Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_16064
• Subject: XM_011537324.2
• Aligned Length: 2340
• Identities: 2143
• Gaps: 192

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCATGATAAGCCGCAGGGTGGCCTTGGCCACTGCCCTCAGGCCCCACACCTCCTCGGCGGGCTCTGTGAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ACCCAGGGAAGGGGGTGGGCTCCCATGGGGGTCCCTGCCCTCCCCGTTGAGCCAAAGTAGTCAGGCCTTTTGGG  148

Query    1  --------------------------ATGCCATCACCACAGACAGACACTCCTGGGCCGGAGCTGCAGAGTCCC  48
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGAAGGCGGCTCTCCTGCTGCCAAGATGCCATCACCACAGACAGACACTCCTGGGCCGGAGCTGCAGAGTCCC  222

Query   49  AAGGAGGCTGAGGAGCCACAGACTCCAGCTCAGGGCTCCCGGCGAACAAGCAGCAGGAAAGAGCCCAATGCCCA  122
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGGAGGCTGAGGAGCCACAGACTCCAGCTCAGGGCTCCCGGCGAACAAGCAGCAGGAAAGAGCCCAATGCCCA  296

Query  123  CCGCAAGGATGGCACAAGGCTGGGCCTGGGCTCCCTGAGGCAGGCCTTCTCCCGGGCCAGCCAGCGGGCTTTGA  196
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGCAAGGATGGCACAAGGCTGGGCCTGGGCTCCCTGAGGCAGGCCTTCTCCCGGGCCAGCCAGCGGGCTTTGA  370

Query  197  CCCAGGTCTCCAAGGAAGATACGGGCCTGTTCCGGCGAAGCTCCTGCTCCCTGTTCCGGTCCTTCCGGCAAGCC  270
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCAGGTCTCCAAGGAAGATACGGGCCTGTTCCGGCGAAGCTCCTGCTCCCTGTTCCGGTCCTTCCGGCAAGCC  444

Query  271  CTGAATGACGGCCCAGCTACCGGCCATTCCCAGGCCACTCCTGAGGTGCCCTCGGGGGTCATGAATGGTGTCAG  344
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGAATGACGGCCCAGCTACCGGCCATTCCCAGGCCACTCCTGAGGTGCCCTCGGGGGTCATGAATGGTGTCAG  518

Query  345  CCAACAGGCATCCACTGGGGCAGCGTCTGAGGAACTGAAACCCGAGGCAGAAGGCAAATCCGTGGCCGACCTCA  418
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAGCAGGCATCCACTGGGGCAGCGTCTGAGGAACTGAAACCCGAGGCAGAAGGCAAATCCGTGGCCGACCTCA  592

Query  419  TTACTGAACGGCAACTGCTGGCGGCCTTCGAACAGCTTCTGCGCCTGGAGACGCTGCTGGTGGCCGAGAAGGCC  492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTACTGAACGGCAACTGCTGGCGGCCTTCGAACAGCTTCTGCGCCTGGAGACGCTGCTGGTGGCCGAGAAGGCC  666

Query  493  TCGCGCACCTTTGAGCAGGACCCTACGGCCTTCGCGCGGCGCGCTATGGACGTGTGCCTGCTTTACGACGGGCT  566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCGCGCACCTTTGAGCAGGACCCTACGGCCTTCGCGCGGCGCGCTATGGACGTGTGCCTGCTTTACGACGGGCT  740

Query  567  GGCAGCCGAGATCGGCGCCATCGTGCGCGAGACGCTGGACAGCGACGGTGTGGACGCGGCCGCGCTGGCCGAGC  640
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCAGCCGAGATCGGCGCCATCGTGCGCGAGACGCTGGACAGCGACGGTGTGGACGCGGCCGCGCTGGCCGAGC  814

