Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000465288
Subject:
XM_011249734.2
Aligned Length:
1953
Identities:
1341
Gaps:
402

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGCTACTTTGACCTGAAGGCCCACGAGCTGTGTGGAGGTTACATTAAAGACATCCTTTGCCAGGAGTGTTC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCCCTACGCGGCTCACCTCTACGATGCCGAGAACCCCCAGACACCGCTCCGGAACCTTCCGGGCCTCTGCTCTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ACTACTGCTCTGCCTTCCACCGCAGCTGCCACTCGGCCATCTCCTTGCTAACCAATGACCGTGGCCTCCAGGAG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TCCCATGGCAAAGATGGTGCTCGCTTCTGTCACCTCCTCAACCTTCCTGACGAGGACTACTGCTTCCCCAATGT  296

Query    1  ----------------------------------ATGGTGGCCCAAGATCCTCAGGGCTGCCTGCAGCTCTGCC  40
                                              .|||||||..|.||.|..||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGAGGAACGATCAACTCAACCGCAACCTGGGAGTGGTGGCTGAGGACCAGCAGGGCTGCCTGCAGCTCTGCC  370

Query   41  TGAGCGAGGTGGCCAACGGGCTGAGGAACCCCGTCTCCATGGTCCATGCTGGGGACGGCACCCATCGCTTCTTT  114
            ||..||||||||||||.||..||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TGGTCGAGGTGGCCAATGGCTTGAGGAACCCTGTGTCCATGGTCCACGCTGGGGATGGCACCCACCGCTTCTTT  444

Query  115  GTTGCCGAGCAGGTAGGAGTGGTGTGGGTCTACCTCCCTGATGGGAGTCGCCTGGAGCAACCCTTCCTGGACCT  188
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  445  GTCGCTGAGCAGGTAGGAGTGGTGTGGGTCTACCTCCCTGATGGGAGCCGCCTGGAACAGCCCTTCCTGGATCT  518

Query  189  CAAGAACATCGTGTTGACCACCCCATGGATCGGGGATGAGAGAGGCTTCTTGGGGTTGGCTTTTCACCCCAAAT  262
            |||||.|||.|||.|||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGAGCATGGTGCTGACCACACCGTGGATCGGGGATGAGAGAGGCTTCTTGGGTCTCGCTTTTCACCCCAAAT  592

Query  263  TCCGCCACAATCGCAAGTTCTATATTTATTATTCGTGCCTGGACAAGAAGAAGGTAGAAAAGATCCGAATTAGT  336
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||.|||||.||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct  593  TCCGCCACAACCGCAAGTTCTACATTTATTATTCATGCCTGGGCAAGAGGAAGGTGGAGAAAATCCGGATTAGT  666

Query  337  GAGATGAAGGTTTCTCGGGCTGATCCTAACAAAGCTGACCTGAAATCAGAG------------------AGGGT  392
            ||||||||||||||.|.|.||||....||||.|||.||.|..|||||||||                  |||||
Sbjct  667  GAGATGAAGGTTTCCCTGTCTGACGGCAACAGAGCAGATCCCAAATCAGAGAGTTTCTCTTTCTTTTCCAGGGT  740

Query  393  CATCTTGGAGATTGAAGAACCAGCCTCAAACCATAATGGCGGACAACTTCTTTTTGGCCTGGATGGCTATATGT  466
            ||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||.|||
Sbjct  741  CATCTTGGAGATAGACGAACCAGCCTCCAACCACAATGGTGGACAGCTTCTCTTTGGCCTGGATGGTTATCTGT  814

Query  467  ACATATTCACTGGGGACGGGGGACAGGCTGGAGATCCCTTTGGCCTGTTTGGAAATGCTCAGAACAAAAGTTCC  540
            |||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||..|||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  815  ACATATTCACTGGGGACGGAGGGCAGGCTGGGGATCCCTTTGGCAAGTTCGGAAATGCTCAGAACAAAAGTTCT  888

Query  541  CTGCTGGGAAAAGTTTTAAGGATCGATGTGAACAGGGCAGGCTCAC----ATGGCAAGCGGTACCGAGT-CCCC  609
            ||||||||.|||||.||||||||.||||||||..||||||    ||    |||||.||||||||||||| ||||
Sbjct  889  CTGCTGGGGAAAGTGTTAAGGATTGATGTGAATGGGGCAG----ACGTGGATGGCCAGCGGTACCGAGTGCCCC  958

Query  610  TCGGACAATCCATTTGTTTCTGAGCCAGGGGCCCACCCCGCCATCTATGCCTATGGGATCAGGAACATGTGGCG  683
            | |||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||.|||||||.||.|||.||||.|||||||||||
Sbjct  959  T-GGACAATCCGTTTGTCTCTGAGCCAGGTGCCCACCCTGCCGTCTATGCTTACGGGGTCAGAAACATGTGGCG  1031

Query  684  TTGTGCTGTGGACCGAGGGGACCCCATCACGCGCCAGGGCCGAGGCCGGATATTCTGTGGGGACGTGGGCCAGA  757
            .|||||||||||||||||.||||||.||||.|.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032  CTGTGCTGTGGACCGAGGAGACCCCGTCACACACCGGGGCCGAGGTCGGATATTCTGTGGGGACGTGGGCCAGA  1105

