Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15939
• Subject: NM_001366083.1
• Aligned Length: 1362
• Identities: 951
• Gaps: 411

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGTCCAAAGTCACAGATGCTATAGTCTGGTATCAAAAGAAGATTGGAGCATATGATCAACAAATATGGGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AAAATCTGTTGAACAGAGAGAAATCAAGGGGCTAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCACATGTGAAACCAGACC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TCATAGATGTTGATCTTGTAAGAGGGTCTGCATTTGCAAAGGCAAAGCCTGAAAGTCCTTGGACTTCTCTGACC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  AGAAAGGGAATTGTTCGAGTTGTATTTTTCCCCTTTTTCTTCCGGTGGTGGTTACAAGTAACATCAAAGGTCAT  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  CTTTTTCTGGCTTCTTGTCCTTTATCTTCTTCAAGTTGCTGCAATAGTATTATTCTGCTCCACTTCTAGCCCAC  370

Query    1  -----------------------------------------ATGCTGCTCCTGGGAACTGTGCATTGCCAGATT  33
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAGCATACCTCTGACAGAGGTGATTGGGCCGATATGGCTGATGCTGCTCCTGGGAACTGTGCATTGCCAGATT  444

Query   34  GTTTCCACAAGAACACCCAAACCTCCTCTAAGTACAGGGGGTAAAAGAAGAAGGAAATTAAGAAAAGCAGCCCA  107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTTCCACAAGAACACCCAAACCTCCTCTAAGTACAGGGGGTAAAAGAAGAAGGAAATTAAGAAAAGCAGCCCA  518

Query  108  TTTGGAAGTACATAGGGAAGGAGATGGTTCTAGTACCACAGATAACACACAAGAGGGAGCAGTTCAGAACCACG  181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTGGAAGTACATAGGGAAGGAGATGGTTCTAGTACCACAGATAACACACAAGAGGGAGCAGTTCAGAACCACG  592

Query  182  GTACAAGCACCTCTCACAGCGTTGGCACTGTCTTCAGAGATCTCTGGCATGCTGCTTTCTTTTTATCAGGATCA  255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTACAAGCACCTCTCACAGCGTTGGCACTGTCTTCAGAGATCTCTGGCATGCTGCTTTCTTTTTATCAGGATCA  666

Query  256  AAGAAAGCAAAGAATTCAATTGATAAATCAACTGAAACTGACAATGGCTATGTATCCCTTGATGGGAAGAAGAC  329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGAAAGCAAAGAATTCAATTGATAAATCAACTGAAACTGACAATGGCTATGTATCCCTTGATGGGAAGAAGAC  740

Query  330  TGTTAAAAGCGGTGAAGATGGAATACAAAACCATGAACCTCAGTGTGAAACTATTCGACCAGAAGAGACAGCCT  403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTTAAAAGCGGTGAAGATGGAATACAAAACCATGAACCTCAGTGTGAAACTATTCGACCAGAAGAGACAGCCT  814

Query  404  GGAACACAGGAACACTGAGGAATGGTCCTAGCAAAGATACCCAAAGGACAATAACAAATGTCTCTGATGAAGTC  477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGAACACAGGAACACTGAGGAATGGTCCTAGCAAAGATACCCAAAGGACAATAACAAATGTCTCTGATGAAGTC  888

Query  478  TCCAGTGAGGAAGGTCCTGAAACAGGATACTCATTACGTCGTCATGTGGACAGGACTTCTGAAGGTGTTCTTCG  551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCAGTGAGGAAGGTCCTGAAACAGGATACTCATTACGTCGTCATGTGGACAGGACTTCTGAAGGTGTTCTTCG  962

Query  552  GAATAGAAAGTCACACCATTATAAGAAACATTACCCTAATGAGGACGCCCCTAAATCGGGTACTAGTTGCAGCT  625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAATAGAAAGTCACACCATTATAAGAAACATTACCCTAATGAGGACGCCCCTAAATCGGGTACTAGTTGCAGCT  1036

Query  626  CTCGCTGTTCAAGTTCCAGACAGGATTCTGAGAGTGCAAGGCCAGAATCTGAAACAGAAGATGTGTTATGGGAA  699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCGCTGTTCAAGTTCCAGACAGGATTCTGAGAGTGCAAGGCCAGAATCTGAAACAGAAGATGTGTTATGGGAA  1110

Query  700  GACTTGTTACATTGTGCAGAATGCCATTCATCTTGTACCAGTGAGACAGATGTGGAAAATCATCAGATTAATCC  773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACTTGTTACATTGTGCAGAATGCCATTCATCTTGTACCAGTGAGACAGATGTGGAAAATCATCAGATTAATCC  1184

Query  774  ATGTGTGAAAAAAGAATATAGAGATGACCCTTTTCATCAGAGTCATTTGCCCTGGCTCCATAGTTCCCACCCAG  847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATGTGTGAAAAAAGAATATAGAGATGACCCTTTTCATCAGAGTCATTTGCCCTGGCTCCATAGTTCCCACCCAG  1258

Query  848  GATTAGAAAAAATAAGTGCTATAGTATGGGAAGGTAATGATTGTAAGAAAGCAGACATGTCTGTACTTGAAATC  921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GATTAGAAAAAATAAGTGCTATAGTATGGGAAGGTAATGATTGTAAGAAAGCAGACATGTCTGTACTTGAAATC  1332

Query  922  AGTGGAATGATAATGAACAGAGTGAGTTTT  951
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGTGGAATGATAATGAACAGAGTGAGTTTT  1362