Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15890
- Subject:
- NM_139119.2
- Aligned Length:
- 2250
- Identities:
- 2052
- Gaps:
- 198
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAAGATCTGTTTGAAACTTTCCAAGATGAGATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGCTAACTTTAACACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACC 148
Query 1 --------------------------------------------------ATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAG 24
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TACTAAATGAACAACATCAGATAGCGAAGGAACTATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAG 222
Query 25 CAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAACCCCAGTGTAAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAG 98
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAACCCCAGTGTAAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAG 296
Query 99 GAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCAGCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACC 172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCAGCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACC 370
Query 173 CCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTAGCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATC 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTAGCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATC 444
Query 247 GCCCTTCACCATCAGTACAACCCCAAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCT 320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCCCTTCACCATCAGTACAACCCCAAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCT 518
Query 321 GATTGAAGACTTCAGCACACATGTCAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAAT 394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GATTGAAGACTTCAGCACACATGTCAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAAT 592
Query 395 TTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGGCTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCA 468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGGCTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCA 666
Query 469 GTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAATCCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTT 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAATCCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTT 740
Query 543 AGGACTGAAGCATTTTGAAGGGACTGAGTTTCTTAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTG 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGACTGAAGCATTTTGAAGGGACTGAGTTTCTTAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTG 814
Query 617 CCCGCCAACTGACAGTGAGAATCAAGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAG 690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCGCCAACTGACAGTGAGAATCAAGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAG 888
Query 691 AAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTAGGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGA 764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTAGGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGA 962
Query 765 GAGAGAAGAACACCGGCTCCCATTCTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGG 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAGAGAAGAACACCGGCTCCCATTCTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGG 1036
Query 839 CTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAAATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGAC 912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAAATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGAC 1110
Query 913 AACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACTCGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGT 986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACTCGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGT 1184
Query 987 TGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGCTTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCA 1060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGCTTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCA 1258
Query 1061 GCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCAACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGC 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCAACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGC 1332
Query 1135 AAAATGGTGCTCCGGATTCCTCACCCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACT 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAAATGGTGCTCCGGATTCCTCACCCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACT 1406
Query 1209 GGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTTTGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCT 1282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTTTGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCT 1480
Query 1283 TCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTTTGCTCTCTTCTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCT 1356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTTTGCTCTCTTCTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCT 1554
Query 1357 TCCATGTTTCGAAAGCCATATGTGAGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAA 1430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TCCATGTTTCGAAAGCCATATGTGAGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAA 1628
Query 1431 ACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGCATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTG 1504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGCATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTG 1702
Query 1505 GCGGTGGCTGTAACATGATCCAGCCTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACC 1578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCGGTGGCTGTAACATGATCCAGCCTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACC 1776
Query 1579 CTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTCCCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAAT 1652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTCCCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAAT 1850
Query 1653 TGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCTTCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTG 1726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCTTCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTG 1924
Query 1727 CTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAAATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCT 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAAATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCT 1998
Query 1801 CTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAAGTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGG 1874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAAGTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGG 2072
Query 1875 ATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCGCTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCC 1948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCGCTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCC 2146
Query 1949 CTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAAACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAA 2022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAAACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAA 2220
Query 2023 GATGCTACAGAGGAAATCAGTGGATTTCTT 2052
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GATGCTACAGAGGAAATCAGTGGATTTCTT 2250