Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15872
• Subject: NM_001122827.2
• Aligned Length: 2031
• Identities: 1809
• Gaps: 219

Alignment

Query    1  ATGACGGCCTCTCCGGATTACTTGGTGGTGCTTTTTGGGATCACTGCTGGGGCCACCGGGGCCAAGCTAGGCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACGGCCTCTCCGGATTACTTGGTGGTGCTTTTTGGGATCACTGCTGGGGCCACCGGGGCCAAGCTAGGCTC  74

Query   75  GGATGAGAAGGAGTTGATCCTGCTGTTCTGGAAAGTCGTGGATCTGGCCAACAAGAAGGTGGGACAGTTGCACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGATGAGAAGGAGTTGATCCTGCTGTTCTGGAAAGTCGTGGATCTGGCCAACAAGAAGGTGGGACAGTTGCACG  148

Query  149  AAGTGCTAGTTAGACCGGATCAGTTGGAACTGACGGAGGACTGCAAAGAAGAAACTAAAATAGACGTCGAAAGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGTGCTAGTTAGACCGGATCAGTTGGAACTGACGGAGGACTGCAAAGAAGAAACTAAAATAGACGTCGAAAGC  222

Query  223  CTGTCCTCGGCGTCGCAGCTGGACCAAGCCCTCCGACAGTTTAACCAGTCAGTGAGCAATGAACTGAATATTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGTCCTCGGCGTCGCAGCTGGACCAAGCCCTCCGACAGTTTAACCAGTCAGTGAGCAATGAACTGAATATTGG  296

Query  297  AGTAGGGACTTCCTTCTGTCTCTGTACTGATGGGCAGCTTCATGTCAGGCAAATCCTGCATCCTGAGGCTTCCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGTAGGGACTTCCTTCTGTCTCTGTACTGATGGGCAGCTTCATGTCAGGCAAATCCTGCATCCTGAGGCTTCCA  370

Query  371  AGAAGAATGTACTATTACCTGAATGCTTCTATTCCTTTTTTGATCTTCGAAAAGAATTCAAGAAATGTTGCCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAGAATGTACTATTACCTGAATGCTTCTATTCCTTTTTTGATCTTCGAAAAGAATTCAAGAAATGTTGCCCT  444

Query  445  GGTTCACCTGATATTGACAAACTGGACGTTGCCACAATGACAGAGTATTTAAATTTTGAGAAGAGTAGTTCAGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTTCACCTGATATTGACAAACTGGACGTTGCCACAATGACAGAGTATTTAAATTTTGAGAAGAGTAGTTCAGT  518

Query  519  CTCTCGATATGGAGCCTCTCAAGTTGAAGATATGGGGAATATAATTTTAGCAATGATTTCAGAGCCTTATAATC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCTCGATATGGAGCCTCTCAAGTTGAAGATATGGGGAATATAATTTTAGCAATGATTTCAGAGCCTTATAATC  592

Query  593  ACAGGTTTTCAGATCCAGAGAGAGTGAATTACAAGTTTGAAAGTGGAACTTGCAGCAAGATGGAACTTATTGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAGGTTTTCAGATCCAGAGAGAGTGAATTACAAGTTTGAAAGTGGAACTTGCAGCAAGATGGAACTTATTGAT  666

Query  667  GATAACACCGTAGTCAGGGCACGAGGTTTACCATGGCAGTCTTCAGATCAAGATATTGCAAGATTCTTCAAAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATAACACCGTAGTCAGGGCACGAGGTTTACCATGGCAGTCTTCAGATCAAGATATTGCAAGATTCTTCAAAGG  740

Query  741  ACTCAATATTGCCAAGGGAGGTGCAGCACTTTGTCTGAATGCTCAGGGTCGAAGGAACGGAGAAGCTCTGGTTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACTCAATATTGCCAAGGGAGGTGCAGCACTTTGTCTGAATGCTCAGGGTCGAAGGAACGGAGAAGCTCTGGTTA  814

Query  815  GGTTTGTAAGTGAGGAGCACCGAGACCTAGCACTACAGAGGCACAAACATCACATGGGGACCCGGTATATTGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGTTTGTAAGTGAGGAGCACCGAGACCTAGCACTACAGAGGCACAAACATCACATGGGGACCCGGTATATTGAG  888

Query  889  GTTTACAAAGCAACAGGTGAAGATTTCCTTAAAATTGCTGGTGGTACTTCCAATGAGGTAGCCCAGTTTCTCTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTTTACAAAGCAACAGGTGAAGATTTCCTTAAAATTGCTGGTGGTACTTCCAATGAGGTAGCCCAGTTTCTCTC  962

