Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15707
- Subject:
- NM_006001.3
- Aligned Length:
- 1353
- Identities:
- 1147
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTG 74
|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGCGTGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCAGGAGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG 74
Query 75 CCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATGGCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGACTCCTTCA 148
|||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 75 CCTGGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAGATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGTGGGGACGACTCCTTCA 148
Query 149 ACACCTTCTTCAGTGAGACGGGCGCTGGCAAGCACGTGCCCCGGGCTGTGTTTGTAGACTTGGAACCCACAGTC 222
||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.||.||||||||.|||.||||.|||||.||.
Sbjct 149 ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG 222
Query 223 ATTGATGAAGTTCGCACTGGCACCTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAGCTCATCACAGGCAAGGAAGATGC 296
.|.||||||||.|||||.||.|||||..|.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 223 GTCGATGAAGTGCGCACAGGAACCTATAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC 296
Query 297 TGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCTTGTGTTGGACCGAATTCGCA 370
.||||||||.||.|||.||||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.||..|||||||.||.||||
Sbjct 297 GGCCAATAATTACGCCAGAGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATCGTCGACCTGGTCCTGGACCGGATCCGCA 370
Query 371 AGCTGGCTGACCAGTGCACCGGTCTTCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGAACTGGTTCTGGG 444
|.|||||.||.|.||||||.||.||.|||||||||.|..|.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 371 AACTGGCGGATCTGTGCACGGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGTTTTGGGGGTGGCACTGGCTCTGGG 444
Query 445 TTCACCTCCCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTATGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAGTTCTCCATTTACCC 518
|||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||..||||||||||
Sbjct 445 TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAATTTGCCATTTACCC 518
Query 519 GGCACCCCAGGTTTCCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACCCTGGAGCACT 592
.||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 519 AGCCCCCCAGGTCTCCACGGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACATT 592
Query 593 CTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGACATCTGTCGTAGAAACCTCGATATCGAGCGCCCA 666
||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.||||||||.||.
Sbjct 593 CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATCGAGCGTCCC 666
Query 667 ACCTACACTAACCTTAACCGCCTTATTAGCCAGATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATTTGATGGAGC 740
||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||.||.||
Sbjct 667 ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGACGGGGC 740
Query 741 CCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGCCCTACCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACAT 814
|||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 741 CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT 814
Query 815 ATGCCCCTGTCATCTCTGCTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTTCTGTAGCAGAGATCACCAATGCTTGCTTT 888
|.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 815 ACGCCCCGGTCATCTCAGCCGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCCGTGGCTGAGATCACCAATGCCTGCTTC 888
Query 889 GAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTAAATACATGGCTTGCTGCCTGTTGTACCGTGG 962
|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||.||||||||.|.||
Sbjct 889 GAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG 962
Query 963 TGACGTGGTTCCCAAAGATGTCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAAACCAAGCGCAGCATCCAGTTTGTGGATT 1036
.||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 963 GGATGTGGTCCCGAAAGATGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTAGATT 1036
Query 1037 GGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATCAACTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGTGGAGACCTGGCCAAG 1110
|||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 GGTGCCCAACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACGGTGGTCCCTGGGGGAGACCTGGCCAAG 1110
Query 1111 GTACAGAGAGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACAGCCATTGCTGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAAGTT 1184
||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 GTGCAGCGGGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATCGCGGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCATAAGTT 1184
Query 1185 TGACCTGATGTATGCCAAGCGTGCCTTTGTTCACTGGTACGTGGGTGAGGGGATGGAGGAAGGCGAGTTTTCAG 1258
.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1185 CGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGAGAAGGCATGGAGGAGGGGGAGTTCTCTG 1258
Query 1259 AGGCCCGTGAAGATATGGCTGCCCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGTGTGGATTCTGTTGAAGGAGAGGGT 1332
|||||||.||.||..||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||..||||.|
Sbjct 1259 AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCCGAGGCT 1332
Query 1333 GAGGAAGAAGGAGAGGAATAC 1353
||||||||.||.||||||
Sbjct 1333 ---GAAGAAGGTGAAGAATAC 1350