Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15672
• Subject: XM_006498849.3
• Aligned Length: 1524
• Identities: 1048
• Gaps: 405

Alignment

Query    1  ATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCAATGCTTGAGGCTCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAGCAGTGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGGAAAAAAAGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAACGAAAGAGAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCAAAAGTAAGGAACGGAAGCGAAGTAGAGACAGAGAAAGGAAAAAGAGCAAAAGCCGTGAAAGAAAGCGAAGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGAAGCAAAGAGAGGCGACGGAGCCGCTCAAGAAGTCGAGATCGAAGATTTAGAGGCCGCTACAGAAGTCCTTA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAGACGACGTTCCCGAAGCAAAAGTCCATTCAGAAAAGACAAGAGCCCTGTGAGAGAACCTATTGATAATTTAA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CTCCTGAGGAAAGAGATGCAAGGACAGTCTTCTGTATGCAGCTGGCGGCAAGAATTCGACCAAGGGATTTGGAA  444
                                               |||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------ATGCAACTGGCAGCAAGAATTCGACCGAGAGATTTGGAA  39

Query  445  GAGTTTTTCTCTACAGTAGGAAAGGTTCGAGATGTGAGGATGATTTCTGACAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGG  518
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct   40  GAGTTTTTCTCTACAGTTGGAAAGGTTCGAGATGTGAGAATGATTTCTGATAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGG  113

Query  519  AATTGCTTATGTGGAGTTCGTCGATGTTAGCTCAGTGCCTCTAGCAATAGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAG  592
            ||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  114  AATTGCATATGTGGAATTTGTTGATGTCAGTTCAGTGCCTCTAGCAATTGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAG  187

Query  593  GCGTGCCAATCATAGTACAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCAGCAATGGCAAACAATTTACAAAAG  666
            |.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  188  GAGTGCCAATCATAGTTCAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCTGCAATGGCAAACAATTTACAAAAG  261

Query  667  GGAAGTGCTGGACCTATGAGGCTTTATGTGGGCTCATTACACTTCAACATAACTGAAGATATGCTTCGTGGGAT  740
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  262  GGAAGTGCTGGACCTATGAGGCTCTATGTAGGCTCATTACACTTTAACATAACTGAAGACATGCTTCGGGGGAT  335

Query  741  CTTTGAGCCTTTTGGAAGAATTGAAAGTATCCAGCTGATGATGGACAGTGAAACTGGTCGATCCAAGGGATATG  814
            ||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  336  CTTTGAACCTTTTGGAAGGATTGAAAGTATTCAGCTCATGATGGATAGTGAAACTGGCCGATCTAAGGGATATG  409

Query  815  GATTTATTACATTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTTAATGGATTTGAACTAGCAGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||.||.
Sbjct  410  GATTTATTACATTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTGAATGGATTTGAGTTAGCTGGG  483

Query  889  AGACCAATGAAAGTTGGTCATGTTACTGAACGTACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGATGA  962
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  484  AGACCAATGAAAGTTGGTCACGTTACTGAACGAACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGACGA  557

Query  963  ACTGGAAAGGACTGGAATTGATTTGGGAACAACTGGTCGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCAGAGGGTACAG  1036
            |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  558  ACTAGAAAGGACTGGAATTGACTTGGGAACAACTGGACGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCGGAGGGTACCG  631

Query 1037  GTTTGCAGATTCCGCCAGCAGCACAGCAAGCTCTACAGATGAGTGGCTCTTTGGCATTTGGTGCTGTGGCAGAA  1110
            |||||||||||||.||.||.|||||.|||||..||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  632  GTTTGCAGATTCCACCTGCCGCACAACAAGCATTACAAATGAGTGGCTCTCTGGCATTTGGTGCTGTGGCAGAA  705

Query 1111  TTCTCTTTTGTTATAGATTTGCAAACAAGACTTTCCCAGCAGACTGAAGCTTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCCTC  1184
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  706  TTCTCTTTTGTTATAGATTTGCAAACACGACTTTCCCAACAGACCGAAGCCTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCGTC  779

Query 1185  TGTTCAGCCACTTGCAACACAATGTTTCCAACTCTCTAACATGTTTAACCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGAT  1258
            ||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780  TGTTCAACCTCTTGCAACACAGTGTTTCCAACTTTCTAACATGTTTAATCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGAT  853

Query 1259  GGGATACCGAGATTAAGGATGATGTGATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTTATTCATATTTATGTTGAC  1332
            |||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  854  GGGATACAGAGATTAAAGATGATGTCATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTCATTCATATTTATGTTGAT  927

Query 1333  AAAAATTCAGCTCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCAATTGCTGCAGCTATTGCTGCTGTCAATGCATT  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  928  AAAAATTCAGCTCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCTATTGCTGCGGCTATTGCTGCTGTCAATGCATT  1001

Query 1407  GCATGGCAGGTGGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCATATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTGTTTC  1480
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1002  GCATGGCAGATGGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCGTATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTCTTTC  1075

Query 1481  CTGATTCTATGACAGCAACACAGCTACTGGTTCCAAGTAGACGA  1524
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1076  CTGATTCTATGACAGCAACACAACTACTGGTTCCAAGTAGACGA  1119