Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15941
• Subject: NM_001127359.1
• Aligned Length: 1068
• Identities: 1055
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCAAAGTCACAGATGCTATAGTCTGGTATCAAAAGAAGATTGGAGCATATGATCAACAAATATGGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCAAAGTCACAGATGCTATAGTCTGGTATCAAAAGAAGATTGGAGCATATGATCAACAAATATGGGA  74

Query   75  AAAATCTGTTGAACAGAGAGAAATCAA------------GGGGCTAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCACATG  136
            |||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAAATCTGTTGAACAGAGAGAAATCAAGTTTATTAAACTGGGGCTAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCACATG  148

Query  137  TGAAACCAGACCTCATAGATGTTGATCTTGTAAGAGGGTCTGCATTTGCAAAGGCAAAGCCTGAAAGTCCTTGG  210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAAACCAGACCTCATAGATGTTGATCTTGTAAGAGGGTCTGCATTTGCAAAGGCAAAGCCTGAAAGTCCTTGG  222

Query  211  ACTTCTCTGACCAGAAAGGGAATTGTTCGAGTTGTATTTTTCCCCTTTTTCTTCCGGTGGTGGTTACAAGTAAC  284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTTCTCTGACCAGAAAGGGAATTGTTCGAGTTGTATTTTTCCCCTTTTTCTTCCGGTGGTGGTTACAAGTAAC  296

Query  285  ATCAAAGGTCATCTTTTTCTGGCTTCTTGTCCTTTATCTTCTTCAAGTTGCTGCAATAGTATTATTCTGCTCCA  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCAAAGGTCATCTTTTTCTGGCTTCTTGTCCTTTATCTTCTTCAAGTTGCTGCAATAGTATTATTCTGCTCCA  370

Query  359  CTTCTAGCCCACACAGCATACCTCTGACAGAGGTGATTGGGCCGATATGGCTGATGCTGCTCCTGGGAACTGTG  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTTCTAGCCCACACAGCATACCTCTGACAGAGGTGATTGGGCCGATATGGCTGATGCTGCTCCTGGGAACTGTG  444

Query  433  CATTGCCAGATTGTTTCCACAAGAACACCCAAACCTCCTCTAAGTACAGGGGGTAAAAGAAGAAGGAAATTAAG  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATTGCCAGATTGTTTCCACAAGAACACCCAAACCTCCTCTAAGTACAGGGGGTAAAAGAAGAAGGAAATTAAG  518

Query  507  AAAAGCAGCCCATTTGGAAGTACATAGGGAAGGAGATGGTTCTAGTACCACAGATAACACACAAGAGGGAGCAG  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAAGCAGCCCATTTGGAAGTACATAGGGAAGGAGATGGTTCTAGTACCACAGATAACACACAAGAGGGAGCAG  592

Query  581  TTCAGAACCACGGTACAAGCACCTCTCACAGCGTTGGCACTGTCTTCAGAGATCTCTGGCATGCTGCTTTCTTT  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCAGAACCACGGTACAAGCACCTCTCACAGCGTTGGCACTGTCTTCAGAGATCTCTGGCATGCTGCTTTCTTT  666

Query  655  TTATCAGGATCAAAGAAAGCAAAGAATTCAATTGATAAATCAACTGAAACTGACAATGGCTATGTATCCCTTGA  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTATCAGGATCAAAGAAAGCAAAGAATTCAATTGATAAATCAACTGAAACTGACAATGGCTATGTATCCCTTGA  740

Query  729  TGGGAAGAAGACTGTTAAAAGCGGTGAAGATGGAATACAAAACCATGAACCTCAGTGTGAAACTATTCGACCAG  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGGAAGAAGACTGTTAAAAGCGGTGAAGATGGAATACAAAACCATGAACCTCAGTGTGAAACTATTCGACCAG  814

Query  803  AAGAGACAGCCTGGAACACAGGAACACTGAGGAATGGTCCTAGCAAAGATACCCAAAGGACAATAACAAATGTC  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGAGACAGCCTGGAACACAGGAACACTGAGGAATGGTCCTAGCAAAGATACCCAAAGGACAATAACAAATGTC  888

Query  877  TCTGATGAAGTCTCCAGTGAGGAAGGTCCTGAAACAGGATACTCATTACGTCGTCATGTGGACAGGACTTCTGA  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTGATGAAGTCTCCAGTGAGGAAGGTCCTGAAACAGGATACTCATTACGTCGTCATGTGGACAGGACTTCTGA  962

Query  951  AGGTGTTCTTCGGAATAGAAAGTCACACCATTATAAGAAACATTACCCTAATGAGGTATATACTTTGTCCTTAA  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGTGTTCTTCGGAATAGAAAGTCACACCATTATAAGAAACATTACCCTAATGAGGTATATACTTTGTCCTTAA  1036

Query 1025  GTGTATACATACATATCTATTTTATATGTTAC  1056
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGTATACATACGTATCTATTTTATATGTTAC  1068