Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15774
• Subject: NM_001199811.1
• Aligned Length: 2844
• Identities: 2843
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGTCAAACTCAACTAAGTCTTTCCTGGCAGATGCCGGCTATGGCGAACAGGAACTGGATGCCAACTCTGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCAAACTCAACTAAGTCTTTCCTGGCAGATGCCGGCTATGGCGAACAGGAACTGGATGCCAACTCTGC  74

Query   75  CCTTATGGAATTGGACAAAGGCCTAAGATCTGGCAAACTTGGTGAACAGTGTGAAGCAGTTGTTCGCTTTCCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTTATGGAATTGGACAAAGGCCTAAGATCTGGCAAACTTGGTGAACAGTGTGAAGCAGTTGTTCGCTTTCCCA  148

Query  149  GACTTTTTCAGAAGTATCCATTCCCTATTCTTATCAATTCTGCATTCCTAAAGTTAGCTGATGTTTTCAGAGTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GACTTTTTCAGAAGTATCCATTCCCTATTCTTATCAATTCTGCATTCCTAAAGTTAGCTGATGTTTTCAGAGTT  222

Query  223  GGAAATAATTTCCTGAGGCTATGTGTTCTTAAAGTTACCCAACAAAGTGAGAAACATTTGGAGAAGATTCTAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGAAATAATTTCCTGAGGCTATGTGTTCTTAAAGTTACCCAACAAAGTGAGAAACATTTGGAGAAGATTCTAAA  296

Query  297  TGTGGATGAATTTGTGAAGAGAATTTTTTCTGTGATTCATAGTAATGATCCTGTGGCAAGAGCCATCACCCTCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTGGATGAATTTGTGAAGAGAATTTTTTCTGTGATTCATAGTAATGATCCTGTGGCAAGAGCCATCACCCTCC  370

Query  371  GGATGTTGGGAAGTCTGGCATCAATAATTCCTGAGAGGAAGAATGCTCATCATAGTATTCGTCAGAGTTTAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGATGTTGGGAAGTCTGGCATCAATAATTCCTGAGAGGAAGAATGCTCATCATAGTATTCGTCAGAGTTTAGAT  444

Query  445  TCACATGATAATGTAGAAGTTGAAGCTGCTGTTTTTGCTGCTGCAAACTTCTCTGCACAGTCAAAGGATTTTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCACATGATAATGTAGAAGTTGAAGCTGCTGTTTTTGCTGCTGCAAACTTCTCTGCACAGTCAAAGGATTTTGC  518

Query  519  TGTAGGAATCTGTAACAAAATCAGTGAAATGATTCAAGGTTTAGCGACACCAGTAGACTTGAAGCTAAAATTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTAGGAATCTGTAACAAAATCAGTGAAATGATTCAAGGTTTAGCGACACCAGTAGACTTGAAGCTAAAATTGA  592

Query  593  TACCCATTCTACAGCACATGCACCATGATGCAATCTTGGCTTCCAGTGCTCGTCAGCTTTTACAACAGCTGGTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TACCCATTCTACAGCACATGCACCATGATGCAATCTTGGCTTCCAGTGCTCGTCAGCTTTTACAACAGCTGGTC  666

Query  667  ACATCCTATCCGTCCACCAAAATGGTGATTGTGTCTTTGCACACTTTCACTCTGCTTGCAGCGTCATCTTTGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACATCCTATCCGTCCACCAAAATGGTGATTGTGTCTTTGCACACTTTCACTCTGCTTGCAGCGTCATCTTTGGT  740

Query  741  TGATACACCTAAGCAGATTCAGCTTCTGTTGCAGTATTTGAAGAATGATCCCAGGAAGGCAGTAAAGAGACTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATACACCTAAGCAGATTCAGCTTCTGTTGCAGTATTTGAAGAATGATCCCAGGAAGGCAGTAAAGAGACTTG  814

Query  815  CTATTCAAGATCTGAAATTACTTGCTAATAAAACACCACATACTTGGAGTAGGGAGAATATTCAGGCACTTTGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTATTCAAGATCTGAAATTACTTGCTAATAAAACACCACATACTTGGAGTAGGGAGAATATTCAGGCACTTTGT  888

Query  889  GAGTGTGCCCTCCAGACTCCTTATGACAGCTTAAAACTAGGGATGTTGTCTGTCCTTTCCACACTATCAGGGAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGTGTGCCCTCCAGACTCCTTATGACAGCTTAAAACTAGGGATGTTGTCTGTCCTTTCCACACTATCAGGGAC  962

