Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15672
• Subject: XM_006498832.3
• Aligned Length: 1587
• Identities: 1415
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCAATGCTTGAGGCTCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAGCAGTGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct    1  ATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCCATGCTTGAGGCCCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAACAGTGC  74

Query   75  CAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGGAAAAAAAGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAACGAAAGAGAA  148
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||
Sbjct   75  TAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGAAAAAAAAGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAGAGAAAAAGAA  148

Query  149  GCAAAAGTAAGGAACGGAAGCGAAGTAGAGACAGAGAAAGGAAAAAGAGCAAAAGCCGTGAAAGAAAGCGAAGT  222
            ||||||||||.||||||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||..|.||.||||||
Sbjct  149  GCAAAAGTAAAGAACGGAAAAGAAGTAGAGATAGAGAAAGGAAAAAGAGCAAAAGTCGAGAGCGGAAACGAAGT  222

Query  223  AGAAGCAAAGAGAGGCGACGGAGCCGCTCAAGAAGTCGAGATCGAAGATTTAGAGGCCGCTACAGAAGTCCTTA  296
            |||||||||||.|||.||||.|||||||||.|.|||||.|||.|||||||..|||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  AGAAGCAAAGAAAGGAGACGAAGCCGCTCACGCAGTCGGGATAGAAGATTCCGAGGCCGCTACAGAAGTCCCTA  296

Query  297  C---------------------------------------------------------------AGACGACGTT  307
            |                                                               |||.||||||
Sbjct  297  CTCCGGACCAAAATTTAACAGTGCCATCCGAGGAAAGATTGGATTGCCTCATAGCATCAAATTAAGAAGACGTT  370

Query  308  CCCGAAGCAAAAGTCCATTCAGAAAAGACAAGAGCCCTGTGAGAGAACCTATTGATAATTTAACTCCTGAGGAA  381
            |||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct  371  CCCGAAGCAAAAGTCCATTTAGGAAAGACAAGAGCCCTGTGAGGGAACCTATTGATAATCTCACTCCTGAGGAA  444

Query  382  AGAGATGCAAGGACAGTCTTCTGTATGCAGCTGGCGGCAAGAATTCGACCAAGGGATTTGGAAGAGTTTTTCTC  455
            ||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGGATGCAAGGACTGTTTTCTGCATGCAACTGGCAGCAAGAATTCGACCGAGAGATTTGGAAGAGTTTTTCTC  518

Query  456  TACAGTAGGAAAGGTTCGAGATGTGAGGATGATTTCTGACAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGGAATTGCTTATG  529
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  TACAGTTGGAAAGGTTCGAGATGTGAGAATGATTTCTGATAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGGAATTGCATATG  592

Query  530  TGGAGTTCGTCGATGTTAGCTCAGTGCCTCTAGCAATAGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAGGCGTGCCAATC  603
            ||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  593  TGGAATTTGTTGATGTCAGTTCAGTGCCTCTAGCAATTGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAGGAGTGCCAATC  666

Query  604  ATAGTACAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCAGCAATGGCAAACAATTTACAAAAGGGAAGTGCTGG  677
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATAGTTCAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCTGCAATGGCAAACAATTTACAAAAGGGAAGTGCTGG  740

Query  678  ACCTATGAGGCTTTATGTGGGCTCATTACACTTCAACATAACTGAAGATATGCTTCGTGGGATCTTTGAGCCTT  751
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  741  ACCTATGAGGCTCTATGTAGGCTCATTACACTTTAACATAACTGAAGACATGCTTCGGGGGATCTTTGAACCTT  814

Query  752  TTGGAAGAATTGAAAGTATCCAGCTGATGATGGACAGTGAAACTGGTCGATCCAAGGGATATGGATTTATTACA  825
            |||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGGAAGGATTGAAAGTATTCAGCTCATGATGGATAGTGAAACTGGCCGATCTAAGGGATATGGATTTATTACA  888

Query  826  TTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTTAATGGATTTGAACTAGCAGGAAGACCAATGAA  899
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||.||.|||||||||||
Sbjct  889  TTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTGAATGGATTTGAGTTAGCTGGGAGACCAATGAA  962

Query  900  AGTTGGTCATGTTACTGAACGTACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGATGAACTGGAAAGGA  973
            |||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  963  AGTTGGTCACGTTACTGAACGAACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGACGAACTAGAAAGGA  1036

Query  974  CTGGAATTGATTTGGGAACAACTGGTCGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCAGAGGGTACAGGTTTGCAGATT  1047
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037  CTGGAATTGACTTGGGAACAACTGGACGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCGGAGGGTACCGGTTTGCAGATT  1110

Query 1048  CCGCCAGCAGCACAGCAAGCTCTACAGATGAGTGGCTCTTTGGCATTTGGTGCTGTGGCAGAATTCTCTTTTGT  1121
            ||.||.||.|||||.|||||..||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCACCTGCCGCACAACAAGCATTACAAATGAGTGGCTCTCTGGCATTTGGTGCTGTGGCAGAATTCTCTTTTGT  1184

Query 1122  TATAGATTTGCAAACAAGACTTTCCCAGCAGACTGAAGCTTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCCTCTGTTCAGCCAC  1195
            ||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 1185  TATAGATTTGCAAACACGACTTTCCCAACAGACCGAAGCCTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCGTCTGTTCAACCTC  1258

Query 1196  TTGCAACACAATGTTTCCAACTCTCTAACATGTTTAACCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGATGGGATACCGAG  1269
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259  TTGCAACACAGTGTTTCCAACTTTCTAACATGTTTAATCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGATGGGATACAGAG  1332

Query 1270  ATTAAGGATGATGTGATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTTATTCATATTTATGTTGACAAAAATTCAGC  1343
            |||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  ATTAAAGATGATGTCATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTCATTCATATTTATGTTGATAAAAATTCAGC  1406

Query 1344  TCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCAATTGCTGCAGCTATTGCTGCTGTCAATGCATTGCATGGCAGGT  1417
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1407  TCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCTATTGCTGCGGCTATTGCTGCTGTCAATGCATTGCATGGCAGAT  1480

Query 1418  GGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCATATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTGTTTCCTGATTCTATG  1491
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1481  GGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCGTATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTCTTTCCTGATTCTATG  1554

Query 1492  ACAGCAACACAGCTACTGGTTCCAAGTAGACGA  1524
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACAGCAACACAACTACTGGTTCCAAGTAGACGA  1587