Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15923
- Subject:
- XM_005271613.4
- Aligned Length:
- 1482
- Identities:
- 1004
- Gaps:
- 477
Alignment
Query 1 AT------GGATCCTGACAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCGATGTCAAACCCCTGCGCAAACCCCGTATCCC 68
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTACAGGATCCTGACAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCGATGTCAAACCCCTGCGCAAACCCCGTATCCC 74
Query 69 CATGGAGACCTTCAGAAAGGTGGGGATCCCCATCATCATAGCACTACTGAGCCTGGCGAGTATCATCATTGTGG 142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATGGAGACCTTCAGAAAGGTGGGGATCCCCATCATCATAGCACTACTGAGCCTGGCGAGTATCATCATTGTGG 148
Query 143 TTGTCCTCATCAAGGTGATTCTGGATAAATACTACTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAG 216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTGTCCTCATCAAGGTGATTCTGGATAAATACTACTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAG 222
Query 217 CAGCTGTGTGACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAGAGCTTCCCCGAAGG 290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGCTGTGTGACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAGAGCTTCCCCGAAGG 296
Query 291 GCCTGCAGTGGCAGTCCGCCTCTCCAAGGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGT 364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCTGCAGTGGCAGTCCGCCTCTCCAAGGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGT 370
Query 365 TCTCTGCCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGGCAGATGGGCTACAGCAGCAAA 438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTCTGCCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGGCAGATGGGCTACAGCAGCAAA 444
Query 439 CCCACTTTCAGAGCTGTGGAGATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCCAGGA 512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCCACTTTCAGAGCTGTGGAGATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCCAGGA 518
Query 513 GCTTCGCATGCGGAACTCAAGTGGGCCCTGTCTCTCAGGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGCCTGTGGGA 586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTTCGCATGCGGAACTCAAGTGGGCCCTGTCTCTCAGGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGCCTGTGGGA 592
Query 587 AGAGCCTGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGGGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTTGGCCTTGGCAGGTCAGCATC 660
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAGCCTGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGTGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTTGGCCTTGGCAGGTCAGCATC 666
Query 661 CAGTACGACAAACAGCACGTCTGTGGAGGGAGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTT 734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGTACGACAAACAGCACGTCTGTGGAGGGAGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTT 740
Query 735 CAGGAAACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAGACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGG 808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGGAAACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAGACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGG 814
Query 809 CTGTGGCCAAGATCATCATCATTGAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCTG 882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGTGGCCAAGATCATCATCATTGAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCTG 888
Query 883 CAGTTCCCACTCACTTTCTCAGGCACAGTCAGGCCCATCTGTCTGCCCTTCTTTGATGAGGAGCTCACTCCAGC 956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAGTTCCCACTCACTTTCTCAGGCACAGTCAGGCCCATCTGTCTGCCCTTCTTTGATGAGGAGCTCACTCCAGC 962
Query 957 CACCCCACTCTGGATCATTGGATGGGGCTTTACGAAGCAGAATGGAGGG------------------------- 1005
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CACCCCACTCTGGATCATTGGATGGGGCTTTACGAAGCAGAATGGAGGGAAGATGTCTGACATACTGCTGCAGG 1036
Query 1006 -------------------------------------------------------------------------- 1005
Sbjct 1037 CGTCAGTCCAGGTCATTGACAGCACACGGTGCAATGCAGACGATGCGTACCAGGGGGAAGTCACCGAGAAGATG 1110
Query 1006 -------------------------------------------------------------------------- 1005
Sbjct 1111 ATGTGTGCAGGCATCCCGGAAGGGGGTGTGGACACCTGCCAGGGTGACAGTGGTGGGCCCCTGATGTACCAATC 1184
Query 1006 -------------------------------------------------------------------------- 1005
Sbjct 1185 TGACCAGTGGCATGTGGTGGGCATCGTTAGTTGGGGCTATGGCTGCGGGGGCCCGAGCACCCCAGGAGTATACA 1258
Query 1006 -------------------------------------------------------------------------- 1005
Sbjct 1259 CCAAGGTCTCAGCCTATCTCAACTGGATCTACAATGTCTGGAAGGATAGAACTATTCAGAGAAGCTGTAACTCC 1332
Query 1006 -------------------------------------------------------------------------- 1005
Sbjct 1333 CCAGGGACAGGTCTTGTGATTCAGCAACCAGCTGTACCGCTGATGGAGCTACGGTCAGCTCGGCACACACATCG 1406
Query 1006 -------------------------------------------------------------------------- 1005
Sbjct 1407 CCTGACCACCTGTGTTTGCTTTCTCTCATTCCCTGCCTTACAGCCCCTGTCCCCCTTATGCCCATTTCCCTGGG 1480
Query 1006 -- 1005
Sbjct 1481 AT 1482