Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_16018
- Subject:
- XM_011524022.2
- Aligned Length:
- 1693
- Identities:
- 1353
- Gaps:
- 329
Alignment
Query 1 ATGAACCAGCCGTGCAACTCGATGGAGCCGAGGGTGATGGACGATGACATGCTCAAGCTGGCCGTCGGGGACCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAACCAGCCGTGCAACTCGATGGAGCCGAGGGTGATGGACGATGACATGCTCAAGCTGGCCGTCGGGGACCA 74
Query 75 GGGCCCCCAGGAGGAGGCCGGGCAGCTGGCCAAGCAGGAGGGCATCCTCTTCAAGGATGTCCTGTCCCTGCAGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGGCCCCCAGGAGGAGGCCGGGCAGCTGGCCAAGCAGGAGGGCATCCTCTTCAAGGATGTCCTGTCCCTGCAGC 148
Query 149 TGGACTTTCGGA------------------------------------------------------------AC 162
|||||||||||| ||
Sbjct 149 TGGACTTTCGGAGAAAAACAGCAGATGAACCCAAAGGGGAACAGGATGATGGCCAGGAGGATTCCCAGGAAGAC 222
Query 163 ATCCTCCGCATAGACAACCTCTGGCAGTTTGAGAACTTGAGGAAGCTGCAGCTGGACAATAACATCATTGAGAA 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATCCTCCGCATAGACAACCTCTGGCAGTTTGAGAACTTGAGGAAGCTGCAGCTGGACAATAACATCATTGAGAA 296
Query 237 GATCGAGGGCCTGGAGAACCTCGCACACCTGGTCTGGCTGGATCTGTCTTTCAACAACATTGAGACCATCGAGG 310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATCGAGGGCCTGGAGAACCTCGCACACCTGGTCTGGCTGGATCTGTCTTTCAACAACATTGAGACCATCGAGG 370
Query 311 GGCTGGACACACTGGTGAACCTGGAGGACCTGAGCTTGTTCAACAACCGGATCTCCAAGATCGACTCCCTGGAC 384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGCTGGACACACTGGTGAACCTGGAGGACCTGAGCTTGTTCAACAACCGGATCTCCAAGATCGACTCCCTGGAC 444
Query 385 GCCCTCGTCAAGCTGCAGGTGTTGTCGCTGGGCAACAACCGGATTGACAACATGATGAACATCATCTACCTTCG 458
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 445 GCCCTCGTCAAGCTGCAGGTGTTGTCGCTGGGCAACAACCGGATTGACAACATGATGAACATCATCTACCTCCG 518
Query 459 GCGGTTCAAGTGCCTGCGGACGCTCAGCCTCTCTAGGAACCCTATCTCTGAGGCAGAGGATTACAAGATGTTCA 532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCGGTTCAAGTGCCTGCGGACGCTCAGCCTCTCTAGGAACCCTATCTCTGAGGCAGAGGATTACAAGATGTTCA 592
Query 533 TCTGTGCCTACCTTCCTGACCTCATGTACCTGGACTACTGGCGCATTGATGACCACACA--------------- 591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCTGTGCCTACCTTCCTGACCTCATGTACCTGGACTACCGGCGCATTGATGACCACACAGCAAGTGTCTCCCTC 666
Query 592 ------------------------------------------AAAAAGCTTGCGGAGGCTAAGCACCAGTACAG 623
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCAGTCTCCCAGCCCTGTGAGACAGATTCCTCAAGCCCCCAGAAAAAGCTTGCGGAGGCTAAGCACCAGTACAG 740
Query 624 CATCGACGAGCTGAAGCACCAGGAGAACCTGATGCAGGCCCAGCTGGAGGACGAGCAGGCGCAGCGGGAGGAGC 697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CATCGACGAGCTGAAGCACCAGGAGAACCTGATGCAGGCCCAGCTGGAGGACGAGCAGGCGCAGCGGGAGGAGC 814
