Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_16043
• Subject: NM_207312.3
• Aligned Length: 1358
• Identities: 1126
• Gaps: 19

Alignment

Query    1  ATGCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTG  74
            |||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGCGCGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCGGGTGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74

Query   75  CCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATGGCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGATTCCTTCA  148
            |||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||
Sbjct   75  CCTTGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAAATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGCGGGGACGACTCCTTCA  148

Query  149  ACACCTTCTTCAGTGAAACGGGTGCTGGCAAGCATGTGCCCCGGGCAGTGTTTGTAGACTTGGAACCCACAGTC  222
            ||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.
Sbjct  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222

Query  223  ATTGATGAAGTTCGCACTGGCACTTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAACTCATCACAGGCAAGGAAGATGC  296
            .|.||||||||.|||||.||.||.|||.|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGGACCTACAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC  296

Query  297  TGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCTCGTGTTGGACCGAATTCGCA  370
            .||||.|||.||.|||.|.||.||.||||||||.|||||||||||..|||||||.||..|||||||.||.||||
Sbjct  297  AGCCAGTAATTACGCCAGGGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATTGTTGACCTAGTCCTGGACCGGATCCGCA  370

Query  371  AGCTGGCTGACCAGTGCACCGGTCTTCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGAACTGGTTCTGGG  444
            |.|||||.||.|.||||||.||.||.|||||||||.|..|.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct  371  AACTGGCGGATCTGTGCACAGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGCTTTGGGGGCGGCACTGGCTCTGGG  444

Query  445  TTCACCTCGCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTATGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAGTTCTCCATTTACCC  518
            |||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct  445  TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACAGCAAGAAGTCCAAGCTAGAGTTTGCCATTTACCC  518

Query  519  GGCGCCCCAGGTTTCCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACCCTGGAGCACT  592
            .||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  519  AGCCCCCCAGGTCTCCACAGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTAACCACCCACACGACCCTGGAACATT  592

Query  593  CTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGACATCTGTCGTAGAAACCTCGATATCGAGCGCCCA  666
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.||.||.||.||.
Sbjct  593  CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATTGAACGTCCC  666

Query  667  ACCTACACTAACCTTAACCGCCTTATTAGCCAGATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATTTGATGGAGC  740
            ||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||||||||||||.||.||||||.||||||||||.||
Sbjct  667  ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGATGGGGC  740

Query  741  CCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGCCCTACCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACAT  814
            |||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTCGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT  814

Query  815  ATGCCCCTGTCATCTCTGCTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTACTGTAGCAGAGATCACCAATGCTTGCTTT  888
            |.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||..||||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct  815  ACGCCCCAGTCATCTCAGCTGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCTGTGGCCGAGATCACCAATGCCTGCTTC  888

Query  889  GAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTAAATACATGGCTTGCTGCCTGTTATACCGTGG  962
            |||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||.||||.|||.|.||
Sbjct  889  GAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCATGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG  962

Query  963  TGACGTGGTTCCCAAAGATGTCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAAACCAAGCGTACCATCCAGTTTGTGGATT  1036
            .||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  963  GGACGTGGTCCCCAAAGACGTCAATGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACTATCCAGTTTGTGGATT  1036

Query 1037  GGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATTAATTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGCGGAGACCTGGCCAAG  1110
            |||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTGCCCGACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACAGTGGTCCCCGGGGGAGACCTGGCCAAG  1110

Query 1111  GTACAGAGAGCTGTGTGCATGCTGAGCAATACCACAGCTGTTGCCGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAAGTT  1184
            ||.|||.|.||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||.|||||||||||.|||||||.|||.|||||
Sbjct 1111  GTGCAGCGGGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATTGCGGAGGCCTGGGCCCGCCTGGTCCATAAGTT  1184

Query 1185  TGACCTGATGTATGCCAAGCGTGCCTTTGTTCACTGGTACGTGGGTGAGGGGATGGAGGAAGGCGAGTTTTCAG  1258
            .||.||.||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 1185  CGATCTCATGTATGCCAAGTGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGCGAAGGCATGGAAGAGGGAGAGTTCTCTG  1258

Query 1259  AGGCCCGTGAGGACATGGCTGCCCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGAGCAGAT--AGTGCTGACGGAGAGG  1330
            |||||||.||||||.||||.||.||.||||||||||.|||.|||||.||.|..|||  .|||        ||.|
Sbjct 1259  AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTAGAGAAGGATTGTGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTG--------GAAG  1324

Query 1331  ATGAGGGTGAAG-------AGTAT--  1347
            .|||||.|||||       ||.||  
Sbjct 1325  CTGAGGCTGAAGAAGGCGAAGCATAC  1350