Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15831
• Subject: NM_001243142.2
• Aligned Length: 1320
• Identities: 1317
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGATCATCCCCTCTCTAGAGGAGCTGGACTCCCTCAAGTACAGTGACCTGCAGAACTTAGCCAAGAGTCTGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATCATCCCCTCTCTAGAGGAGCTGGACTCCCTCAAGTACAGTGACCTGCAGAACTTAGCCAAGAGTCTGGG  74

Query   75  TCTCCGGGCCAACCTGAGGGCAACCAAGTTGTTAAAAGCCTTGAAAGGCTACATTAAACATGAGGCAAGAAAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTCCGGGCCAACCTGAGGGCAACCAAGTTGTTAAAAGCCTTGAAAGGCTACATTAAACATGAGGCAAGAAAAG  148

Query  149  GAAATGAGAATCAGGATGAAAGTCAAACTTCTGCATCCTCTTGTGATGAGACTGAGATACAGATCAGCAACCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAAATGAGAATCAGGATGAAAGTCAAACTTCTGCATCCTCTTGTGATGAGACTGAGATACAGATCAGCAACCAG  222

Query  223  GAAGAAGCTGAGAGACAGCCACTTGGCCATGTCACCAAAACAAGGAGAAGGTGCAAGACTGTCCGTGTGGACCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGAAGCTGAGAGACAGCCACTTGGCCATGTCACCAAAACAAGGAGAAGGTGCAAGACTGTCCGTGTGGACCC  296

Query  297  TGACTCACAGCAGAATCATTCAGAGATAAAAATAAGTAATCCCACTGAATTCCAGAATCATGAAAAGCAGGAAA  370
            |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACTCA---CAGAATCATTCAGAGATAAAAATAAGTAATCCCACTGAATTCCAGAATCATGAAAAGCAGGAAA  367

Query  371  GCCAGGATCTCAGAGCTACTGCAAAAGTTCCTTCTCCACCAGACGAGCACCAAGAAGCTGAGAATGCTGTTTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  GCCAGGATCTCAGAGCTACTGCAAAAGTTCCTTCTCCACCAGACGAGCACCAAGAAGCTGAGAATGCTGTTTCC  441

Query  445  TCAGGTAACAGAGATTCAAAGGTACCTTCAGAAGGAAAGAAATCTCTCTACACAGATGAGTCATCCAAACCTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  TCAGGTAACAGAGATTCAAAGGTACCTTCAGAAGGAAAGAAATCTCTCTACACAGATGAGTCATCCAAACCTGG  515

Query  519  AAAAAATAAAAGAACTGCAATCACTACTCCAAACTTTAAGAAGCTTCATGAAGCTCATTTTAAGGAAATGGAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  AAAAAATAAAAGAACTGCAATCACTACTCCAAACTTTAAGAAGCTTCATGAAGCTCATTTTAAGGAAATGGAGT  589

Query  593  CCATTGATCAATATATTGAGAGAAAAAAGAAACATTTTGAAGAACACAATTCCATGAATGAACTGAAGCAGCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  CCATTGATCAATATATTGAGAGAAAAAAGAAACATTTTGAAGAACACAATTCCATGAATGAACTGAAGCAGCCC  663

Query  667  ATCAATAAGGGAGGGGTCAGGACTCCAGTACCTCCAAGAGGAAGACTCTCTGTGGCTTCTACTCCCATCAGCCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  ATCAATAAGGGAGGGGTCAGGACTCCAGTACCTCCAAGAGGAAGACTCTCTGTGGCTTCTACTCCCATCAGCCA  737

Query  741  ACGACGCTCGCAAGGCCGGTCTTGTGGCCCTGCAAGTCAGAGTACCTTGGGTCTGAAGGGGTCACTCAAGCGCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  ACGACGCTCGCAAGGCCGGTCTTGTGGCCCTGCAAGTCAGAGTACCTTGGGTCTGAAGGGGTCACTCAAGCGCT  811

Query  815  CTGCTATCTCTGCAGCTAAAACGGGTGTCAGGTTTTCAGCTGCTACTAAAGATAATGAGCATAAGCGTTCACTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  CTGCTATCTCTGCAGCTAAAACGGGTGTCAGGTTTTCAGCTGCTACTAAAGATAATGAGCATAAGCGTTCACTG  885

Query  889  ACCAAGACTCCAGCCAGAAAGTCTGCACATGTGACCGTGTCTGGGGGCACCCCAAAAGGCGAGGCTGTGCTTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  ACCAAGACTCCAGCCAGAAAGTCTGCACATGTGACCGTGTCTGGGGGCACCCCAAAAGGCGAGGCTGTGCTTGG  959

Query  963  GACACACAAATTAAAGACCATCACGGGGAATTCTGCTGCTGTTATTACCCCATTCAAGTTGACAACTGAGGCAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  GACACACAAATTAAAGACCATCACGGGGAATTCTGCTGCTGTTATTACCCCATTCAAGTTGACAACTGAGGCAA  1033

Query 1037  CGCAGACTCCAGTCTCCAATAAGAAACCAGTGTTTGATCTTAAAGCAAGTTTGTCTCGTCCCCTCAACTATGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  CGCAGACTCCAGTCTCCAATAAGAAACCAGTGTTTGATCTTAAAGCAAGTTTGTCTCGTCCCCTCAACTATGAA  1107

Query 1111  CCACACAAAGGAAAGCTAAAACCATGGGGGCAATCTAAAGAAAATAATTATCTAAATCAACATGTCAACAGAAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  CCACACAAAGGAAAGCTAAAACCATGGGGGCAATCTAAAGAAAATAATTATCTAAATCAACATGTCAACAGAAT  1181

Query 1185  TAACTTCTACAAGAAAACTTACAAACAACCCCATCTCCAGACAAAGGAAGAGCAACGGAAGAAACGCGAGCAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  TAACTTCTACAAGAAAACTTACAAACAACCCCATCTCCAGACAAAGGAAGAGCAACGGAAGAAACGCGAGCAAG  1255

Query 1259  AACGAAAGGAGAAGAAAGCAAAGGTTTTGGGAATGCGAAGGGGCCTCATTTTGGCTGAAGAT  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  AACGAAAGGAGAAGAAAGCAAAGGTTTTGGGAATGCGAAGGGGCCTCATTTTGGCTGAAGAT  1317