Query 698 TAGAGAAGCACAAGACTGCGTTTGTGGAACACCTGAATGGCTCCTTCCTGTTTGACAGCATGTACGCTGAGGAC 771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TAGAGAAGCACAAGACTGCGTTTGTGGAACACCTGAATGGCTCCTTCCTGTTTGACAGCATGTACGCTGAGGAC 888
Query 772 TCAGAGGGCAACAATCTGTCCTACCTGCCTGGTGTCGGTGAGCTCCTTGAGACCTACAAGGACAAGTTTGTCAT 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCAGAGGGCAACAATCTGTCCTACCTGCCTGGTGTCGGTGAGCTCCTTGAGACCTACAAGGACAAGTTTGTCAT 962
Query 846 CATCTGCGTGAATATTTTTGAGTATGGCCTGAAACAGCAGGAGAAGCGGAAAACAGAGCTTGACACCTTCAGTG 919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CATCTGCGTGAATATTTTTGAGTATGGCCTGAAACAGCAGGAGAAGCGGAAAACAGAGCTTGACACCTTCAGTG 1036
Query 920 AATGTGTCCGTGAGGCCATCCAGGAAAACCAGGAGCAGGGCAAACGCAAGATTGCCAAATTCGAGGAGAAGCAC 993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AATGTGTCCGTGAGGCCATCCAGGAAAACCAGGAGCAGGGCAAACGCAAGATTGCCAAATTCGAGGAGAAGCAC 1110
Query 994 TTGTCGAGTTTAAGTGCCATTCGAGAGGAGTTGGAACTGCCCAACATTGAGAAGATGATCCTAGAATGCAGTGC 1067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTGTCGAGTTTAAGTGCCATTCGAGAGGAGTTGGAACTGCCCAACATTGAGAAGATGATCCTAGAATGCAGTGC 1184
Query 1068 TGACATCAGTGAGTTGTTCGATGCGCTCATGACGCTGGAGATGCAGCTGGTGGAGCAGCTGGAGGAGACTATAA 1141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGACATCAGTGAGTTGTTCGATGCGCTCATGACGCTGGAGATGCAGCTGGTGGAGCAGCTGGAGGAGACTATAA 1258
Query 1142 ACATGTTTGAAAGGAACATTGTTGACATGGTAGGACTGTTTATCGAAAATGTCCAAAGCCTGATGGCTCAGTGC 1215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACATGTTTGAAAGGAACATTGTTGACATGGTAGGACTGTTTATCGAAAATGTCCAAAGCCTGATGGCTCAGTGC 1332
Query 1216 CGGGACCTGGAGAATCACCACCACGAGAAGCTCCTGGAGATCTCTATCAGCACCCTGGAGAAGATTGTCGAGGG 1289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CGGGACCTGGAGAATCACCACCACGAGAAGCTCCTGGAGATCTCTATCAGCACCCTGGAGAAGATTGTCGAGGG 1406
Query 1290 CGACCTGGACGAGGACCTGCCTAACGACCTGCGCGCGCTTTTTGTCGAT----AAAGATACGATTGTT-AATGC 1358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||||.| ||| ||| |||..
Sbjct 1407 CGACCTGGACGAGGACCTGCCTAACGACCTGCGCGCG-----GGTCGTTTCCAAAA---------GTTCAATTA 1466
Query 1359 TGTCGGGGCATC--GCACGACATCCACCTCCTGAAGATTGACAATCGAGAAGATGAGCTGGTGACCAGAATCAA 1430
|||.|.|||.|| |||| ..||
Sbjct 1467 TGTGGAGGCTTCTGGCAC--TTTC-------------------------------------------------- 1488
Query 1431 CTCTTGGTGTACACGTTTAATAGACAGGATTCACAAGGATGAGATCATGAGGAACCGCAAGCGCGTGAAGGAGA 1504
Sbjct 1489 -------------------------------------------------------------------------- 1488
Query 1505 TCAATCAGTACATCGACCACATGCAGAGCGAACTGGACAACCTGGAATGTGGCGACATCCTAGAC 1569
Sbjct 1489 ----------------------------------------------------------------- 1488