Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15672
- Subject:
- XM_017315976.1
- Aligned Length:
- 1524
- Identities:
- 1048
- Gaps:
- 405
Alignment
Query 1 ATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCAATGCTTGAGGCTCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAGCAGTGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGGAAAAAAAGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAACGAAAGAGAA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GCAAAAGTAAGGAACGGAAGCGAAGTAGAGACAGAGAAAGGAAAAAGAGCAAAAGCCGTGAAAGAAAGCGAAGT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AGAAGCAAAGAGAGGCGACGGAGCCGCTCAAGAAGTCGAGATCGAAGATTTAGAGGCCGCTACAGAAGTCCTTA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CAGACGACGTTCCCGAAGCAAAAGTCCATTCAGAAAAGACAAGAGCCCTGTGAGAGAACCTATTGATAATTTAA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CTCCTGAGGAAAGAGATGCAAGGACAGTCTTCTGTATGCAGCTGGCGGCAAGAATTCGACCAAGGGATTTGGAA 444
|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------ATGCAACTGGCAGCAAGAATTCGACCGAGAGATTTGGAA 39
Query 445 GAGTTTTTCTCTACAGTAGGAAAGGTTCGAGATGTGAGGATGATTTCTGACAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGG 518
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 40 GAGTTTTTCTCTACAGTTGGAAAGGTTCGAGATGTGAGAATGATTTCTGATAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGG 113
Query 519 AATTGCTTATGTGGAGTTCGTCGATGTTAGCTCAGTGCCTCTAGCAATAGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAG 592
||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 114 AATTGCATATGTGGAATTTGTTGATGTCAGTTCAGTGCCTCTAGCAATTGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAG 187
Query 593 GCGTGCCAATCATAGTACAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCAGCAATGGCAAACAATTTACAAAAG 666
|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 GAGTGCCAATCATAGTTCAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCTGCAATGGCAAACAATTTACAAAAG 261
Query 667 GGAAGTGCTGGACCTATGAGGCTTTATGTGGGCTCATTACACTTCAACATAACTGAAGATATGCTTCGTGGGAT 740
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 262 GGAAGTGCTGGACCTATGAGGCTCTATGTAGGCTCATTACACTTTAACATAACTGAAGACATGCTTCGGGGGAT 335
Query 741 CTTTGAGCCTTTTGGAAGAATTGAAAGTATCCAGCTGATGATGGACAGTGAAACTGGTCGATCCAAGGGATATG 814
||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 336 CTTTGAACCTTTTGGAAGGATTGAAAGTATTCAGCTCATGATGGATAGTGAAACTGGCCGATCTAAGGGATATG 409
Query 815 GATTTATTACATTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTTAATGGATTTGAACTAGCAGGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||.||.
Sbjct 410 GATTTATTACATTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTGAATGGATTTGAGTTAGCTGGG 483
Query 889 AGACCAATGAAAGTTGGTCATGTTACTGAACGTACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGATGA 962
||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 484 AGACCAATGAAAGTTGGTCACGTTACTGAACGAACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGACGA 557
Query 963 ACTGGAAAGGACTGGAATTGATTTGGGAACAACTGGTCGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCAGAGGGTACAG 1036
|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 558 ACTAGAAAGGACTGGAATTGACTTGGGAACAACTGGACGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCGGAGGGTACCG 631
Query 1037 GTTTGCAGATTCCGCCAGCAGCACAGCAAGCTCTACAGATGAGTGGCTCTTTGGCATTTGGTGCTGTGGCAGAA 1110
|||||||||||||.||.||.|||||.|||||..||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 632 GTTTGCAGATTCCACCTGCCGCACAACAAGCATTACAAATGAGTGGCTCTCTGGCATTTGGTGCTGTGGCAGAA 705
Query 1111 TTCTCTTTTGTTATAGATTTGCAAACAAGACTTTCCCAGCAGACTGAAGCTTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCCTC 1184
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 706 TTCTCTTTTGTTATAGATTTGCAAACACGACTTTCCCAACAGACCGAAGCCTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCGTC 779
Query 1185 TGTTCAGCCACTTGCAACACAATGTTTCCAACTCTCTAACATGTTTAACCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGAT 1258
||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 TGTTCAACCTCTTGCAACACAGTGTTTCCAACTTTCTAACATGTTTAATCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGAT 853
Query 1259 GGGATACCGAGATTAAGGATGATGTGATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTTATTCATATTTATGTTGAC 1332
|||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 854 GGGATACAGAGATTAAAGATGATGTCATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTCATTCATATTTATGTTGAT 927
Query 1333 AAAAATTCAGCTCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCAATTGCTGCAGCTATTGCTGCTGTCAATGCATT 1406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 928 AAAAATTCAGCTCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCTATTGCTGCGGCTATTGCTGCTGTCAATGCATT 1001
Query 1407 GCATGGCAGGTGGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCATATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTGTTTC 1480
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1002 GCATGGCAGATGGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCGTATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTCTTTC 1075
Query 1481 CTGATTCTATGACAGCAACACAGCTACTGGTTCCAAGTAGACGA 1524
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 CTGATTCTATGACAGCAACACAACTACTGGTTCCAAGTAGACGA 1119