Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15672
• Subject: NM_001323424.2
• Aligned Length: 1587
• Identities: 1524
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCAATGCTTGAGGCTCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAGCAGTGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCAATGCTTGAGGCTCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAGCAGTGC  74

Query   75  CAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGGAAAAAAAGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAACGAAAGAGAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGGAAAAAAAGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAACGAAAGAGAA  148

Query  149  GCAAAAGTAAGGAACGGAAGCGAAGTAGAGACAGAGAAAGGAAAAAGAGCAAAAGCCGTGAAAGAAAGCGAAGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAAAGTAAGGAACGGAAGCGAAGTAGAGACAGAGAAAGGAAAAAGAGCAAAAGCCGTGAAAGAAAGCGAAGT  222

Query  223  AGAAGCAAAGAGAGGCGACGGAGCCGCTCAAGAAGTCGAGATCGAAGATTTAGAGGCCGCTACAGAAGTCCTTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAAGCAAAGAGAGGCGACGGAGCCGCTCAAGAAGTCGAGATCGAAGATTTAGAGGCCGCTACAGAAGTCCTTA  296

Query  297  C---------------------------------------------------------------AGACGACGTT  307
            |                                                               ||||||||||
Sbjct  297  CTCCGGACCAAAATTTAACAGTGCCATCCGAGGAAAGATTGGGTTGCCTCATAGCATCAAATTAAGACGACGTT  370

Query  308  CCCGAAGCAAAAGTCCATTCAGAAAAGACAAGAGCCCTGTGAGAGAACCTATTGATAATTTAACTCCTGAGGAA  381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCGAAGCAAAAGTCCATTCAGAAAAGACAAGAGCCCTGTGAGAGAACCTATTGATAATTTAACTCCTGAGGAA  444

Query  382  AGAGATGCAAGGACAGTCTTCTGTATGCAGCTGGCGGCAAGAATTCGACCAAGGGATTTGGAAGAGTTTTTCTC  455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGAGATGCAAGGACAGTCTTCTGTATGCAGCTGGCGGCAAGAATTCGACCAAGGGATTTGGAAGAGTTTTTCTC  518

Query  456  TACAGTAGGAAAGGTTCGAGATGTGAGGATGATTTCTGACAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGGAATTGCTTATG  529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TACAGTAGGAAAGGTTCGAGATGTGAGGATGATTTCTGACAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGGAATTGCTTATG  592

Query  530  TGGAGTTCGTCGATGTTAGCTCAGTGCCTCTAGCAATAGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAGGCGTGCCAATC  603
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGAGTTCGTCGATGTTAGCTCAGTGCCTCTAGCAATAGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAGGCGTGCCAATC  666

Query  604  ATAGTACAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCAGCAATGGCAAACAATTTACAAAAGGGAAGTGCTGG  677
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATAGTACAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCAGCAATGGCAAACAATTTACAAAAGGGAAGTGCTGG  740

Query  678  ACCTATGAGGCTTTATGTGGGCTCATTACACTTCAACATAACTGAAGATATGCTTCGTGGGATCTTTGAGCCTT  751
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACCTATGAGGCTTTATGTGGGCTCATTACACTTCAACATAACTGAAGATATGCTTCGTGGGATCTTTGAGCCTT  814

Query  752  TTGGAAGAATTGAAAGTATCCAGCTGATGATGGACAGTGAAACTGGTCGATCCAAGGGATATGGATTTATTACA  825
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGGAAGAATTGAAAGTATCCAGCTGATGATGGACAGTGAAACTGGTCGATCCAAGGGATATGGATTTATTACA  888

Query  826  TTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTTAATGGATTTGAACTAGCAGGAAGACCAATGAA  899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTTAATGGATTTGAACTAGCAGGAAGACCAATGAA  962

Query  900  AGTTGGTCATGTTACTGAACGTACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGATGAACTGGAAAGGA  973
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTTGGTCATGTTACTGAACGTACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGATGAACTGGAAAGGA  1036

Query  974  CTGGAATTGATTTGGGAACAACTGGTCGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCAGAGGGTACAGGTTTGCAGATT  1047
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGGAATTGATTTGGGAACAACTGGTCGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCAGAGGGTACAGGTTTGCAGATT  1110

Query 1048  CCGCCAGCAGCACAGCAAGCTCTACAGATGAGTGGCTCTTTGGCATTTGGTGCTGTGGCAGAATTCTCTTTTGT  1121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCGCCAGCAGCACAGCAAGCTCTACAGATGAGTGGCTCTTTGGCATTTGGTGCTGTGGCAGAATTCTCTTTTGT  1184

Query 1122  TATAGATTTGCAAACAAGACTTTCCCAGCAGACTGAAGCTTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCCTCTGTTCAGCCAC  1195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TATAGATTTGCAAACAAGACTTTCCCAGCAGACTGAAGCTTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCCTCTGTTCAGCCAC  1258

Query 1196  TTGCAACACAATGTTTCCAACTCTCTAACATGTTTAACCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGATGGGATACCGAG  1269
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTGCAACACAATGTTTCCAACTCTCTAACATGTTTAACCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGATGGGATACCGAG  1332

Query 1270  ATTAAGGATGATGTGATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTTATTCATATTTATGTTGACAAAAATTCAGC  1343
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTAAGGATGATGTGATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTTATTCATATTTATGTTGACAAAAATTCAGC  1406

Query 1344  TCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCAATTGCTGCAGCTATTGCTGCTGTCAATGCATTGCATGGCAGGT  1417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCAATTGCTGCAGCTATTGCTGCTGTCAATGCATTGCATGGCAGGT  1480

Query 1418  GGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCATATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTGTTTCCTGATTCTATG  1491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCATATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTGTTTCCTGATTCTATG  1554

Query 1492  ACAGCAACACAGCTACTGGTTCCAAGTAGACGA  1524
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACAGCAACACAGCTACTGGTTCCAAGTAGACGA  1587