Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15872
- Subject:
- NM_001122826.2
- Aligned Length:
- 2034
- Identities:
- 1968
- Gaps:
- 60
Alignment
Query 1 ATGACGGCCTCTCCGGATTACTTGGTGGTGCTTTTTGGGATCACTGCTGGGGCCACCGGGGCCAAGCTAGGCTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACGGCCTCTCCGGATTACTTGGTGGTGCTTTTTGGGATCACTGCTGGGGCCACCGGGGCCAAGCTAGGCTC 74
Query 75 GGATGAGAAGGAGTTGATCCTGCTGTTCTGGAAAGTCGTGGATCTGGCCAACAAGAAGGTGGGACAGTTGCACG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGATGAGAAGGAGTTGATCCTGCTGTTCTGGAAAGTCGTGGATCTGGCCAACAAGAAGGTGGGACAGTTGCACG 148
Query 149 AAGTGCTAGTTAGACCGGATCAGTTGGAACTGACGGAGGACTGCAAAGAAGAAACTAAAATAGACGTCGAAAGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGTGCTAGTTAGACCGGATCAGTTGGAACTGACGGAGGACTGCAAAGAAGAAACTAAAATAGACGTCGAAAGC 222
Query 223 CTGTCCTCGGCGTCGCAGCTGGACCAAGCCCTCCGACAGTTTAACCAGTCAGTGAGCAATGAACTGAATATTGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGTCCTCGGCGTCGCAGCTGGACCAAGCCCTCCGACAGTTTAACCAGTCAGTGAGCAATGAACTGAATATTGG 296
Query 297 AGTAGGGACTTCCTTCTGTCTCTGTACTGATGGGCAGCTTCATGTCAGGCAAATCCTGCATCCTGAGGCTTCCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGTAGGGACTTCCTTCTGTCTCTGTACTGATGGGCAGCTTCATGTCAGGCAAATCCTGCATCCTGAGGCTTCCA 370
Query 371 AGAAGAATGTACTATTACCTGAATGCTTCTATTCCTTTTTTGATCTTCGAAAAGAATTCAAGAAATGTTGCCCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGAAGAATGTACTATTACCTGAATGCTTCTATTCCTTTTTTGATCTTCGAAAAGAATTCAAGAAATGTTGCCCT 444
Query 445 GGTTCACCTGATATTGACAAACTGGACGTTGCCACAATGACAGAGTATTTAAATTTTGAGAAGAGTAGTTCAGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGTTCACCTGATATTGACAAACTGGACGTTGCCACAATGACAGAGTATTTAAATTTTGAGAAGAGTAGTTCAGT 518
Query 519 CTCTCGATATGGAGCCTCTCAAGTTGAAGATATGGGGAATATAATTTTAGCAATGATTTCAGAGCCTTATAATC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTCTCGATATGGAGCCTCTCAAGTTGAAGATATGGGGAATATAATTTTAGCAATGATTTCAGAGCCTTATAATC 592
Query 593 ACAGGTTTTCAGATCCAGAGAGAGTGAATTACAAGTTTGAAAGTGGAACTTGCAGCAAGATGGAACTTATTGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAGGTTTTCAGATCCAGAGAGAGTGAATTACAAGTTTGAAAGTGGAACTTGCAGCAAGATGGAACTTATTGAT 666
Query 667 GATAACACCGTAGTCAGGGCACGAGGTTTACCATGGCAGTCTTCAGATCAAGATATTGCAAGATTCTTCAAAGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATAACACCGTAGTCAGGGCACGAGGTTTACCATGGCAGTCTTCAGATCAAGATATTGCAAGATTCTTCAAAGG 740
Query 741 ACTCAATATTGCCAAGGGAGGTGCAGCACTTTGTCTGAATGCTCAGGGTCGAAGGAACGGAGAAGCTCTGGTTA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACTCAATATTGCCAAGGGAGGTGCAGCACTTTGTCTGAATGCTCAGGGTCGAAGGAACGGAGAAGCTCTGGTTA 814
Query 815 GGTTTGTAAGTGAGGAGCACCGAGACCTAGCACTACAGAGGCACAAACATCACATGGGGACCCGGTATATTGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGTTTGTAAGTGAGGAGCACCGAGACCTAGCACTACAGAGGCACAAACATCACATGGGGACCCGGTATATTGAG 888
Query 889 GTTTACAAAGCAACAGGTGAAGATTTCCTTAAAATTGCTGGTGGTACTTCCAATGAGGTAGCCCAGTTTCTCTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTTTACAAAGCAACAGGTGAAGATTTCCTTAAAATTGCTGGTGGTACTTCCAATGAGGTAGCCCAGTTTCTCTC 962
Query 963 CAAGGAAAATCAAGTCATTGTCCGCATGCGGGGGCTCCCTTTCACGGCCACAGCTGAAGAAGTGGTGGCCTTCT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAGGAAAATCAAGTCATTGTCCGCATGCGGGGGCTCCCTTTCACGGCCACAGCTGAAGAAGTGGTGGCCTTCT 1036
