Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15672
- Subject:
- XM_011239327.2
- Aligned Length:
- 1524
- Identities:
- 1030
- Gaps:
- 423
Alignment
Query 1 ATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCAATGCTTGAGGCTCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAGCAGTGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGGAAAAAAAGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAACGAAAGAGAA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GCAAAAGTAAGGAACGGAAGCGAAGTAGAGACAGAGAAAGGAAAAAGAGCAAAAGCCGTGAAAGAAAGCGAAGT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AGAAGCAAAGAGAGGCGACGGAGCCGCTCAAGAAGTCGAGATCGAAGATTTAGAGGCCGCTACAGAAGTCCTTA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CAGACGACGTTCCCGAAGCAAAAGTCCATTCAGAAAAGACAAGAGCCCTGTGAGAGAACCTATTGATAATTTAA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CTCCTGAGGAAAGAGATGCAAGGACAGTCTTCTGTATGCAGCTGGCGGCAAGAATTCGACCAAGGGATTTGGAA 444
|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------ATGCAACTGGCAGCAAGAATTCGACCGAGAGATTTGGAA 39
Query 445 GAGTTTTTCTCTACAGTAGGAAAGGTTCGAGATGTGAGGATGATTTCTGACAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGG 518
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 40 GAGTTTTTCTCTACAGTTGGAAAGGTTCGAGATGTGAGAATGATTTCTGATAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGG 113
Query 519 AATTGCTTATGTGGAGTTCGTCGATGTTAGCTCAGTGCCTCTAGCAATAGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAG 592
||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 114 AATTGCATATGTGGAATTTGTTGATGTCAGTTCAGTGCCTCTAGCAATTGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAG 187
Query 593 GCGTGCCAATCATAGTACAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCAGCAATGGCAAACAATTTACAAAAG 666
|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 GAGTGCCAATCATAGTTCAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCTGCAATGGCAAACAATTTACAAAAG 261
Query 667 GGAAGTGCTGGACCTATGAGGCTTTATGTGGGCTCATTACACTTCAACATAACTGAAGATATGCTTCGTGGGAT 740
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 262 GGAAGTGCTGGACCTATGAGGCTCTATGTAGGCTCATTACACTTTAACATAACTGAAGACATGCTTCGGGGGAT 335
Query 741 CTTTGAGCCTTTTGGAAGAATTGAAAGTATCCAGCTGATGATGGACAGTGAAACTGGTCGATCCAAGGGATATG 814
||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 336 CTTTGAACCTTTTGGAAGGATTGAAAGTATTCAGCTCATGATGGATAGTGAAACTGGCCGATCTAAGGGATATG 409
Query 815 GATTTATTACATTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTTAATGGATTTGAACTAGCAGGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||.||.
Sbjct 410 GATTTATTACATTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTGAATGGATTTGAGTTAGCTGGG 483
Query 889 AGACCAATGAAAGTTGGTCATGTTACTGAACGTACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGATGA 962
||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 484 AGACCAATGAAAGTTGGTCACGTTACTGAACGAACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGACGA 557
Query 963 ACTGGAAAGGACTGGAATTGATTTGGGAACAACTGGTCGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCAGAGGGTACAG 1036
|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 558 ACTAGAAAGGACTGGAATTGACTTGGGAACAACTGGACGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCGGAGGGTACCG 631
Query 1037 GTTTGCAGATTCCGCCAGCAGCACAGCAAGCTCTACAGATGAGTGGCTCTTTGGCATTTGGTGCTGTGGCAGAA 1110
|||||||||||||.||.||.|||||.|||||..||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 632 GTTTGCAGATTCCACCTGCCGCACAACAAGCATTACAAATGAGTGGCTCTCTGGCATTTGGTGCTGTGGC---- 701
Query 1111 TTCTCTTTTGTTATAGATTTGCAAACAAGACTTTCCCAGCAGACTGAAGCTTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCCTC 1184
|||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 702 --------------AGATTTGCAAACACGACTTTCCCAACAGACCGAAGCCTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCGTC 761
Query 1185 TGTTCAGCCACTTGCAACACAATGTTTCCAACTCTCTAACATGTTTAACCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGAT 1258
||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 TGTTCAACCTCTTGCAACACAGTGTTTCCAACTTTCTAACATGTTTAATCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGAT 835
Query 1259 GGGATACCGAGATTAAGGATGATGTGATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTTATTCATATTTATGTTGAC 1332
|||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 836 GGGATACAGAGATTAAAGATGATGTCATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTCATTCATATTTATGTTGAT 909
Query 1333 AAAAATTCAGCTCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCAATTGCTGCAGCTATTGCTGCTGTCAATGCATT 1406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 910 AAAAATTCAGCTCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCTATTGCTGCGGCTATTGCTGCTGTCAATGCATT 983
Query 1407 GCATGGCAGGTGGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCATATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTGTTTC 1480
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 984 GCATGGCAGATGGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCGTATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTCTTTC 1057
Query 1481 CTGATTCTATGACAGCAACACAGCTACTGGTTCCAAGTAGACGA 1524
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1058 CTGATTCTATGACAGCAACACAACTACTGGTTCCAAGTAGACGA 1101