTGGTCGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCAGAGGGTACAGGTTTGCAG  1044
            |||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  GGACTGGAATTGACTTGGGAACAACTGGACGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCGGAGGGTACCGGTTTGCAG  1110

Query 1045  ATTCCGCCAGCAGCACAGCAAGCTCTACAGATGAGTGGCTCTTTGGCATTTGGTGCTGTGGCAGAATTCTCTTT  1118
            |||||.||.||.|||||.|||||..||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||            
Sbjct 1111  ATTCCACCTGCCGCACAACAAGCATTACAAATGAGTGGCTCTCTGGCATTTGGTGCTGTGGC------------  1172

Query 1119  TGTTATAGATTTGCAAACAAGACTTTCCCAGCAGACTGAAGCTTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCCTCTGTTCAGC  1192
                  |||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1173  ------AGATTTGCAAACACGACTTTCCCAACAGACCGAAGCCTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCGTCTGTTCAAC  1240

Query 1193  CACTTGCAACACAATGTTTCCAACTCTCTAACATGTTTAACCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGATGGGATACC  1266
            |.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1241  CTCTTGCAACACAGTGTTTCCAACTTTCTAACATGTTTAATCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGATGGGATACA  1314

Query 1267  GAGATTAAGGATGATGTGATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTTATTCATATTTATGTTGACAAAAATTC  1340
            ||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1315  GAGATTAAAGATGATGTCATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTCATTCATATTTATGTTGATAAAAATTC  1388

Query 1341  AGCTCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCAATTGCTGCAGCTATTGCTGCTGTCAATGCATTGCATGGCA  1414
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389  AGCTCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCTATTGCTGCGGCTATTGCTGCTGTCAATGCATTGCATGGCA  1462

Query 1415  GGTGGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCATATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTGTTTCCTGATTCT  1488
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1463  GATGGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCGTATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTCTTTCCTGATTCT  1536

Query 1489  ATGACAGCAACACAGCTACTGGTTCCAAGTAGACGA  1524
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1537  ATGACAGCAACACAACTACTGGTTCCAAGTAGACGA  1572