Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15781
• Subject: NM_001113565.1
• Aligned Length: 1179
• Identities: 1080
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGCCTGGGCACTTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATTCGACCAGTTATTTGACGACGAATC  74
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTGGGCACCTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATTCGACCAGCTATTTGACGACGAATC  74

Query   75  GGACCCCTTCGAGGTGCTGAAGGCAGCAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCTG  148
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GGACCCTTTCGAGGTACTGAAGGCAGCAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCCG  148

Query  149  GGGCCAAGAGCGCAGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCAGGCAAACAGCTGCGCAAGGAGTCC  222
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.||.||||||
Sbjct  149  GGGCCAAGAGCGCGGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCGGGCAAACAGTTGCGTAAAGAGTCC  222

Query  223  CAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCCCCAGCGTTGGCGTGGTTGACAAGAAAGAGGAGACGCAGCCGCCCGT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  223  CAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCCCCAGCGTCGGCGTGGCCGACAAAAAGGAGGAGACGCAGCCGCCGGT  296

Query  297  GGCGCTTAAGAAAGAAGGAATAAGACGAGTTGGAAGAAGACCTGATCAACAACTTCAGGGTGAAGGGAAAATAA  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||
Sbjct  297  GGCGCTTAAGAAAGAAGGAATAAGGCGAGTTGGAAGAAGACCCGATCAACAACTACAGGGTGATGGGAAACTAA  370

Query  371  TTGATAGAAGACCAGAAAGGCGACCACCTCGTGAACGAAGATTCGAAAAGCCACTTGAAGAAAAGGGTGAAGGA  444
            |||||||.|||.||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TTGATAGGAGAGCAGAAAGGCGACCACCCCGTGAAAGAAGATTTGAAAAGCCACTTGAAGAAAAAGGTGAAGGA  444

Query  445  GGCGAATTTTCAGTTGATAGACCGATTATTGACCGACCTATTCGAGGTCGTGGTGGTCTTGGAAGAGGTCGAGG  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  GGTGAATTTTCAGTTGATAGACCGATTATCGAACGGCCTATCCGAGGCCGAGGTGGTCTTGGAAGGGGTCGAGG  518

Query  519  GGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGAGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAACGTGAATTTGATAGGCATAGTG  592
            .||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGCGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAGCGTGAATTTGATAGGCATAGTG  592

Query  593  GAAGTGATAGATC------------------TGGCCTGAAGCACGAGGACAAACGTGGAGGTAGCGGATCTCAC  648
            |||||||||||||                  ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  593  GAAGTGATAGATCTTCTTTTTCACATTACAGTGGCCTGAAGCATGAGGACAAACGCGGAGGTAGCGGCTCTCAC  666

Query  649  AACTGGGGAACTGTCAAAGACGAATTAACTGACTTGGATCAATCAAATGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGA  722
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACTGGGGAACTGTCAAAGATGAATTAACTGATTTGGATCAATCAAATGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGA  740

Query  723  AGAACATCATCCAGTGGCAGACACTGAAAATAAGGAGAATGAAGTTGAAGAGGTAAAAGAGGAGGGTCCAAAAG  796
            ||   |.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct  741  AG---AGCACCCTGTGGCAGATACTGAAAATAAGGAGAACGAAGTTGAAGAGGTTAAGGAAGAGGGTCCAAAAG  811

Query  797  AGATGACTTTGGATGAGTGGAAGGCTATTCAAAATAAGGACCGGGCAAAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCA  870
            ||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  AGATGACTCTGGATGAGTGGAAAGCTATTCAAAATAAAGACCGAGCAAAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCA  885

Query  871  AATGAAGGTGCTGATGGGCAGTGGAAGAAGGGATTTGTTCTTCATAAATCAAAGAGTGAAGAGGCTCATGCTGA  944
            ||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  886  AATGAAGGCGCCGATGGACAATGGAAAAAGGGATTTGTTCTGCATAAATCAAAAAGTGAAGAGGCTCATGCTGA  959

Query  945  AGATTCGGTTATGGACCATCATTTCCGGAAGCCAGCAAATGATATAACGTCTCAGCTGGAGATCAATTTTGGAG  1018
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  960  AGATTCAGTTATGGACCATCATTTCCGGAAGCCAGCAAATGATATAACATCTCAACTGGAGATCAATTTTGGAG  1033

Query 1019  ACCTTGGCCGCCCAGGACGTGGCGGCAGGGGAGGACGAGGTGGACGTGGGCGTGGTGGGCGCCCAAACCGTGGC  1092
            ||.|.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1034  ACTTAGGCCGCCCAGGACGTGGTGGCAGAGGAGGACGTGGTGGGCGTGGGCGTGGTGGACGTCCAAACCGTGGC  1107

Query 1093  AGCAGGACCGACAAGTCAAGTGCTTCTGCTCCTGATGTGGATGACCCAGAGGCATTCCCAGCTCTGGCT  1161
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1108  AGCAGGACTGATAAGTCAAGTGCTTCTGCTCCTGATGTAGATGACCCAGAGGCCTTCCCAGCTCTGGCC  1176