Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_16018
• Subject: XM_024450965.1
• Aligned Length: 1626
• Identities: 1567
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGAACCAGCCGTGCAACTCGATGGAGCCGAGGGTGATGGACGATGACATGCTCAAGCTGGCCGTCGGGGACCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCAGCCGTGCAACTCGATGGAGCCGAGGGTGATGGACGATGACATGCTCAAGCTGGCCGTCGGGGACCA  74

Query   75  GGGCCCCCAGGAGGAGGCCGGGCAGCTGGCCAAGCAGGAGGGCATCCTCTTCAAGGATGTCCTGTCCCTGCAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCCCCCAGGAGGAGGCCGGGCAGCTGGCCAAGCAGGAGGGCATCCTCTTCAAGGATGTCCTGTCCCTGCAGC  148

Query  149  TGGACTTTCGGAACATCCTCCGCATAGACAACCTCTGGCAGTTTGAGAACTTGAGGAAGCTGCAGCTGGACAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGACTTTCGGAACATCCTCCGCATAGACAACCTCTGGCAGTTTGAGAACTTGAGGAAGCTGCAGCTGGACAAT  222

Query  223  AACATCATTGAGAAGATCGAGGGCCTGGAGAACCTCGCACACCTGGTCTGGCTGGATCTGTCTTTCAACAACAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACATCATTGAGAAGATCGAGGGCCTGGAGAACCTCGCACACCTGGTCTGGCTGGATCTGTCTTTCAACAACAT  296

Query  297  TGAGACCATCGAGGGGCTGGACACACTGGTGAACCTGGAGGACCTGAGCTTGTTCAACAACCGGATCTCCAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGACCATCGAGGGGCTGGACACACTGGTGAACCTGGAGGACCTGAGCTTGTTCAACAACCGGATCTCCAAGA  370

Query  371  TCGACTCCCTGGACGCCCTCGTCAAGCTGCAGGTGTTGTCGCTGGGCAACAACCGGATTGACAACATGATGAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCGACTCCCTGGACGCCCTCGTCAAGCTGCAGGTGTTGTCGCTGGGCAACAACCGGATTGACAACATGATGAAC  444

Query  445  ATCATCTACCTTCGGCGGTTCAAGTGCCTGCGGACGCTCAGCCTCTCTAGGAACCCTATCTCTGAGGCAGAGGA  518
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCATCTACCTCCGGCGGTTCAAGTGCCTGCGGACGCTCAGCCTCTCTAGGAACCCTATCTCTGAGGCAGAGGA  518

Query  519  TTACAAGATGTTCATCTGTGCCTACCTTCCTGACCTCATGTACCTGGACTACTGGCGCATTGATGACCACACA-  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| 
Sbjct  519  TTACAAGATGTTCATCTGTGCCTACCTTCCTGACCTCATGTACCTGGACTACCGGCGCATTGATGACCACACAG  592

Query  592  --------------------------------------------------------AAAAAGCTTGCGGAGGCT  609
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAAGTGTCTCCCTCTCAGTCTCCCAGCCCTGTGAGACAGATTCCTCAAGCCCCCAGAAAAAGCTTGCGGAGGCT  666

Query  610  AAGCACCAGTACAGCATCGACGAGCTGAAGCACCAGGAGAACCTGATGCAGGCCCAGCTGGAGGACGAGCAGGC  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGCACCAGTACAGCATCGACGAGCTGAAGCACCAGGAGAACCTGATGCAGGCCCAGCTGGAGGACGAGCAGGC  740

Query  684  GCAGCGGGAGGAGCTAGAGAAGCACAAGACTGCGTTTGTGGAACACCTGAATGGCTCCTTCCTGTTTGACAGCA  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCAGCGGGAGGAGCTAGAGAAGCACAAGACTGCGTTTGTGGAACACCTGAATGGCTCCTTCCTGTTTGACAGCA  814