Query 1037 TTGGACAGCATTGCCCTATTACTGGGGGAAAGGAAGGCATCCTCTTTGTCACCTACCCAGATGGTAGGCCAACA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTGGACAGCATTGCCCTATTACTGGGGGAAAGGAAGGCATCCTCTTTGTCACCTACCCAGATGGTAGGCCAACA 1110
Query 1111 GGGGACGCTTTTGTCCTCTTTGCCTGTGAGGAATATGCACAGAATGCGTTGAGGAAGCATAAAGACTTGTTGGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGGGACGCTTTTGTCCTCTTTGCCTGTGAGGAATATGCACAGAATGCGTTGAGGAAGCATAAAGACTTGTTGGG 1184
Query 1185 TAAAAGATACATTGAACTCTTCAGGAGCACAGCAGCTGAAGTTCAGCAGGTGCTGAATCGATTCTCCTCGGCCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAAAAGATACATTGAACTCTTCAGGAGCACAGCAGCTGAAGTTCAGCAGGTGCTGAATCGATTCTCCTCGGCCC 1258
Query 1259 CTCTCATTCCACTTCCAACCCCTCCCATTATTCCAGTACTACCTCAGCAATTTGTGCCCCCTACAAATGTTAGA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTCTCATTCCACTTCCAACCCCTCCCATTATTCCAGTACTACCTCAGCAATTTGTGCCCCCTACAAATGTTAGA 1332
Query 1333 GACTGTATACGCCTTCGAGGTCTTCCCTATGCAGCCACAATTGAGGACATCCTGGATTTCCTGGGGGAGTTCGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GACTGTATACGCCTTCGAGGTCTTCCCTATGCAGCCACAATTGAGGACATCCTGGATTTCCTGGGGGAGTTCGC 1406
Query 1407 CACAGATATTCGTACTCATGGGGTTCACATGGTTTTGAATCACCAAGGCCGCCCATCAGGAGATGCCTTTATCC 1480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CACAGATATTCGTACTCATGGGGTTCACATGGTTTTGAATCACCAGGGCCGCCCATCAGGAGATGCCTTTATCC 1480
Query 1481 AGATGAAGTCTGCGGACAGAGCATTTATGGCTGCACAGAAGTGTCATAAAAAAAACATGAAGGACAGATATGTT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGATGAAGTCTGCGGACAGAGCATTTATGGCTGCACAGAAGTGTCATAAAAAAAACATGAAGGACAGATATGTT 1554
Query 1555 GAAGTCTTTCAGTGTTCAGCTGAGGAGATGAACTTTGTGTTAATGGGGGGCACTTTAAATCGAAATGGCTTATC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAAGTCTTTCAGTGTTCAGCTGAGGAGATGAACTTTGTGTTAATGGGGGGCACTTTAAATCGAAATGGCTTATC 1628
Query 1629 CCCACCGCCATGCCTGTCTCCTCCCTCCTACACATTTCCAGCTCCTGCTGCAGTTATTCCTACAGAAGCTGCCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCCACCGCCATGCCTGTCTCCTCCCTCCTACACATTTCCAGCTCCTGCTGCAGTTATTCCTACAGAAGCTGCCA 1702
Query 1703 TTTACCAGCCCTCTGTGATTTTGAATCCACGAGCACTGCAGCCCTCCACAGCGTACTACCCAGCAGGCACTCAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTTACCAGCCCTCTGTGATTTTGAATCCACGAGCACTGCAGCCCTCCACAGCGTACTACCCAGCAGGCACTCAG 1776
Query 1777 CTCTTCATGAACTACACAGCGTACTATCCCAGCCCCCCAGGTTCGCCTAATAGTCTTGGCTACTTCCCTACAGC 1850
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CTCTTCATGAATTACACAGCGTACTATCCCAGCCCCCCAGGTTCGCCTAATAGTCTTGGCTACTTCCCTACAGC 1850
Query 1851 TGCTAATCTTAGCGGTGTCCCTCCACAGCCTGGCACGGTGGTCAGAATGCAGGGCCTGGCCTACAATACTGGAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGCTAATCTTAGCGGTGTCCCTCCACAGCCTGGCACGGTGGTCAGAATGCAGGGCCTGGCCTACAATACTGGAG 1924
Query 1925 TTAAGGAAATTCTTAACTTCTCCCAAGGTTACCA--GTATGCAACCGA-GGATGGACTTATACACACAAATGAC 1995
|||||||||||||||||||||.|||||||||||| ||.||.|| || |.||||
Sbjct 1925 TTAAGGAAATTCTTAACTTCTTCCAAGGTTACCAGTGTTTGAAA--GATGTATGG------------------- 1977
Query 1996 CAGGCCAGGACTCTACCCAAAGAATGGGTTTGTATT 2031
Sbjct 1978 ------------------------------------ 1977