Query  641  TGGCCCGCGTGGTGAGCGCGGAGGAGGAGGCCCACCCTTCTCCCCCCGACGACGGCGACTTCCTGCGCACGCCG  714
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGCCCGCGTGGTGAGCGCGGAGGAGGAAGCCCACCCTTCTCCCCCCGACGACGGCGACTTCCTGCGCACGCCG  888

Query  715  CGCCGCTGGCGCCAGCACTGGGAGGAGGCGGTGCGGCGAAGCGCTCAGGAGCGCGTGCGGCGGCCGGGCGCGGG  788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGCCGCTGGCGCCAGCACTGGGAGGAGGCGGTGCGGCGAAGCGCTCAGGAGCGCGTGCGGCGGCCGGGCGCGGG  962

Query  789  GTGGGCCTTCGGGGAGGCGGAGGGCGCGTCGGGTTTGGCCCAGCTTCTGGCCGAGCTGGGTGGCTTGGTTCGCC  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTGGGCCTTCGGGGAGGCGGAGGGCGCGTCGGGTTTGGCCCAGCTTCTGGCCGAGCTGGGTGGCTTGGTTCGCC  1036

Query  863  GCGACCTGCAGAAGGTGCGGCAGGAGGTGCAGCCCGCGTATGCGGCGGCCGGCTTCCCAGCGTGGGAGGTCTAT  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCGACCTGCAGAAGGTGCGGCAGGAGGTGCAGCCCGCGTATGCGGCGGCCGGCTTCCCAGCGTGGGAGGTCTAT  1110

Query  937  CTGCGTGCCTTCCACAGCGCCGTGGCCCAGCGCCTCCAGGAGCTCGCGCGCGACGCCCGCGGCTGCGAGCAGCT  1010
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGCGTGCCTTCCACAGCGCCGTGGCCCAGCGCCTCCAGGAGCTCGCGCGCGACGCCCGCGGCTGCGAGCAGCT  1184

Query 1011  CTATATCCTGCTGGACTGGGCCGCCAACGTCTACGGCAGTCCTGACTTCCTGGGCGCCCCGGGGCTGGCGCTGC  1084
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTATATCCTGCTGGACTGGGCCGCCAACGTCTACGGCAGTCCTGACTTCCTGGGCGCCCCGGGGCTGGCGCTGC  1258

Query 1085  CCGCCGAGCCGCTGCCTCCGCTCCTGGCGCCGGACGTGTGGGCCCGACTGGAGAGCGACTACACCAGCTTCCTG  1158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCGCCGAGCCGCTGCCTCCGCTCCTGGCGCCGGACGTGTGGGCCCGACTGGAGAGCGACTACACCAGCTTCCTG  1332

Query 1159  GAGGCCAAGATCGCAAGCTGCTTCGACAGCATCTTGCAGCTGGAGCAGAGTCACTGGGCGGCCGCCGAGGTCCC  1232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGGCCAAGATCGCAAGCTGCTTCGACAGCATCTTGCAGCTGGAGCAGAGTCACTGGGCGGCCGCCGAGGTCCC  1406

Query 1233  CGAGGTGCTGCAGGGCCTCTACCAGGCGCCGCTGTCCATGGACGTCCATATGCTCGTGGCCGAGCACGTGAAGG  1306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGAGGTGCTGCAGGGCCTCTACCAGGCGCCGCTGTCCATGGACGTCCATATGCTCGTGGCCGAGCACGTGAAGG  1480

Query 1307  CGGCCGGCGCCATCTCCGCGGAGCTGGAGGCCACCACCCTGCGAATCTGCACGCGGGCGCTCGGCCTCTTCGTG  1380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CGGCCGGCGCCATCTCCGCGGAGCTGGAGGCCACCACCCTGCGAATCTGCACGCGGGCGCTCGGCCTCTTCGTG  1554

Query 1381  CCCAGGTTTGAAAAGGCTTTTCTGGCGTCGGAGGCGGTGAGCGAGCCGCACCTGGGCGCCTACATCAACGCCTG  1454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCCAGGTTTGAAAAGGCTTTTCTGGCGTCGGAGGCGGTGAGCGAGCCGCACCTGGGCGCCTACATCAACGCCTG  1628

