Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15672
- Subject:
- XR_001754439.2
- Aligned Length:
- 2201
- Identities:
- 1521
- Gaps:
- 677
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTGTGCTGGTGAATGTGAGTACAGGGAAGCAGCGGCCGCCATTTCAGGGAGCTTGTCGACGCTGTCGCAGGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GTGGATCCTGAGCTGCCGAAGCCGCCGTCCTGCTCTCCCGCGTGGGCTTCTCTAATTCCATTGTTTTTTTTAGA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TTCTCTCGGGCCTAGCCGTCCTTGGAACCCGATATTCGGGCTGGGCGGTTCCGCGGCCTGGGCCTAGGGGCTTA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ACAGTAGCAACAGAAGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAATCTCTTCCCGAACACGAGCACC 296
Query 1 -------------------------------------ATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCAATGCTTGAGG 37
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACAGGCGCCCGAAGGCCGGAACAGGCGTTTAGAGAAAATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCAATGCTTGAGG 370
Query 38 CTCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAGCAGTGCCAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGGAAAAAA 111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAGCAGTGCCAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGGAAAAAA 444
Query 112 AGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAACGAAAGAGAAGCAAAAGTAAGGAACGGAAGCGAAGTAGAGACAGAGA 185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAACGAAAGAGAAGCAAAAGTAAGGAACGGAAGCGAAGTAGAGACAGAGA 518
Query 186 AAGGAAAAAGAGCAAAAGCCGTGAAAGAAAGCGAAGTAGAAGCAAAGAGAGGCGACGGAGCCGCTCAAGAAGTC 259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAGGAAAAAGAGCAAAAGCCGTGAAAGAAAGCGAAGTAGAAGCAAAGAGAGGCGACGGAGCCGCTCAAGAAGTC 592
Query 260 GAGATCGAAGATTTAGAGGCCGCTACAGAAGTCCTTA------------------------------------- 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGATCGAAGATTTAGAGGCCGCTACAGAAGTCCTTACTCCGGACCAAAATTTAACAGTGCCATCCGAGGAAAG 666
Query 297 -----------------------------CAGACGACGTTCCCGAAGCAAAAGTCCATTCAGAAAAGACAAGAG 341
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATTGGGTTGCCTCATAGCATCAAATTAAGCAGACGACGTTCCCGAAGCAAAAGTCCATTCAGAAAAGACAAGAG 740
Query 342 CCCTGTGAGAGAACCTATTGATAATTTAACTCCTGAGGAAAGAGATGCAAGGACAGTCTTCTGTATGCAGCTGG 415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCCTGTGAGAGAACCTATTGATAATTTAACTCCTGAGGAAAGAGATGCAAGGACAGTCTTCTGTATGCAGCTGG 814
Query 416 CGGCAAGAATTCGACCAAGGGATTTGGAAGAGTTTTTCTCTACAGTAGGAAAGGTTCGAGATGTGAGGATGATT 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CGGCAAGAATTCGACCAAGGGATTTGGAAGAGTTTTTCTCTACAGTAGGAAAGGTTCGAGATGTGAGGATGATT 888
Query 490 TCTGACAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGGAATTGCTTATGTGGAGTTCGTCGATGTTAGCTCAGTGCCTCTAGC 563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCTGACAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGGAATTGCTTATGTGGAGTTCGTCGATGTTAGCTCAGTGCCTCTAGC 962
Query 564 AATAGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAGGCGTGCCAATCATAGTACAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAG 637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AATAGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAGGCGTGCCAATCATAGTACAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAG 1036
Query 638 CTGCAGCAATGGCAAACAATTTACAAAAGGGAAGTGCTGGACCTATGAGGCTTTATGTGGGCTCATTACACTTC 711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGCAGCAATGGCAAACAATTTACAAAAGGGAAGTGCTGGACCTATGAGGCTTTATGTGGGCTCATTACACTTC 1110