Query  758  TGTACGCTGAGGACTCAGAGGGCAACAATCTGTCCTACCTGCCTGGTGTCGGTGAGCTCCTTGAGACCTACAAG  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTACGCTGAGGACTCAGAGGGCAACAATCTGTCCTACCTGCCTGGTGTCGGTGAGCTCCTTGAGACCTACAAG  888

Query  832  GACAAGTTTGTCATCATCTGCGTGAATATTTTTGAGTATGGCCTGAAACAGCAGGAGAAGCGGAAAACAGAGCT  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACAAGTTTGTCATCATCTGCGTGAATATTTTTGAGTATGGCCTGAAACAGCAGGAGAAGCGGAAAACAGAGCT  962

Query  906  TGACACCTTCAGTGAATGTGTCCGTGAGGCCATCCAGGAAAACCAGGAGCAGGGCAAACGCAAGATTGCCAAAT  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACACCTTCAGTGAATGTGTCCGTGAGGCCATCCAGGAAAACCAGGAGCAGGGCAAACGCAAGATTGCCAAAT  1036

Query  980  TCGAGGAGAAGCACTTGTCGAGTTTAAGTGCCATTCGAGAGGAGTTGGAACTGCCCAACATTGAGAAGATGATC  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGAGGAGAAGCACTTGTCGAGTTTAAGTGCCATTCGAGAGGAGTTGGAACTGCCCAACATTGAGAAGATGATC  1110

Query 1054  CTAGAATGCAGTGCTGACATCAGTGAGTTGTTCGATGCGCTCATGACGCTGGAGATGCAGCTGGTGGAGCAGCT  1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTAGAATGCAGTGCTGACATCAGTGAGTTGTTCGATGCGCTCATGACGCTGGAGATGCAGCTGGTGGAGCAGCT  1184

Query 1128  GGAGGAGACTATAAACATGTTTGAAAGGAACATTGTTGACATGGTAGGACTGTTTATCGAAAATGTCCAAAGCC  1201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGGAGACTATAAACATGTTTGAAAGGAACATTGTTGACATGGTAGGACTGTTTATCGAAAATGTCCAAAGCC  1258

Query 1202  TGATGGCTCAGTGCCGGGACCTGGAGAATCACCACCACGAGAAGCTCCTGGAGATCTCTATCAGCACCCTGGAG  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGATGGCTCAGTGCCGGGACCTGGAGAATCACCACCACGAGAAGCTCCTGGAGATCTCTATCAGCACCCTGGAG  1332

Query 1276  AAGATTGTCGAGGGCGACCTGGACGAGGACCTGCCTAACGACCTGCGCGCGCTTTTTGTCGATAAAGATACGAT  1349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGATTGTCGAGGGCGACCTGGACGAGGACCTGCCTAACGACCTGCGCGCGCTTTTTGTCGATAAAGATACGAT  1406

Query 1350  TGTTAATGCTGTCGGGGCATCGCACGACATCCACCTCCTGAAGATTGACAATCGAGAAGATGAGCTGGTGACCA  1423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGTTAATGCTGTCGGGGCATCGCACGACATCCACCTCCTGAAGATTGACAATCGAGAAGATGAGCTGGTGACCA  1480

Query 1424  GAATCAACTCTTGGTGTACACGTTTAATAGACAGGATTCACAAGGATGAGATCATGAGGAACCGCAAGCGCGTG  1497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAATCAACTCTTGGTGTACACGTTTAATAGACAGGATTCACAAGGATGAGATCATGAGGAACCGCAAGCGCGTG  1554

Query 1498  AAGGAGATCAATCAGTACATCGACCACATGCAGAGCGAACTGGACAACCTGGAATGTGGCGACATCCTAGAC  1569
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGGAGATCAATCAGTACATCGACCACATGCAGAGCGAACTGGACAACCTGGAATGTGGCGACATCCTAGAC  1626