Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15847
• Subject: NM_024205.2
• Aligned Length: 933
• Identities: 802
• Gaps: 18

Alignment

Query   1  ATG------------------GCATGCCTTGGACTTTATTGTGGGAAGACCCTATTATTTAAAAATGGCTCAAC  56
           |||                  ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct   1  ATGGCTGTCGATATTCAACCAGCATGCCTTGGACTCTACTGTGGGAAGACCCTATTATTTAAAAATGGCTCAAG  74

Query  57  TGAAATATATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGAACGAATGCACAGAAATATTGTCAGCCTTGCA  130
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  75  TGAAATCTATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGGACCAATGCACAGAAGTACTGTCAGCCTTGCA  148

Query 131  CAGAATCTCCTGAACTTTATGATTGGCTCTATCTTGGATTTATGGCAATGCTTCCTCTGGTTTTACATTGGTTC  204
           ||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||||||
Sbjct 149  CAGAGTCCCCAGAACTTTACGACTGGCTCTATCTGGGCTTTATGGCTATGCTTCCTCTTGTTCTGCATTGGTTC  222

Query 205  TTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGTTCCAGCGCACTTTTCCAACACATCACTGCATTATTTGAATGCAG  278
           |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||..|.||||||||||.
Sbjct 223  TTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGCTCCAGTGCTCTTTTCCAGCACATCACCGCGCTCTTTGAATGCAC  296

Query 279  CATGGCAGCTATTATCACCTTACTTGTGAGTGATCCAGTTGGTGTTCTTTATATTCGTTCATGTCGAGTATTGA  352
           ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||.||..|||
Sbjct 297  CATGGCAGCTATCATCACCTTACTCGTGAGTGATCCCGTGGGCGTCCTTTACATCCGTTCCTGCCGCGTTCTGA  370

Query 353  TGCTTTCTGACTGGTACACGATGCTTTACAACCCAAGTCCAGATTACGTTACCACAGTACACTGTACTCATGAA  426
           ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 371  TGCTTTCTGATTGGTACACGATGCTCTACAACCCAAGTCCAGATTACGTCACCACGGTGCACTGCACTCACGAA  444

Query 427  GCCGTCTACCCACTATATACCATTGTATTTATCTATTACGCATTCTGCTTGGTATTAATGATGCTGCTCCGACC  500
           ||||||||||||||.||.|||||.||.||..|.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 445  GCCGTCTACCCACTGTACACCATCGTGTTCGTTTATTACGCGTTCTGCTTGGTGTTAATGATGCTTCTGCGGCC  518

Query 501  TCTTCTGGTGAAGAAGATTGCATGTGGGTTAGGGAAATCTGATCGATTTAAAAGTATTTATGCTGCACTTTACT  574
           |||.||||||||||||||.|||||.||..|.||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 519  TCTCCTGGTGAAGAAGATCGCATGCGGACTCGGCAAGTCTGACCGCTTCAAAAGTATTTACGCAGCTCTTTACT  592

Query 575  TCTTCCCAATTTTAACCGTGCTTCAGGCAGTTGGTGGAGGCCTTTTATATTACGCCTTCCCATACATTATATTA  648
           |||||||.||..|.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 593  TCTTCCCCATCCTGACCGTGCTGCAGGCGGTCGGTGGGGGCCTCTTATATTACGCCTTCCCGTACATTATATTA  666

Query 649  GTGTTATCTTTGGTTACTCTGGCTGTGTACATGTCTGCTTCTGAAATAGAGAACTGCTATGATCTTCTGGTCAG  722
           |||||||||.|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667  GTGTTATCTCTGGTTACCCTGGCTGTATACATGTCTGCTTCTGAAATAGAGAACTGCTATGATCTCCTGGTCAG  740

Query 723  AAAGAAAAGACTTATTGTTCTCTTCAGCCACTGGTTACTTCATGCCTATGGAATAATCTCCATTTCCAGAGTGG  796
           .||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||
Sbjct 741  GAAGAAAAGACTTATCGTTCTCTTCAGCCACTGGCTACTGCACGCCTATGGCATAGTCTCCATCTCCAGAGTGG  814

Query 797  ATAAACTTGAGCAAGATTTGCCCCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGCCCTTTTTTACTTGTTCACTGCAAAA  870
           |.|..||.||.||.||..|.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 815  ACAGGCTGGAACACGACCTACCGCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGCTCTGTTTTACTTGTTTACTGCAAAA  888

Query 871  TTTACCGAACCTTCAAGGATACTCTCAGAAGGAGCCAATGGACAC  915
           |||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 889  TTTACCGAACCATCACGGATACTCTCAGAAGGGGCCAATGGACAT  933