Query  963  CATCGCCATCAAACATTACTTCAGTATAGTTCCAGGAAATGTGAGTTCTTCTCCCAGATCTTCTGATTTAGTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATCGCCATCAAACATTACTTCAGTATAGTTCCAGGAAATGTGAGTTCTTCTCCCAGATCTTCTGATTTAGTCA  1036

Query 1037  AATTAGCCCAAGAGTGCTGTTACCATAATAACAGGGGCATTGCAGCTCATGGAGTTAGAGTCCTAACTAATATA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AATTAGCCCAAGAGTGCTGTTACCATAATAACAGGGGCATTGCAGCTCATGGAGTTAGAGTCCTAACTAATATA  1110

Query 1111  ACTGTTTCTTGTCAAGAAAAGGATCTTTTGGCACTGGAACAAGATGCTGTCTTTGGCCTGGAATCCCTACTGGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTGTTTCTTGTCAAGAAAAGGATCTTTTGGCACTGGAACAAGATGCTGTCTTTGGCCTGGAATCCCTACTGGT  1184

Query 1185  ACTTTGTAGTCAAGATGATAGTCCAGGTGCTCAGGCCACTTTAAAGATTGCTCTAAACTGTATGGTGAAGTTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACTTTGTAGTCAAGATGATAGTCCAGGTGCTCAGGCCACTTTAAAGATTGCTCTAAACTGTATGGTGAAGTTGG  1258

Query 1259  CCAAGGGCAGGCCCCGTCTTAGCCAGTCAGTAGTTGAGACCTTGTTGACTCAATTGCACAGTGCTCAAGACGCT  1332
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCAAGGGCAGGCCCCATCTTAGCCAGTCAGTAGTTGAGACCTTGTTGACTCAATTGCACAGTGCTCAAGACGCT  1332

Query 1333  GCCCGGATTTTGATGTGCCATTGCCTGGCAGCCATTGCCATGCAACTGCCGGTGCTGGGTGATGGGATGCTTGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCCGGATTTTGATGTGCCATTGCCTGGCAGCCATTGCCATGCAACTGCCGGTGCTGGGTGATGGGATGCTTGG  1406

Query 1407  TGACCTCATGGAGCTGTACAAGGTGATTGGACGATCAGCCACAGACAAGCAACAAGAACTTCTGGTGAGTTTGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGACCTCATGGAGCTGTACAAGGTGATTGGACGATCAGCCACAGACAAGCAACAAGAACTTCTGGTGAGTTTGG  1480

Query 1481  CTACTGTGATTTTTGTTGCAAGTCAGAAGGCATTGTCTGTGGAAAGTAAGGCAGTAATTAAGCAGCAGCTTGAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTACTGTGATTTTTGTTGCAAGTCAGAAGGCATTGTCTGTGGAAAGTAAGGCAGTAATTAAGCAGCAGCTTGAA  1554

Query 1555  AGTGTCTCCAATGGATGGACTGTATACCGTATTGCCAGACAGGCTTCCAGAATGGGTAATCATGACATGGCCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGTGTCTCCAATGGATGGACTGTATACCGTATTGCCAGACAGGCTTCCAGAATGGGTAATCATGACATGGCCAA  1628

Query 1629  AGAGCTTTATCAGAGTTTGCTGACTCAGGTTGCCTCAGAACATTTCTACTTCTGGCTAAATAGTTTGAAGGAGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGAGCTTTATCAGAGTTTGCTGACTCAGGTTGCCTCAGAACATTTCTACTTCTGGCTAAATAGTTTGAAGGAGT  1702

Query 1703  TTTCACATGCAGAACAGTGTCTCACTGGGTTGCAAGAGGAAAATTATAGTTCAGCACTTTCTTGCATTGCTGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTTCACATGCAGAACAGTGTCTCACTGGGTTGCAAGAGGAAAATTATAGTTCAGCACTTTCTTGCATTGCTGAA  1776

Query 1777  TCTTTAAAATTCTATCACAAAGGGATTGCTTCCTTAACAGCAGCTAGTACACCACTGAATCCTTTAAGCTTTCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCTTTAAAATTCTATCACAAAGGGATTGCTTCCTTAACAGCAGCTAGTACACCACTGAATCCTTTAAGCTTTCA  1850

Query 1851  GTGTGAATTTGTAAAACTCAGGATTGACCTTTTACAAGCCTTCTCTCAACTTATCTGTACTTGTAATAGCCTGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTGTGAATTTGTAAAACTCAGGATTGACCTTTTACAAGCCTTCTCTCAACTTATCTGTACTTGTAATAGCCTGA  1924

