Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15847
• Subject: NM_001205067.1
• Aligned Length: 915
• Identities: 802
• Gaps: 0

Alignment

Query   1  ATGGCATGCCTTGGACTTTATTGTGGGAAGACCCTATTATTTAAAAATGGCTCAACTGAAATATATGGAGAATG  74
           |||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct   1  ATGGCATGCCTTGGACTCTACTGTGGGAAGACCCTATTATTTAAAAATGGCTCAAGTGAAATCTATGGAGAATG  74

Query  75  TGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGAACGAATGCACAGAAATATTGTCAGCCTTGCACAGAATCTCCTGAACTTT  148
           ||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct  75  TGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGGACCAATGCACAGAAGTACTGTCAGCCTTGCACAGAGTCCCCAGAACTTT  148

Query 149  ATGATTGGCTCTATCTTGGATTTATGGCAATGCTTCCTCTGGTTTTACATTGGTTCTTCATTGAATGGTACTCG  222
           |.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACGACTGGCTCTATCTGGGCTTTATGGCTATGCTTCCTCTTGTTCTGCATTGGTTCTTCATTGAATGGTACTCG  222

Query 223  GGGAAAAAGAGTTCCAGCGCACTTTTCCAACACATCACTGCATTATTTGAATGCAGCATGGCAGCTATTATCAC  296
           |||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||..|.||||||||||.||||||||||||.|||||
Sbjct 223  GGGAAAAAGAGCTCCAGTGCTCTTTTCCAGCACATCACCGCGCTCTTTGAATGCACCATGGCAGCTATCATCAC  296

Query 297  CTTACTTGTGAGTGATCCAGTTGGTGTTCTTTATATTCGTTCATGTCGAGTATTGATGCTTTCTGACTGGTACA  370
           ||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||.||..|||||||||||||.|||||||
Sbjct 297  CTTACTCGTGAGTGATCCCGTGGGCGTCCTTTACATCCGTTCCTGCCGCGTTCTGATGCTTTCTGATTGGTACA  370

Query 371  CGATGCTTTACAACCCAAGTCCAGATTACGTTACCACAGTACACTGTACTCATGAAGCCGTCTACCCACTATAT  444
           |||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 371  CGATGCTCTACAACCCAAGTCCAGATTACGTCACCACGGTGCACTGCACTCACGAAGCCGTCTACCCACTGTAC  444

Query 445  ACCATTGTATTTATCTATTACGCATTCTGCTTGGTATTAATGATGCTGCTCCGACCTCTTCTGGTGAAGAAGAT  518
           |||||.||.||..|.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 445  ACCATCGTGTTCGTTTATTACGCGTTCTGCTTGGTGTTAATGATGCTTCTGCGGCCTCTCCTGGTGAAGAAGAT  518

Query 519  TGCATGTGGGTTAGGGAAATCTGATCGATTTAAAAGTATTTATGCTGCACTTTACTTCTTCCCAATTTTAACCG  592
           .|||||.||..|.||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||..|.||||
Sbjct 519  CGCATGCGGACTCGGCAAGTCTGACCGCTTCAAAAGTATTTACGCAGCTCTTTACTTCTTCCCCATCCTGACCG  592

Query 593  TGCTTCAGGCAGTTGGTGGAGGCCTTTTATATTACGCCTTCCCATACATTATATTAGTGTTATCTTTGGTTACT  666
           ||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 593  TGCTGCAGGCGGTCGGTGGGGGCCTCTTATATTACGCCTTCCCGTACATTATATTAGTGTTATCTCTGGTTACC  666

Query 667  CTGGCTGTGTACATGTCTGCTTCTGAAATAGAGAACTGCTATGATCTTCTGGTCAGAAAGAAAAGACTTATTGT  740
           ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 667  CTGGCTGTATACATGTCTGCTTCTGAAATAGAGAACTGCTATGATCTCCTGGTCAGGAAGAAAAGACTTATCGT  740

Query 741  TCTCTTCAGCCACTGGTTACTTCATGCCTATGGAATAATCTCCATTTCCAGAGTGGATAAACTTGAGCAAGATT  814
           ||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||.|||||||.|||||||||||.|..||.||.||.||..
Sbjct 741  TCTCTTCAGCCACTGGCTACTGCACGCCTATGGCATAGTCTCCATCTCCAGAGTGGACAGGCTGGAACACGACC  814

Query 815  TGCCCCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGCCCTTTTTTACTTGTTCACTGCAAAATTTACCGAACCTTCAAGG  888
           |.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 815  TACCGCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGCTCTGTTTTACTTGTTTACTGCAAAATTTACCGAACCATCACGG  888

Query 889  ATACTCTCAGAAGGAGCCAATGGACAC  915
           ||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 889  ATACTCTCAGAAGGGGCCAATGGACAT  915