Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15911
- Subject:
- XM_005248322.3
- Aligned Length:
- 1791
- Identities:
- 1374
- Gaps:
- 417
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGTTTAACAGGTCTGAAATCTTTGGATCTCTCGCGCAACTCCTTGGTTAGTCTGGAGGGCATTCAGTACCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GACTGCATTGGAGAGTCTCAATCTCTACTACAACTGCATCTCCTCGTTGGCAGAAGTGTTTCGGCTCCACGCCT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TAACCGAGCTCGTGGATGTGGACTTCCGGCTGAACCCCGTGGTGAAGGTTGAGCCTGACTACCGCCTTTTTGTT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GTGCACCTGCTCCCCAAGCTCCAGCAGCTGGACGATCGCCCCGTGAGAGCAAGCGAGCGGAAGGCTTCCCGACT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GCATTTTGCATCAGAGGACTCACTCGACTCCAAAGAGAGCGTCCCAGCTTCTTTGAAAGAGGGCAGACCACACC 370
Query 1 -----------------------------------------------ATGGATGCGGATGACGAGGCAGTCCTG 27
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACCCCAGAGCCAAGTGCACCGAGGCCTTGGCCAAGCAGAGCCTGGTCATGGATGCGGATGACGAGGCAGTCCTG 444
Query 28 AACCTCATTGCAGAGTGCGAGTGGGACCTCGGCAGGCCTCCCGGGAGCACGAGCTTCAGCCAGAAGGGGCGTGA 101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACCTCATTGCAGAGTGCGAGTGGGACCTCGGCAGGCCTCCCGGGAGCACGAGCTTCAGCCAGAAGGGGCGTGA 518
Query 102 GGCCGACTCTCGTGGTTCCCAAGAATCCAGACATCTGTTGAGCCCGCAGTTGGTACAGTACCAGTGTGGGGACT 175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGCCGACTCTCGTGGTTCCCAAGAATCCAGACATCTGTTGAGCCCGCAGTTGGTACAGTACCAGTGTGGGGACT 592
Query 176 CTGGGAAGCAGGGCCGTGAGACGAGGAGGAGCAGCTGCAGAGGGTGCTGTCTGGAGAAGATGCCTTGGAGCCAG 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGGGAAGCAGGGCCGTGAGACGAGGAGGAGCAGCTGCAGAGGGTGCTGTCTGGAGAAGATGCCTTGGAGCCAG 666
Query 250 CTCTGTGGAGAGCTTCCGCCACTGTACGGAGCGGAGCCAGAGGCCTCCCGTGCCCCCAGGCCACACACGTACTT 323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTCTGTGGAGAGCTTCCGCCACTGTACGGAGCGGAGCCAGAGGCCTCCCGTGCCCCCAGGCCACACACGTACTT 740
Query 324 CACCCCACACCCAGACTCCATGGATACCGAGGACTCGGCCTCTTCTCAGAAGTTGGATTTGTCAGGAGAAATGG 397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CACCCCACACCCAGACTCCATGGATACCGAGGACTCGGCCTCTTCTCAGAAGTTGGATTTGTCAGGAGAAATGG 814
Query 398 TGCCTGGTCCCCTGCCAGCCCCCGGAAAGTGCAGGAAGCGAAGAATGCCTGTTGGAAGATTCCAGACGTTTTCG 471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCCTGGTCCCCTGCCAGCCCCCGGAAAGTGCAGGAAGCGAAGAATGCCTGTTGGAAGATTCCAGACGTTTTCG 888
Query 472 GACCAGGAGGGTTTGGGCTGCCCGGAGAGAACTCATGGGTCCTCCGTGCCCAAGGAGAGCCTGAGCAGACAGGA 545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GACCAGGAGGGTTTGGGCTGCCCGGAGAGAACTCATGGGTCCTCCGTGCCCAAGGAGAGCCTGAGCAGACAGGA 962