Query 712 AACATAACTGAAGATATGCTTCGTGGGATCTTTGAGCCTTTTGGAAGAATTGAAAGTATCCAGCTGATGATGGA 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AACATAACTGAAGATATGCTTCGTGGGATCTTTGAGCCTTTTGGAAGAATTGAAAGTATCCAGCTGATGATGGA 1184
Query 786 CAGTGAAACTGGTCGATCCAAGGGATATGGATTTATTACATTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGG 859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGTGAAACTGGTCGATCCAAGGGATATGGATTTATTACATTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGG 1258
Query 860 AACAACTTAATGGATTTGAACTAGCAGGAAGACCAATGAAAGTTGGTCATGTTACTGAACGTACTGATGCTTCG 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AACAACTTAATGGATTTGAACTAGCAGGAAGACCAATGAAAGTTGGTCATGTTACTGAACGTACTGATGCTTCG 1332
Query 934 AGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGATGAACTGGAAAGGACTGGAATTGATTTGGGAACAACTGGTCGTCTTCA 1007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGATGAACTGGAAAGGACTGGAATTGATTTGGGAACAACTGGTCGTCTTCA 1406
Query 1008 GTTAATGGCAAGACTTGCAGAGGGTACAGGTTTGCAGATTCCGCCAGCAGCACAGCAAGCTCTACAGATGAGTG 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GTTAATGGCAAGACTTGCAGAGGGTACAGGTTTGCAGATTCCGCCAGCAGCACAGCAAGCTCTACAGATGAGTG 1480
Query 1082 GCTCTTTGGCATTTGGTGCTGTGGCAG-------------AATTCTCTTTT----------------------- 1119
||||||||||||||||||||||||||| ||||||.||.|
Sbjct 1481 GCTCTTTGGCATTTGGTGCTGTGGCAGGAAAAAAAAGACAAATTCTGTTATTATTTAAAGTTTATTGACACTGT 1554
Query 1120 ---------------------------------------GTTA------------------------------- 1123
||||
Sbjct 1555 TCACATGGTCCTATCTTCAAGTTCCTTCAGTATACACCAGTTACATTTCTTCAGCTCCCTGAGATGCCAATTTT 1628
Query 1124 --------------TAGATTTGCAAACAAGACTTTCCCAGCAGACTGAAGCTTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCCT 1183
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GAGCACCTAGGACCCAGATTTGCAAACAAGACTTTCCCAGCAGACTGAAGCTTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCCT 1702
Query 1184 CTGTTCAGCCACTTGCAACACAATGTTTCCAACTCTCTAACATGTTTAACCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGA 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CTGTTCAGCCACTTGCAACACAATGTTTCCAACTCTCTAACATGTTTAACCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGA 1776
Query 1258 TGGGATACCGAGATTAAGGATGATGTGATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTTATTCATATTTATGTTGA 1331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGGGATACCGAGATTAAGGATGATGTGATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTTATTCATATTTATGTTGA 1850
Query 1332 CAAAAATTCAGCTCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCAATTGCTGCAGCTATTGCTGCTGTCAATGCAT 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAAAAATTCAGCTCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCAATTGCTGCAGCTATTGCTGCTGTCAATGCAT 1924
Query 1406 TGCATGGCAGGTGGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCATATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTGTTT 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGCATGGCAGGTGGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCATATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTGTTT 1998
Query 1480 CCTGATTCTATGACAGCAACACAGCTACTGGTTCCAAGTAGACGA----------------------------- 1524
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCTGATTCTATGACAGCAACACAGCTACTGGTTCCAAGTAGACGATGAAGGAAGATATAGTCCCTTATGTATAT 2072
Query 1525 -------------------------------------------------------------------------- 1524
Sbjct 2073 AGCTTTTTTTCTTTCTTGAGAATTCATCTTGAGTTATCTTTTATTTAGATAAAAATAAAGAGGCAAGGATCTAC 2146
Query 1525 ------------------------------------------------------- 1524
Sbjct 2147 TGTCATTTGTATGCAATTTCCTGTTACCTTGAAAAAATAAAAATGTTAACAGGAA 2201