Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_16176
- Subject:
- XM_006511196.3
- Aligned Length:
- 1182
- Identities:
- 999
- Gaps:
- 72
Alignment
Query 1 ATGCCCAAGAAGAAGCCGACGCCCATCCAGCTGAACCCGGCCCCCGACGGCTCTGCAGTTAACGGGACCAGCTC 74
..|| ||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------------ATGA--AGCT- 8
Query 75 TGCGGA---GACCAACTTGGAGGCCTTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTAGAGCTTGATGAGCAGCAGCGAAAGC 145
||| |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 9 ---GGAGAGGACCAACCTGGAGGCCTTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTGGAGCTTGACGAGCAGCAGCGGAAGC 79
Query 146 GCCTTGAGGCCTTTCTTACCCAGAAGCAGAAGGTGGGAGAACTGAAGGATGACGACTTTGAGAAGATCAGTGAG 219
|.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 80 GGCTCGAGGCCTTTCTGACGCAGAAGCAGAAGGTGGGGGAACTGAAGGATGATGACTTTGAGAAGATCAGCGAA 153
Query 220 CTGGGGGCTGGCAATGGCGGTGTGGTGTTCAAGGTCTCCCACAAGCCTTCTGGCCTGGTCATGGCCAGAAAGCT 293
|||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 154 CTGGGAGCTGGCAACGGTGGAGTGGTCTTCAAGGTCTCCCACAAGCCATCTGGCCTGGTTATGGCTAGAAAGCT 227
Query 294 AATTCATCTGGAGATCAAACCCGCAATCCGGAACCAGATCATAAGGGAGCTGCAGGTTCTGCATGAGTGCAACT 367
.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 228 GATCCACCTGGAGATCAAACCCGCAATCCGGAACCAGATCATCCGGGAGCTGCAGGTACTGCACGAGTGCAACT 301
Query 368 CTCCGTACATCGTGGGCTTCTATGGTGCGTTCTACAGCGATGGCGAGATCAGTATCTGCATGGAGCACATGGAT 441
|.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 302 CCCCGTACATCGTGGGCTTCTACGGGGCCTTCTACAGCGACGGCGAGATCAGCATCTGCATGGAGCACATGGAT 375
Query 442 GGAGGTTCTCTGGATCAAGTCCTGAAGAAAGCTGGAAGAATTCCTGAACAAATTTTAGGAAAAGTTAGCATTGC 515
||.||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 GGTGGGTCCTTGGATCAAGTTCTGAAGAAAGCTGGAAGAATTCCTGAGCAAATTTTAGGAAAAGTTAGCATTGC 449
Query 516 TGTAATAAAAGGCCTGACATATCTGAGGGAGAAGCACAAGATCATGCACAGAGATGTCAAGCCCTCCAACATCC 589
|||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 450 TGTGATAAAAGGCCTGACCTATCTTCGGGAGAAGCACAAGATTATGCACAGAGATGTCAAGCCATCCAACATTC 523
Query 590 TAGTCAACTCCCGTGGGGAGATCAAGCTCTGTGACTTTGGGGTCAGCGGGCAGCTCATCGACGACATGGCCAAC 663
||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||...|||||||||
Sbjct 524 TAGTGAACTCACGTGGGGAGATCAAACTCTGTGATTTTGGGGTCAGCGGGCAGCTAATTGACTCTATGGCCAAC 597
Query 664 GACTTCGTGGGCACAAGGTCCTACATGTCGCCAGAAAGACTCCAGGGGACTCATTACTCTGTGCAGTCAGACAT 737
..||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 598 TCCTTCGTGGGCACGAGATCCTACATGTCGCCTGAGAGACTCCAGGGGACTCACTACTCTGTGCAGTCGGACAT 671
Query 738 CTGGAGCATGGGACTGTCTCTGGTAGAGATGGCGGTTGGGAGGTATCCCATCCCTCCTCCAGATGCCAAGGAGC 811
||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 672 CTGGAGCATGGGGCTCTCTCTGGTGGAGATGGCAGTTGGGAGATACCCCATTCCTCCTCCTGATGCCAAGGAGC 745
Query 812 TGGAGCTGATGTTTGGGTGCCAGGTGGAAGGAGATGCGGCTGAGACCCCACCCAGGCCAAGGACCCCCGGGAGG 885
|||||||..|||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 746 TGGAGCTACTGTTTGGATGCCATGTGGAAGGAGACGCAGCCGAAACACCACCCAGGCCAAGGACCCCTGGGAGG 819
Query 886 CCCCTTAGCTCATACGGAATGGACAGCCGACCTCCCATGGCAATTTTTGAGTTGTTGGATTACATAGTCAACGA 959
||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 820 CCTCTCAGCTCATATGGAATGGACAGCCGACCTCCCATGGCAATTTTTGAGTTGTTGGATTACATTGTCAATGA 893
Query 960 GCCTCCTCCAAAACTGCCCAGTGGAGTGTTCAGTCTGGAATTTCAAGATTTTGTGAATAAATGCTTAATAAAAA 1033
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 894 GCCTCCTCCAAAACTGCCCAGTGGAGTATTCAGTCTGGAGTTTCAGGATTTTGTGAATAAATGCTTAATAAAGA 967
Query 1034 ACCCCGCAGAGAGAGCAGATTTGAAGCAACTCATGGTTCATGCTTTTATCAAGAGATCTGATGCTGAGGAAGTG 1107
||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 968 ACCCTGCAGAGAGAGCAGATCTGAAGCAGCTCATGGTACATGCTTTCATCAAAAGATCTGACGCCGAGGAGGTA 1041
Query 1108 GATTTTGCAGGTTGGCTCTGCTCCACCATCGGCCTTAACCAGCCCAGCACACCAACCCATGCTGCTGGCGTC 1179
||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..||.||
Sbjct 1042 GACTTCGCAGGCTGGCTCTGCTCCACCATTGGGCTTAACCAGCCCAGCACACCAACCCACGCTGCCAGCATC 1113