Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15920
• Subject: NM_001172428.1
• Aligned Length: 502
• Identities: 417
• Gaps: 74

Alignment

Query   1  ATG-------CTGGGAGG--------------------GACTGATTGCAGAACCTTCTTG-------ACAAGCC  40
           |||       |||||..|                    |||.||  |.||||.|||..||       |.||||.
Sbjct   1  ATGGCAGCCTCTGGGGTGGAGAAGAGCAGCAAGAAGAAGACCGA--GAAGAAACTTGCTGCTCGGGAAGAAGCT  72

Query  41  A-------------------------CATAAATCTAA-----------AGAAAACGTTGTGTGACGTGATCCTC  78
           |                         |||.||  |||           ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  73  AAATTGTTGGCGGGTTTCATGGGCGTCATGAA--TAACATGCGGAAACAGAAAACGTTGTGTGACGTGATCCTC  144

Query  79  ATGGTCCAGGAAAGAAAGATACCTGCTCATCGTGTTGTTCTTGCTGCAGCCAGTCATTTTTTTAACTTAATGTT  152
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145  ATGGTCCAGGAAAGAAAGATACCTGCTCATCGTGTTGTTCTTGCTGCAGCCAGTCATTTTTTTAACTTAATGTT  218

Query 153  CACAACTAACATGCTTGAATCAAAGTCCTTTGAAGTAGAACTCAAAGATGCTGAACCTGATATTATTGAACAAC  226
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 219  CACAACTAACATGCTTGAATCAAAGTCCTTTGAAGTAGAACTCAAAGATGCTGAACCTGATATTATTGAACAAC  292

Query 227  TGGTGGAATTTGCTTATACTGCTAGAATTTCCGTGAATAGCAACAATGTTCAGTCTTTGTTGGATGCAGCAAAC  300
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 293  TGGTGGAATTTGCTTATACTGCTAGAATTTCCGTGAATAGCAACAATGTTCAGTCTTTGCTGGATGCAGCAAAC  366

Query 301  CAATATCAGATTGAACCTGTGAAGAAAATGTGTGTTGATTTTTTGAAAGAACAAGTTGATGCTTCAAATTGTCT  374
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367  CAATATCAGATTGAACCTGTGAAGAAAATGTGTGTTGATTTTTTGAAAGAACAAGTTGATGCTTCAAATTGTCT  440

Query 375  TGGAGAAGCAGAAAAAGTTGATCAGAGCCTTCCAGAGTGTGGTATGCTTTTCACTGTG  432
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441  TGGAGAAGCAGAAAAAGTTGATCAGAGCCTTCCAGAGTGTGGTATGCTTTTCACTGTG  498