Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465220
- Subject:
- XM_006511545.2
- Aligned Length:
- 1124
- Identities:
- 952
- Gaps:
- 46
Alignment
Query 1 ATG-ATC-TCAGATCCCCCCTCAAACAACAGCTGGAACTCTGTTCTCTATCTTC--------------TAGAGG 58
||| ||| ||.||||| ||....|||.|| ||.| .|||||
Sbjct 1 ATGAATCGTCCGATCC-------AAGTGAAGCCGG---------------CTGCCAGTGAGGGCCGAGGAGAGG 52
Query 59 ACCGAAAGCTGTTTGTGGGGATGCTGGGCAAGCAGCAGGGTGAGGAGGACGTCAGACGCCTGTTCCAGCCCTTT 132
||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 53 ACCGGAAGCTGTTTGTGGGGATGTTGGGCAAGCAGCAGGGTGAGGAGGATGTCAGACGTCTGTTCCAGCCCTTC 126
Query 133 GGCCACATCGAGGAGTGCACGGTCCTGCGGAGTCCTGACGGCACCAGTAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAGTTCGG 206
|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 127 GGCCATATCGAGGAGTGCACTGTCCTGCGGAGTCCGGACGGTACCAGTAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAATTCGG 200
Query 207 GAGTCAAGGGGAAGCTCAGGCGGCCATCCGGGGTCTGCACGGCAGCCGGACCATGGCGGGCGCCTCGTCCAGCC 280
.||||||||||||||.||.||.|||||||.|||.||.|||||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||
Sbjct 201 AAGTCAAGGGGAAGCCCAAGCTGCCATCCAGGGACTACACGGTAGCCGGACAATGACGGGTGCCTCCTCCAGCC 274
Query 281 TCGTGGTCAAGCTGGCGGACACCGACCGGGAGCGCGCGCTGCGGCGGATGCAGCAGATGGCCGGCCACCTGGGC 354
|.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 275 TGGTGGTTAAGCTGGCAGACACCGACCGGGAGCGCGCGCTGCGAAGGATGCAGCAAATGGCTGGCCAGCTGGGT 348
Query 355 GCCTTCCACCCCGCGCCACTGCCGCTAGGGGCCTGCGGCGCCTACACCACGGCGATCCTGCAGCACCAGGCGGC 428
|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 349 GCCTTCCACCCGGCACCGCTGCCCCTCGGGGCCTGTGGCGCCTATACCACTGCGATCCTACAGCACCAGGCAGC 422
Query 429 CCTGCTGGCGGCGGCACAGGGCCCAGGCCTAGGCCCGGTGGCGGCAGTGGCGGCCCAGATGCAACACGTGGCGG 502
..|||||||.||.||.|||||.||.||..||||||.||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 423 GTTGCTGGCCGCAGCGCAGGGTCCGGGGTTAGGCCAGGTGGCCGCGGTGGCCGCCCAGATGCAGCACGTGGCGG 496
Query 503 CCTTTAGCCTGGTAGCTGCGCCTCTGTTGCCCGCGGCAGCAGCCAA---CTCCCCGCCTGGCAGCGGCCCTGGC 573
||||.|||.||||.|||||.||.|||||||||||| |||||||| .|||||...|||||..||||||||.
Sbjct 497 CCTTCAGCTTGGTGGCTGCACCGCTGTTGCCCGCG---GCAGCCAATACATCCCCTGGTGGCAATGGCCCTGGT 567
Query 574 ACCCTCCCAGGTCTTCCGGCGCCCATCGGGGTCAATGGATTCGGC-CCTCTGACCCCCCAGACCAATGGCCAGC 646
.|.|||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||| ||| ||||||||||||.|||.||.||||
Sbjct 568 GCACTCCCTGGCCTTCCAGCGCCCATGGGAGTCAATGGATTCGGCTCCT-TGACCCCCCAGAGCAACGGACAGC 640
Query 647 CGGGCTCCGACACGCTCTACAATAACGGGCTCTCCCCTTATCCAGCCCAGAGCCCCGGCGTGGCTGACCCCCTG 720
|.|||||||||||||||||.||.||||||.|.||||||||.|||||..||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct 641 CAGGCTCCGACACGCTCTATAACAACGGGGTTTCCCCTTACCCAGCGAAGAGCCCCAGTGTGGCTGACCCCCTG 714
Query 721 CAGCAGGCCTACGCTGGGATGCACCACTACGCAGCAGCCTATCCGTCGGCCTATGCCCCAGTGAGCACAGCTTT 794
||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 715 CAGCAGGCCTACGCTGGGATACATCACTATGCAGCAGCCTATCCCTCGGCCTATGCCCCAGCGAGCACAGCTTT 788
Query 795 TCCCCAGCAGCCTTCAGCCCTGCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGCCCCGAAGGCTGTAACCTCTTCATCTATCACC 868
|.||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 TTCCCAACAGCCTTCAGCTCTGCCTCAACAACAAAGAGAAGGCCCCGAAGGCTGTAACCTCTTCATCTATCACC 862
Query 869 TGCCTCAGGAGTTTGGTGATGCGGAACTCATACAGACATTCCTGCCCTTTGGAGCCGTTGTCTCTGCTAAAGTC 942
||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 863 TGCCTCAGGAGTTTGGGGATGCAGAACTCATACAGACATTCCTGCCCTTCGGAGCTGTTGTCTCTGCCAAAGTT 936
Query 943 TTTGTGGATCGAGCCACCAACCAGAGCAAGTGTTTTGGGTTTGTTAGTTTTGACAATCCAACTAGTGCCCAGAC 1016
||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 937 TTTGTGGACCGTGCCACCAATCAGAGCAAGTGTTTTGGGTTTGTTAGTTTTGACAATCCAACCAGTGCCCAGAC 1010
Query 1017 TGCTATTCAGGCGATGAATGGCTTTCAAATTGGCATGAAGAGGCTCAAGGTCCAGCTAAAGCGGCCCAAGGATG 1090
.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||
Sbjct 1011 CGCCATCCAGGCCATGAATGGCTTTCAAATCGGCATGAAGAGGCTCAAGGTCCAGCTAAAGAGACCTAAGGATG 1084
Query 1091 CCAACCGGCCTTAC 1104
|||||.||||||||
Sbjct 1085 CCAACAGGCCTTAC 1098