Query 1455  CGAGGAGCTCAGGACCAGTCTTCTCTCCAGGTTCCCAGGAACCCAAGAGGAGCTGGAGAAGCCCCTGGTGACGG  1528
            |||||||||                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGAGGAGCT------------------CAGGTTCCCAGGAACCCAAGAGGAGCTGGAGAAGCCCCTGGTGACGG  1684

Query 1529  CCACCTGCAGCTTCCAGAAGCACTTGCTTCAGGGCTTGCAGCGTGAGTTGCAGCCGCTCTTCAGGGTTGTGTGC  1602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1685  CCACCTGCAGCTTCCAGAAGCACTTGCTTCAGGGCTTGCAGCGTGAGTTGCAGCCGCTCTTCAGGGTTGTGTGC  1758

Query 1603  ACCAGGGACTGGCTGACGCAGGACTGGCTGCATCCCCTCATGGACAAGGTGGTGACCTTCGCCGGTCATCTCCA  1676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1759  ACCAGGGACTGGCTGACGCAGGACTGGCTGCATCCCCTCATGGACAAGGTGGTGACCTTCGCCGGTCATCTCCA  1832

Query 1677  GCGTGTGGCCCGGCCGCGGGCACAGGAGACTCTGCAGGAGGTGCACCGGTTCGTGGTCCGCGAGTACCTGGCGC  1750
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1833  GCGTGTGGCCCGGCCGCGGGCACAGGAGACTCTGCAGGAGGTGCACCGGTTCGTGGTCCGCGAGTACCTGGCGC  1906

Query 1751  GGGCGCTGAGGCCACGGGAGCGGTTCCGGGGCATGGAGCGCATGCATGGCTCCCAGAAGATGAGCCTGGATGCC  1824
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1907  GGGCGCTGAGGCCACGGGAGCGGTTCCGGGGCATGGAGCGCATGCATGGCTCCCAGAAGATGAGCCTGGATGCC  1980

Query 1825  CAGGCCATCAGCGACACCTTCCAGGGCCTGGGTTCCGAGGCCACATGGTTGGACCAAGCCATCCAGTGCGTGGC  1898
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981  CAGGCCATCAGCGACACCTTCCAGGGCCTGGGTTCCGAGGCCACATGGTTGGACCAAGCCATCCAGTGCGTGGC  2054

Query 1899  TGAGATCCTGGGCGAGACCTACAAAGATGACATCCAGCGGCACCTGGAGACTCTTATCCGGAGCTACCCCGACA  1972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2055  TGAGATCCTGGGCGAGACCTACAAAGATGACATCCAGCGGCACCTGGAGACTCTTATCCGGAGCTACCCCGACA  2128

Query 1973  TCAGGCGGGACCACATACTGGCCATTCTGGCGCTGCGCCGACTGGGCCGCCGGCGGAACCAGCATCTCTTGCAG  2046
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2129  TCAGGCGGGACCACATACTGGCCATTCTGGCGCTGCGCCGACTGGGCCGCCAGCGGAACCAGCATCTCTTGCAG  2202

Query 2047  CACACCGAAGACCTGCTGAGAGCTGCGGCCGGGGCGGCGGGTGCGGAGGCCCCTCGGGGCCGCGTGCTCTTCGA  2120
            |||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2203  CACACTCAAGACCTGCTGAGAGCTGCGGCCGGGGCGGCGGGTGCGGAGGCCCCTCGGGGCCGCGTGCTCTTCGA  2276

Query 2121  GGAGATCAAGGTGCCCAGTGCCATGGCTGTGCTGATCACCTGCGTC  2166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2277  GGAGATCAAGGTGCCCAGTGCCATGGCTGTGCTGATCACCTGCGTC  2322