Query  963  CAAGGAAAATCAAGTCATTGTCCGCATGCGGGGGCTCCCTTTCACGGCCACAGCTGAAGAAGTGGTGGCCTTCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGGAAAATCAAGTCATTGTCCGCATGCGGGGGCTCCCTTTCACGGCCACAGCTGAAGAAGTGGTGGCCTTCT  1036

Query 1037  TTGGACAGCATTGCCCTATTACTGGGGGAAAGGAAGGCATCCTCTTTGTCACCTACCCAGATGGTAGGCCAACA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGGACAGCATTGCCCTATTACTGGGGGAAAGGAAGGCATCCTCTTTGTCACCTACCCAGATGGTAGGCCAACA  1110

Query 1111  GGGGACGCTTTTGTCCTCTTTGCCTGTGAGGAATATGCACAGAATGCGTTGAGGAAGCATAAAGACTTGTTGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGGACGCTTTTGTCCTCTTTGCCTGTGAGGAATATGCACAGAATGCGTTGAGGAAGCATAAAGACTTGTTGGG  1184

Query 1185  TAAAAGATACATTGAACTCTTCAGGAGCACAGCAGCTGAAGTTCAGCAGGTGCTGAATCGATTCTCCTCGGCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAAAAGATACATTGAACTCTTCAGGAGCACAGCAGCTGAAGTTCAGCAGGTGCTGAATCGATTCTCCTCGGCCC  1258

Query 1259  CTCTCATTCCACTTCCAACCCCTCCCATTATTCCAGTACTACCTCAGCAATTTGTGCCCCCTACAAATGTTAGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCTCATTCCACTTCCAACCCCTCCCATTATTCCAGTACTACCTCAGCAATTTGTGCCCCCTACAAATGTTAGA  1332

Query 1333  GACTGTATACGCCTTCGAGGTCTTCCCTATGCAGCCACAATTGAGGACATCCTGGATTTCCTGGGGGAGTTCGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACTGTATACGCCTTCGAGGTCTTCCCTATGCAGCCACAATTGAGGACATCCTGGATTTCCTGGGGGAGTTCGC  1406

Query 1407  CACAGATATTCGTACTCATGGGGTTCACATGGTTTTGAATCACCAAGGCCGCCCATCAGGAGATGCCTTTATCC  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACAGATATTCGTACTCATGGGGTTCACATGGTTTTGAATCACCAGGGCCGCCCATCAGGAGATGCCTTTATCC  1480

Query 1481  AGATGAAGTCTGCGGACAGAGCATTTATGGCTGCACAGAAGTGTCATAAAAAAAACATGAAGGACAGATATGTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGATGAAGTCTGCGGACAGAGCATTTATGGCTGCACAGAAGTGTCATAAAAAAAACATGAAGGACAGATATGTT  1554

Query 1555  GAAGTCTTTCAGTGTTCAGCTGAGGAGATGAACTTTGTGTTAATGGGGGGCACTTTAAATCGAAATGGCTTATC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAAGTCTTTCAGTGTTCAGCTGAGGAGATGAACTTTGTGTTAATGGGGGGCACTTTAAATCGAAATGGCTTATC  1628

Query 1629  CCCACCGCCATGCCTGTCTCCTCCCTCCTACACATTTCCAGCTCCTGCTGCAGTTATTCCTACAGAAGCTGCCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCCACCGCCATGCCTGTCTCCTCCCTCCTACACATTTCCAGCTCCTGCTGCAGTTATTCCTACAGAAGCTGCCA  1702

Query 1703  TTTACCAGCCCTCTGTGATTTTGAATCCACGAGCACTGCAGCCCTCCACAGCGTACTACCCAGCAGGCACTCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTTACCAGCCCTCTGTGATTTTGAATCCACGAGCACTGCAGCCCTCCACAGCGTACTACCCAGCAGGCACTCAG  1776

Query 1777  CTCTTCATGAACTACACAGCGTACTATCCCAGCCCCCCAGGTTCGCCTAATAGTCTTGGCTACTTCCCTACAGC  1850
            |||||||||||.||||||||||||||||||||       .|||                               
Sbjct 1777  CTCTTCATGAATTACACAGCGTACTATCCCAG-------TGTT-------------------------------  1812

Query 1851  TGCTAATCTTAGCGGTGTCCCTCCACAGCCTGGCACGGTGGTCAGAATGCAGGGCCTGGCCTACAATACTGGAG  1924
                                                                                      
Sbjct 1813  --------------------------------------------------------------------------  1812

Query 1925  TTAAGGAAATTCTTAACTTCTCCCAAGGTTACCAGTATGCAACCGAGGATGGACTTATACACACAAATGACCAG  1998
                                                                                      
Sbjct 1813  --------------------------------------------------------------------------  1812

Query 1999  GCCAGGACTCTACCCAAAGAATGGGTTTGTATT  2031
                                             
Sbjct 1813  ---------------------------------  1812