Query 546 CAGCTCAGAAAGCAGGAACGGGAGGACCTTGTCTCAGCCTGAGGCCTCGGAGACTGAGGAGCAGAGGTCTCGGG 619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAGCTCAGAAAGCAGGAACGGGAGGACCTTGTCTCAGCCTGAGGCCTCGGAGACTGAGGAGCAGAGGTCTCGGG 1036
Query 620 GTGTGACCGACACCAGAGAGCCGTCTCCCGGGTCACACTCGGCTCTACCCGGGAAGAAGACGGCCCTGCAGGCG 693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTGTGACCGACACCAGAGAGCCGTCTCCCGGGTCACACTCGGCTCTACCCGGGAAGAAGACGGCCCTGCAGGCG 1110
Query 694 GCGCTCCTGGAGACGCTCTTGGACCTGGTGGACAGGAGCTGGGGCGGCTGCAGGTCCCTGCACAGCAACGAGGC 767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCGCTCCTGGAGACGCTCTTGGACCTGGTGGACAGGAGCTGGGGCGGCTGCAGGTCCCTGCACAGCAACGAGGC 1184
Query 768 ATTCCTTGCTCAGGCAAGACACATCTTGTCATCTGTTGAAGAATTCACAGCAGCTCAGGACAGCTCTGCGATGG 841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATTCCTTGCTCAGGCAAGACACATCTTGTCATCTGTTGAAGAATTCACAGCAGCTCAGGACAGCTCTGCGATGG 1258
Query 842 TGGGTGAAGATGTCGGCTCCCTGGCTCTGGAGAGTAAGTCCCTGCAAAGCCGCCTTGCTGAGCAGCAGCAGCAG 915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGGTGAAGATGTCGGCTCCCTGGCTCTGGAGAGTAAGTCCCTGCAAAGCCGCCTTGCTGAGCAGCAGCAGCAG 1332
Query 916 CACGCCCGGGAGATGAGCGAGGTGACGGCGGAGCTGCACCACACACACAAGGAGCTGGATGATTTGAGACAACA 989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CACGCCCGGGAGATGAGCGAGGTGACGGCGGAGCTGCACCACACACACAAGGAGCTGGATGATTTGAGACAACA 1406
Query 990 TTTAGATAAATCTTTGGAAGAGAACAGTAGGTTAAAATCGCTTTTGTTGAGTATGAAAAAGGAAGTGAAGAGTG 1063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TTTAGATAAATCTTTGGAAGAGAACAGTAGGTTAAAATCGCTTTTGTTGAGTATGAAAAAGGAAGTGAAGAGTG 1480
Query 1064 CAGACACTGCAGCCACGTTAAATTTGCAGATCGCTGGACTTCAAACAAGTGTGAAGAGGCTGTGTGGCGAGATT 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGACACTGCAGCCACGTTAAATTTGCAGATCGCTGGACTTCAAACAAGTGTGAAGAGGCTGTGTGGCGAGATT 1554
Query 1138 GTGGAACTGAAGCAGCACCTGGAGCACTACGACAAGATCCAGGAGCTCACGCAGATGCTGCAGGAGAGCCACAG 1211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTGGAACTGAAGCAGCACCTGGAGCACTACGACAAGATCCAGGAGCTCACGCAGATGCTGCAGGAGAGCCACAG 1628
Query 1212 CTCCCTGGTCAGCACCAATGAACACCTGCTGCAGGAGCTGAGCCAGGTGCGGGCGCAGCACAGAGCCGAGGTGG 1285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CTCCCTGGTCAGCACCAATGAACACCTGCTGCAGGAGCTGAGCCAGGTGCGGGCGCAGCACAGAGCCGAGGTGG 1702
Query 1286 AGCAGATGCACTGGAGCTACCAGGAGCTCAAGAAGACCATGGCCCTGTTTCCACACAGCAGCGCCAGCCATGGA 1359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGCAGATGCACTGGAGCTACCAGGAGCTCAAGAAGACCATGGCCCTGTTTCCACACAGCAGCGCCAGCCATGGA 1776
Query 1360 GGCTGCCAGGCCTGC 1374
|||||||||||||||
Sbjct 1777 GGCTGCCAGGCCTGC 1791