Query 1925  AGACAAGCCCACCACCTGCAATTGCCACAACAATTGCCATGACCTTAGGAAATGACCTCCAGAGGTGTGGTCGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGACAAGCCCACCACCTGCAATTGCCACAACAATTGCCATGACCTTAGGAAATGACCTCCAGAGGTGTGGTCGC  1998

Query 1999  ATCTCCAATCAGATGAAACAGTCCATGGAAGAATTTCGAAGCCTTGCTTCTCGATATGGAGATCTTTACCAGGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATCTCCAATCAGATGAAACAGTCCATGGAAGAATTTCGAAGCCTTGCTTCTCGATATGGAGATCTTTACCAGGC  2072

Query 2073  ATCTTTTGATGCTGACTCAGCAACTTTGAGGAATGTTGAACTACAGCAGCAGAGCTGTTTACTGATATCTCATG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATCTTTTGATGCTGACTCAGCAACTTTGAGGAATGTTGAACTACAGCAGCAGAGCTGTTTACTGATATCTCATG  2146

Query 2147  CAATAGAAGCCCTGATTTTGGATCCAGAATCAGCAAGTTTCCAGGAATATGGATCTACTGGAACAGCCCATGCT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CAATAGAAGCCCTGATTTTGGATCCAGAATCAGCAAGTTTCCAGGAATATGGATCTACTGGAACAGCCCATGCT  2220

Query 2221  GATAGTGAATATGAAAGAAGAATGATGTCTGTATATAATCATGTCTTGGAGGAGCACACAGCATGCCTCTGCAA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GATAGTGAATATGAAAGAAGAATGATGTCTGTATATAATCATGTCTTGGAGGAGCACACAGCATGCCTCTGCAA  2294

Query 2295  TGCCATCATTGCTTTGCTGAAAGTTCCCCTTTCTTTCCAGAGATATTTTTTCCAGAAACTACAGTCTACCAGCA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGCCATCATTGCTTTGCTGAAAGTTCCCCTTTCTTTCCAGAGATATTTTTTCCAGAAACTACAGTCTACCAGCA  2368

Query 2369  TCAAGCTTGCTCTGTCACCATCGCCCCGGAATCCTGCAGAGCCCATTGCTGTCCAGAATAACCAGCAGCTGGCG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TCAAGCTTGCTCTGTCACCATCGCCCCGGAATCCTGCAGAGCCCATTGCTGTCCAGAATAACCAGCAGCTGGCG  2442

Query 2443  CTAAAGGTAGAGGGAGTGGTTCAGCACGGATCTAAACCAGGACTCTTCCGCAAAATTCAGTCTGTCTGTCTGAA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CTAAAGGTAGAGGGAGTGGTTCAGCACGGATCTAAACCAGGACTCTTCCGCAAAATTCAGTCTGTCTGTCTGAA  2516

Query 2517  TGTTTCTTCCACACTGCAGAGTAAATCTGGACAAGACTACAAGATACCCATTGACAACATGACCAATGAGATGG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGTTTCTTCCACACTGCAGAGTAAATCTGGACAAGACTACAAGATACCCATTGACAACATGACCAATGAGATGG  2590

Query 2591  AGCAAAGGGTTGAACCTCATAATGATTACTTCAGTACTCAATTTCTGTTGAACTTTGCTATCCTTGGAACACAC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AGCAAAGGGTTGAACCTCATAATGATTACTTCAGTACTCAATTTCTGTTGAACTTTGCTATCCTTGGAACACAC  2664

Query 2665  AACATTACAGTGGAATCTTCTGTGAAAGATGCCAATGGTATAGTATGGAAGACTGGTCCCAGAACTACCATATT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  AACATTACAGTGGAATCTTCTGTGAAAGATGCCAATGGTATAGTATGGAAGACTGGTCCCAGAACTACCATATT  2738

Query 2739  TGTAAAATCCCTGGAAGACCCTTATTCCCAGCAAATTCGCTTACAACAGCAGCAAGCCCAGCAGCCATTACAGC  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TGTAAAATCCCTGGAAGACCCTTATTCCCAGCAAATTCGCTTACAACAGCAGCAAGCCCAGCAGCCATTACAGC  2812

Query 2813  AGCAGCAGCAACGCAATGCCTACACACGGTTT  2844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AGCAGCAGCAACGCAATGCCTACACACGGTTT  2844