Query  758  ACAGGTTTGAAGAGGTTGACCTCATTTTGAAAGGTGGAAACTATGGCTGGAGAGCAAAGGAAGGGTTTGCATGT  831
            |||.|||.||.||.||.|||||.||..|.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||.||||
Sbjct 1106  ACAAGTTCGAGGAAGTCGACCTTATAGTTAAAGGCGGGAACTATGGCTGGAGAGCCAAGGAAGGGTTTGAATGT  1179

Query  832  TATGACAAAAAACTTTGTCACAATGCCTCTTTGGATGATGTTCTGCCAATCTATGCTTATGGCCATGCAGTGGG  905
            ||||||||.|.||||||.|..|||||.||.||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||..||.||
Sbjct 1180  TATGACAAGAGACTTTGCCGTAATGCGTCCTTGGATGACATTCTGCCCATCTATGCTTATGGCCATGGGGTAGG  1253

Query  906  GAAGTCAGTCACTGGAGGTTATGTCTATCGTGGTTGTGAATCCCCAAATCTCAATGGCCTGTATATCTTTGGAG  979
            .|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1254  AAAGTCAGTCACTGGAGGGTATGTCTACCGTGGGTGTGAATCCCCCAATCTCAATGGACTCTACATCTTTGGGG  1327

Query  980  ACTTCATGAGTGGTCGACTTATGGCTTTGCAGGAAGATAGAAAAAACAAGAAATGGAAGAAGCAGGATCTTTGC  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|.|||||||||..||||..||..|.|||
Sbjct 1328  ACTTCATGAGTGGTCGACTTATGGCTTTGCAGGAAGATAGGAAAACCCAGAAATGGACAAAGCGAGACATCTGC  1401

Query 1054  CTGGGCAGCACCACGTCCTGTGCCTTCCCAGGGCTGATCAGCACCCATAGCAAGTTCATCATCTCCTTTGCTGA  1127
            .|||   |||.|.||.||||.||||||||.|||||||||||..|..|.||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1402  TTGG---GCAACTCGACCTGCGCCTTCCCGGGGCTGATCAGTGCATACAGCAGGTTCATCATCTCCTTTGCTGA  1472

Query 1128  AGATGAAGCAGGGGAGCTGTATTTCCTGGCGACCTCTTACCCAAGTGCCTATGCACCACGTGGATCTATTTACA  1201
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct 1473  AGATGAAGCAGGAGAGCTGTATTTCCTGGCCACCTCCTACCCAAGTGCCTATGCGCCACATGGATCTATTTACA  1546

Query 1202  AGTTTGTTGACCCCTCAAGGCGAGCACCCCCAGGCAAGTGCAAATACAAGCCAGTGCCCGTGAGAACCAAGAGT  1275
            |||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1547  AGTTTGTCGATCCTTCAAGGCGAGCCCCACCAGGCAAGTGCAAATACAAGCCAGTGCCCGTGAAAACCAAGAGT  1620

Query 1276  AAGCGGATCCCGTTCAGACCACTCGCCAAGACAGTCTTGGACTTGCTAAAGGAACAATCAGAGAAAGCTGCTAG  1349
            |||..|.|||.||||.|.|||||||||...|||||||||||||||||.|||||..||||..|||||||.||..|
Sbjct 1621  AAGAAGGTCCGGTTCCGGCCACTCGCCGCCACAGTCTTGGACTTGCTGAAGGAGGAATCGCAGAAAGCAGCCCG  1694

Query 1350  AAAATCTTCCAGTGCAACCTTAGCTTCTGGCCCAGCCCAGGGTTTG--TCTGAGAAAGGCTCCTCCAAGAAGCT  1421
            ||||.|.||||..||||||||..|||||.||.||| .||||| |||  |||.||||.||||||..||||||||.
Sbjct 1695  AAAAGCATCCAACGCAACCTTCACTTCTAGCTCAG-ACAGGG-TTGCATCTCAGAAGGGCTCCCTCAAGAAGCC  1766

Query 1422  GGCTTCTCCTACAAGCAGCAAGAATACATTGCGAGGGCCTGGTACAAAGAAGAAAGCCAGAGTG-GGGCCCCAC  1494
            .||||||.|...||||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||..||||||| ||.||||||
Sbjct 1767  AGCTTCTTCCCGAAGCAGCAAGAAAACATTTCGAAGGCCTGGTACCAAGAAGAAAAGCAGAGTGTGGTCCCCAC  1840

Query 1495  GTCCGCCAGGGCAAGAGGAGGAAGAGCC------TGAAAAGCCACAGTGGCAGGATG----AGGCCATCAGCAG  1558
            |||| ||||||||||||||     ||||      || |.|||||..|||...|||||    |||||        
Sbjct 1841  GTCC-CCAGGGCAAGAGGA-----AGCCCAATCTTG-ACAGCCATGGTGTAGGGATGAGACAGGCC--------  1899

Query 1559  AGCAGAAGCGAGCTGGCAGAAGTCTCCCT  1587
                       ||.||||||||||.|||.
Sbjct 1900  -----------GCAGGCAGAAGTCACCCA  1917