Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15730
• Subject: NM_001166114.2
• Aligned Length: 1367
• Identities: 1316
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ----------------------------------------MEAPLQTGMVLGVMIGAGVAVVVTAVLILLVVRR  34
                                                    ...|. ...|||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MGTSSHGLATNSSGAKVAERDGFQDVLAPGEGSAGRICGAQPVPF-VPQVLGVMIGAGVAVVVTAVLILLVVRR  73

Query   35  LRVPKTPAPDGPRYRFRKRDKVLFYGRKIMRKVSQSTSSLVDTSVSATSRPRMRKKLKMLNIAKKILRIQKETP  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  LRVPKTPAPDGPRYRFRKRDKVLFYGRKIMRKVSQSTSSLVDTSVSATSRPRMRKKLKMLNIAKKILRIQKETP  147

Query  109  TLQRKEPPPAVLEADLTEGDLANSHLPSEVLYMLKNVRVLGHFEKPLFLELCRHMVFQRLGQGDYVFRPGQPDA  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  TLQRKEPPPAVLEADLTEGDLANSHLPSEVLYMLKNVRVLGHFEKPLFLELCRHMVFQRLGQGDYVFRPGQPDA  221

Query  183  SIYVVQDGLLELCLPGPDGKECVVKEVVPGDSVNSLLSILDVITGHQHPQRTVSARAARDSTVLRLPVEAFSAV  256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  SIYVVQDGLLELCLPGPDGKECVVKEVVPGDSVNSLLSILDVITGHQHPQRTVSARAARDSTVLRLPVEAFSAV  295

Query  257  FTKYPESLVRVVQIIMVRLQRVTFLALHNYLGLTNELFSHEIQPLRLFPSPGLPTRTSPVRGSKRMVSTSATDE  330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  FTKYPESLVRVVQIIMVRLQRVTFLALHNYLGLTNELFSHEIQPLRLFPSPGLPTRTSPVRGSKRMVSTSATDE  369

Query  331  PRETPGRPPDPTGAPLPGPTGDPVKPTSLETPSPPLLSRCVSMPGDISGLQGGPRSDFDMAYERGRISVSLQEE  404
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  PRETPGRPPDPTGAPLPGPTGDPVKPTSLETPSAPLLSRCVSMPGDISGLQGGPRSDFDMAYERGRISVSLQEE  443

Query  405  ASGGSLAAPARTPTQEPREQPAGACEYSYCEDESATGGCPFGPYQGRQTSSIFEAAKQELAKLMRIEDPSLLNS  478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  ASGGSLAAPARTPTQEPREQPAGACEYSYCEDESATGGCPFGPYQGRQTSSIFEAAKQELAKLMRIEDPSLLNS  517

Query  479  RVLLHHAKAGTIIARQGDQDVSLHFVLWGCLHVYQRMIDKAEDVCLFVAQPGELVGQLAVLTGEPLIFTLRAQR  552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  RVLLHHAKAGTIIARQGDQDVSLHFVLWGCLHVYQRMIDKAEDVCLFVAQPGELVGQLAVLTGEPLIFTLRAQR  591

Query  553  DCTFLRISKSDFYEIMRAQPSVVLSAAHTVAARMSPFVRQMDFAIDWTAVEAGRALYRQGDRSDCTYIVLNGRL  626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  DCTFLRISKSDFYEIMRAQPSVVLSAAHTVAARMSPFVRQMDFAIDWTAVEAGRALYRQGDRSDCTYIVLNGRL  665

Query  627  RSVIQRGSGKKELVGEYGRGDLIGVVEALTRQPRATTVHAVRDTELAKLPEGTLGHIKRRYPQVVTRLIHLLSQ  700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  RSVIQRGSGKKELVGEYGRGDLIGVVEALTRQPRATTVHAVRDTELAKLPEGTLGHIKRRYPQVVTRLIHLLSQ  739

Query  701  KILGNLQQLQGPFPAGSGLGVPPHSELTNPASNLATVAILPVCAEVPMVAFTLELQHALQAIGPTLLLNSDIIR  774
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  KILGNLQQLQGPFP-GSGLGVPPHSELTNPASNLATVAILPVCAEVPMVAFTLELQHALQAIGPTLLLNSDIIR  812

Query  775  ARLGASALDSIQEFRLSGWLAQQEDAHRIVLYQTDASLTPWTVRCLRQADCILIVGLGDQEPTLGQLEQMLENT  848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  ARLGASALDSIQEFRLSGWLAQQEDAHRIVLYQTDASLTPWTVRCLRQADCILIVGLGDQEPTLGQLEQMLENT  886

Query  849  AVRALKQLVLLHREEGAGPTRTVEWLNMRSWCSGHLHLRCPRRLFSRRSPAKLHELYEKVFSRRADRHSDFSRL  922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  AVRALKQLVLLHREEGAGPTRTVEWLNMRSWCSGHLHLRCPRRLFSRRSPAKLHELYEKVFSRRADRHSDFSRL  960

Query  923  ARVLTGNTIALVLGGGGARGCSHIGVLKALEEAGVPVDLVGGTSIGSFIGALYAEERSASRTRQRAREWAKSMT  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  961  ARVLTGNTIALVLGGGGARGCSHIGVLKALEEAGVPVDLVGGTSIGSFIGALYAEERSASRTKQRAREWAKSMT  1034

Query  997  SVLEPVLDLTYPVTSMFTGSAFNRSIHRVFQDKQIEDLWLPYFNVTTDITASAMRVHKDGSLWRYVRASMTLSG  1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  SVLEPVLDLTYPVTSMFTGSAFNRSIHRVFQDKQIEDLWLPYFNVTTDITASAMRVHKDGSLWRYVRASMTLSG  1108

Query 1071  YLPPLCDPKDGHLLMDGGYINNLPADIARSMGAKTVIAIDVGSQDETDLSTYGDSLSGWWLLWKRLNPWADKVK  1144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  YLPPLCDPKDGHLLMDGGYINNLPADIARSMGAKTVIAIDVGSQDETDLSTYGDSLSGWWLLWKRLNPWADKVK  1182

Query 1145  VPDMAEIQSRLAYVSCVRQLEVVKSSSYCEYLRPPIDCFKTMDFGKFDQIYDVGYQYGKAVFGGWSRGNVIEKM  1218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  VPDMAEIQSRLAYVSCVRQLEVVKSSSYCEYLRPPIDCFKTMDFGKFDQIYDVGYQYGKAVFGGWSRGNVIEKM  1256

Query 1219  LTDRRSTDLNESRRADVLAFPSSGFTDLAEIVSRIEPPTSYVSDGCADGEESDCLTEYEEDAGPDCSRDEGGSP  1292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  LTDRRSTDLNESRRADVLAFPSSGFTDLAEIVSRIEPPTSYVSDGCADGEESDCLTEYEEDAGPDCSRDEGGSP  1330

Query 1293  EGASPSTASEMEEEKSILRQRRCLPQEPPGSATDA  1327
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  EGASPSTASEMEEEKSILRQRRCLPQEPPGSATDA  1365