Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_16028
• Subject: XM_024453169.1
• Aligned Length: 1217
• Identities: 1055
• Gaps: 118

Alignment

Query    1  ATGAATGAAAAATCTTGCTCTTTCCATAGTAAAGAAGAATTAAGAGATGGACAGGGTGAAAGATTGTCTGCTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAATGAAAAATCTTGCTCTTTCCATAGTAAAGAAGAATTAAGAGATGGACAGGGTGAAAGATTGTCTGCTGG  74

Query   75  ATATTCTCCATCATATGACAAGGACAAGAGTGTTCTGGCTTTCAGAGGAATCCCTATCTCAGAGTTGAAGAACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATATTCTCCATCATATGACAAGGACAAGAGTGTTCTGGCTTTCAGAGGAATCCCTATCTCAGAGTTGAAGAACC  148

Query  149  ATGGCATTCTCCAGGCTCTGACCACAGAAGCTTATGAATGGGAGCCACGTGTTGTGAGTACAGAGGTGGTCAGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGGCATTCTCCAGGCTCTGACCACAGAAGCTTATGAATGGGAGCCACGTGTTGTGAGTACAGAGGTGGTCAGA  222

Query  223  GCCCAAGAAGAATGGGAAGCTGTGGACACCATCCAGCCAGAGACAGGGAGCCAAGCTAGCTCAGAGCAGCCTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCCAAGAAGAATGGGAAGCTGTGGACACCATCCAGCCAGAGACAGGGAGCCAAGCTAGCTCAGAGCAGCCTGG  296

Query  297  GCAGCTAATCTCCTTCAGTGAGGCCCTGCAGCACTTCCAGACTGTGGACCTTTCCCCCTTCAAGAAAAGAATCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGCTAATCTCCTTCAGTGAGGCCCTGCAGCACTTCCAGACTGTGGACCTTTCCCCCTTCAAGAAAAGAATCC  370

Query  371  AGCCAACTATTCGAAGGACTGGGCTCGCCGCCCTCCGACACTACCTCTTCGGGCCTCCAAAGCTCCACCAGCGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCCAACTATTCGAAGGACTGGGCTCGCCGCCCTCCGACACTACCTCTTCGGGCCTCCAAAGCTCCACCAGCGC  444

Query  445  CTTCGGGAAGAAAGGGACTTGGTCCTGACCATTGCTCAGTGTGGCCTGGATAGCCAAGACCCAGTGCATGGCCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTCGGGAAGAAAGGGACTTGGTCCTGACCATTGCTCAGTGTGGCCTGGATAGCCAAGACCCAGTGCATGGCCG  518

Query  519  AGTCCTCCAGACCATCTATAAGAAGCTGACCGGCTCCAAGTTTGACTGTGCCCTTCATGGAAACCACTGGGAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTCCTCCAGACCATCTATAAGAAGCTGACCGGCTCCAAGTTTGACTGTGCCCTTCATGGAAACCACTGGGAGG  592

Query  593  ACCTGGGCTTTCAGGGAGCGAATCCAGCCACAGACCTGAGAGGCGCAGGCTTCCTTGCCCTCCTGCATCTGCTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTGGGCTTTCAGGGAGCGAATCCAGCCACAGACCTGAGAGGCGCAGGCTTCCTTGCCCTCCTGCATCTGCTC  666

Query  667  TACCTGGTGATGGACTCAAAGACCTTGCCGATGGCGCAGGAGATTTTCCGCCTGTCTCGTCACCACATCCAGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACCTGGTGATGGACTCAAAGACCTTGCCGATGGCGCAGGAGATTTTCCGCCTGTCTCGTCACCACATCCAGCA  740

Query  741  ATTCCCTTTCTGTTTGATGTCCGTGAACATCACCCACATTGCCATCCAGGCCTTGAGAGAGGAGTGTCTCTCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTCCCTTTCTGTTTGATGTCCGTGAACATCACCCACATTGCCATCCAGGCCTTGAGAGAGGAGTGTCTCTCCA  814

Query  815  GAGAGTGTAATCGGCAGCAGAAGGTCATCCCCGTGGTGAACAGCTTCTATGCCGCCACATTCCTCCATCTCGCA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  GAGAGTGTAATCGGCAGCAGAAGGTCATCCCCGTGGTGAACAGCTTCTATGCCGCCACATTCCTCCACCTCGCA  888

Query  889  CATGTCTGGAGGACACAGCGGAAGACCATCTCAGACTCGGGCTTTGTCCTCAAA--------------------  942
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct  889  CATGTCTGGAGGACACAGCGGAAGACCATCTCAGACTCGGGCTTTGTCCTCAAAGGTGTGCTCTTTCTTCTGGG  962

Query  943  GAG---TTGGAAGTAT------TGGCCAAG-----AAGAGCCCACTGCGGCTGCTCAAGACCCTGG-------A  995
            |||   |.||..|.||      ||.||.||     .||||||||..|.||.||||  |||  ||||       .
Sbjct  963  GAGGCCTAGGCTGAATGCACAGTGTCCCAGGTCCAGAGAGCCCAAGGTGGTTGCT--AGA--CTGGTTTTGGCT  1032

Query  996  GCTGTACTTGGC------CAGGGTGTCAAAGGGACAGGCCTCCTTGTTGGGAGC--ACAGAAGTGCTATGGGCC  1061
            ||.||.|||..|      ||...|.|||||         .|||        |||  ||..||.| ||     ||
Sbjct 1033  GCAGTTCTTCCCCATCCACACTTTCTCAAA---------TTCC--------AGCTTACCAAAAT-CT-----CC  1083

Query 1062  AGAAGCCCCTCCCTTCAAGGA----------TCTCACCTTCACAGGTGAGAGTGACCTG-CAGTCTCACTCATC  1124
            |..|.||.|.||||    |||          |||| |.|||.|         ||.|||| |.|||.|.||..||
Sbjct 1084  ATCACCCACCCCCT----GGAGTCTGCTAGTTCTC-CTTTCTC---------TGCCCTGACTGTCGCCCTTTTC  1143

Query 1125  CGAAGGCGTATGGCTGATC--------------  1143
            .|  |.|.||| .||.||.              
Sbjct 1144  TG--GTCTTAT-ACTTATGACAAGCATATATTC  1173