Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_16018
• Subject: NM_001130091.2
• Aligned Length: 1576
• Identities: 1353
• Gaps: 212

Alignment

Query    1  ATGAACCAGCCGTGCAACTCGATGGAGCCGAGGGTGATGGACGATGACATGCTCAAGCTGGCCGTCGGGGACCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCAGCCGTGCAACTCGATGGAGCCGAGGGTGATGGACGATGACATGCTCAAGCTGGCCGTCGGGGACCA  74

Query   75  GGGCCCCCAGGAGGAGGCCGGGCAGCTGGCCAAGCAGGAGGGCATCCTCTTCAAGGATGTCCTGTCCCTGCAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCCCCCAGGAGGAGGCCGGGCAGCTGGCCAAGCAGGAGGGCATCCTCTTCAAGGATGTCCTGTCCCTGCAGC  148

Query  149  TGGACTTTCGGAACATCCTCCGCATAGACAACCTCTGGCAGTTTGAGAACTTGAGGAAGCTGCAGCTGGACAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGACTTTCGGAACATCCTCCGCATAGACAACCTCTGGCAGTTTGAGAACTTGAGGAAGCTGCAGCTGGACAAT  222

Query  223  AACATCATTGAGAAGATCGAGGGCCTGGAGAACCTCGCACACCTGGTCTGGCTGGATCTGTCTTTCAACAACAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACATCATTGAGAAGATCGAGGGCCTGGAGAACCTCGCACACCTGGTCTGGCTGGATCTGTCTTTCAACAACAT  296

Query  297  TGAGACCATCGAGGGGCTGGACACACTGGTGAACCTGGAGGACCTGAGCTTGTTCAACAACCGGATCTCCAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGACCATCGAGGGGCTGGACACACTGGTGAACCTGGAGGACCTGAGCTTGTTCAACAACCGGATCTCCAAGA  370

Query  371  TCGACTCCCTGGACGCCCTCGTCAAGCTGCAGGTGTTGTCGCTGGGCAACAACCGGATTGACAACATGATGAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCGACTCCCTGGACGCCCTCGTCAAGCTGCAGGTGTTGTCGCTGGGCAACAACCGGATTGACAACATGATGAAC  444

Query  445  ATCATCTACCTTCGGCGGTTCAAGTGCCTGCGGACGCTCAGCCTCTCTAGGAACCCTATCTCTGAGGCAGAGGA  518
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCATCTACCTCCGGCGGTTCAAGTGCCTGCGGACGCTCAGCCTCTCTAGGAACCCTATCTCTGAGGCAGAGGA  518

Query  519  TTACAAGATGTTCATCTGTGCCTACCTTCCTGACCTCATGTACCTGGACTACTGGCGCATTGATGACCACACAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTACAAGATGTTCATCTGTGCCTACCTTCCTGACCTCATGTACCTGGACTACCGGCGCATTGATGACCACACAA  592

Query  593  AAAAGCTTGCGGAGGCTAAGCACCAGTACAGCATCGACGAGCTGAAGCACCAGGAGAACCTGATGCAGGCCCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAAGCTTGCGGAGGCTAAGCACCAGTACAGCATCGACGAGCTGAAGCACCAGGAGAACCTGATGCAGGCCCAG  666

Query  667  CTGGAGGACGAGCAGGCGCAGCGGGAGGAGCTAGAGAAGCACAAGACTGCGTTTGTGGAACACCTGAATGGCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGGAGGACGAGCAGGCGCAGCGGGAGGAGCTAGAGAAGCACAAGACTGCGTTTGTGGAACACCTGAATGGCTC  740

Query  741  CTTCCTGTTTGACAGCATGTACGCTGAGGACTCAGAGGGCAACAATCTGTCCTACCTGCCTGGTGTCGGTGAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTCCTGTTTGACAGCATGTACGCTGAGGACTCAGAGGGCAACAATCTGTCCTACCTGCCTGGTGTCGGTGAGC  814

Query  815  TCCTTGAGACCTACAAGGACAAGTTTGTCATCATCTGCGTGAATATTTTTGAGTATGGCCTGAAACAGCAGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCTTGAGACCTACAAGGACAAGTTTGTCATCATCTGCGTGAATATTTTTGAGTATGGCCTGAAACAGCAGGAG  888

Query  889  AAGCGGAAAACAGAGCTTGACACCTTCAGTGAATGTGTCCGTGAGGCCATCCAGGAAAACCAGGAGCAGGGCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGCGGAAAACAGAGCTTGACACCTTCAGTGAATGTGTCCGTGAGGCCATCCAGGAAAACCAGGAGCAGGGCAA  962

Query  963  ACGCAAGATTGCCAAATTCGAGGAGAAGCACTTGTCGAGTTTAAGTGCCATTCGAGAGGAGTTGGAACTGCCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACGCAAGATTGCCAAATTCGAGGAGAAGCACTTGTCGAGTTTAAGTGCCATTCGAGAGGAGTTGGAACTGCCCA  1036

Query 1037  ACATTGAGAAGATGATCCTAGAATGCAGTGCTGACATCAGTGAGTTGTTCGATGCGCTCATGACGCTGGAGATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACATTGAGAAGATGATCCTAGAATGCAGTGCTGACATCAGTGAGTTGTTCGATGCGCTCATGACGCTGGAGATG  1110

Query 1111  CAGCTGGTGGAGCAGCTGGAGGAGACTATAAACATGTTTGAAAGGAACATTGTTGACATGGTAGGACTGTTTAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGCTGGTGGAGCAGCTGGAGGAGACTATAAACATGTTTGAAAGGAACATTGTTGACATGGTAGGACTGTTTAT  1184

Query 1185  CGAAAATGTCCAAAGCCTGATGGCTCAGTGCCGGGACCTGGAGAATCACCACCACGAGAAGCTCCTGGAGATCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGAAAATGTCCAAAGCCTGATGGCTCAGTGCCGGGACCTGGAGAATCACCACCACGAGAAGCTCCTGGAGATCT  1258

Query 1259  CTATCAGCACCCTGGAGAAGATTGTCGAGGGCGACCTGGACGAGGACCTGCCTAACGACCTGCGCGCGCTTTTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     .
Sbjct 1259  CTATCAGCACCCTGGAGAAGATTGTCGAGGGCGACCTGGACGAGGACCTGCCTAACGACCTGCGCGCG-----G  1327

Query 1333  GTCGAT----AAAGATACGATTGTT-AATGCTGTCGGGGCATC--GCACGACATCCACCTCCTGAAGATTGACA  1399
            ||||.|    |||         ||| |||..|||.|.|||.||  ||||  ..||                   
Sbjct 1328  GTCGTTTCCAAAA---------GTTCAATTATGTGGAGGCTTCTGGCAC--TTTC-------------------  1371

Query 1400  ATCGAGAAGATGAGCTGGTGACCAGAATCAACTCTTGGTGTACACGTTTAATAGACAGGATTCACAAGGATGAG  1473
                                                                                      
Sbjct 1372  --------------------------------------------------------------------------  1371

Query 1474  ATCATGAGGAACCGCAAGCGCGTGAAGGAGATCAATCAGTACATCGACCACATGCAGAGCGAACTGGACAACCT  1547
                                                                                      
Sbjct 1372  --------------------------------------------------------------------------  1371

Query 1548  GGAATGTGGCGACATCCTAGAC  1569
                                  
Sbjct 1372  ----------------------  1371