Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465313
• Subject: NM_001286429.2
• Aligned Length: 1982
• Identities: 1459
• Gaps: 520

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTTGTCAGCTACCTGATATTAACATTGCTCCACGTTCAAACAGCAGTGTTAGCAAGACCTGGGGGAGAGAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CATTGGCTGTGATGACTACTTAGGCTCCGACAAAGTCGTGGACAAATGTGGGGTGTGTGGAGGAGACAACACGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GCTGTCAGGTTGTGTCGGGCGTGTTTAAGCATGCCCTCACCAGCCTGGGCTACCACCGCGTCGTGGAGATTCCC  222

Query    1  ------------------------------ATGTACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGG  44
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGGGAGCCACGAAAATCAACATCACGGAGATGTACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGG  296

Query   45  ACGCTCCATCATCAATGGGAACTGGGCAATTGATCGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCT  118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACGCTCCATCATCAATGGGAACTGGGCAATTGATCGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCT  370

Query  119  ACAAGCGTCCAAATGAGATTTCGAGCACTGCCGGAGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTG  192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAAGCGTCCAAATGAGATTTCGAGCACTGCCGGAGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTG  444

Query  193  GATGTCTACATGATACACCAGCAGCCAAACCCAGGCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCAT  266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGTCTACATGATACACCAGCAGCCAAACCCAGGCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCAT  518

Query  267  CAGCCCCCAGGTGCCACCCCACAGGAGACCAGGGGAACCCTTCAATGGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCC  340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGCCCCCAGGTGCCACCCCACAGGAGACCAGGGGAACCCTTCAATGGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCC  592

Query  341  AGGAGGAGGGAGAACAGAAAGGGAGGAACGAGGAGAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACC  414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGAGGAGGGAGAACAGAAAGGGAGGAACGAGGAGAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACC  666

Query  415  TCAGAATCGGCACAGACCTTCCCAGTCAGGCATCCAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCC  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCAGAATCGGCACAGACCTTCCCAGTCAGGCATCCAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCC  740

Query  489  ACCAGCACCGCAGCCCCCACGGCGCAGCCGGGATCACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGA  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACCAGCACCGCAGCCCCCACGGCGCAGCCGGGATCACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGA  814

Query  563  CCTGTGGGAAAGGATCGCAGTACCCTATTTTCCGCTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGT  636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTGTGGGAAAGGATCGCAGTACCCTATTTTCCGCTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGT  888

Query  637  TACTGTGACTCCAGCATGAAGCCGACCCCCGAGGAGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGA  710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACTGTGACTCCAGCATGAAGCCGACCCCCGAGGAGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGA  962

Query  711  CATCGGGGAGTGGTCTGAGTGCAGCAAGACCTGTGGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGG  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATCGGGGAGTGGTCTGAGTGCAGCAAGACCTGTGGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGG  1036

Query  785  TGTACGCCAACCGCAGCCTGACGGTGCAGCCCTACCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACC  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGTACGCCAACCGCAGCCTGACGGTGCAGCCCTACCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACC  1110

Query  859  TGCCAACTCAAGATCTGCAGCGAGTGGCAGATCCGGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGG  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGCCAACTCAAGATCTGCAGCGAGTGGCAGATCCGGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGG  1184

Query  933  ACAGAGGACCCGTGATGTGAAGTGTGTGAGCAACATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGC  1006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACAGAGGACCCGTGATGTGAAGTGTGTGAGCAACATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGC  1258

Query 1007  TCCGGCCGAATGACATTGAGAACTGCGACATGGGACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAA  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCGGCCGAATGACATTGAGAACTGCGACATGGGACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAA  1332

Query 1081  AGGTGCTCAGCGGAGTGTGGGGCCGGAGTGCGGACACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCT  1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGGTGCTCAGCGGAGTGTGGGGCCGGAGTGCGGACACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCT  1406

Query 1155  GCCCCTGGAGGGCTGTGGGAACAACCGGCCGGCAGAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGG  1228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCCCCTGGAGGGCTGTGGGAACAACCGGCCGGCAGAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGG  1480

Query 1229  TGGAGTGGTTTGCCGGGAGCTGGAGTCAGTGTTCCATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATT  1302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGAGTGGTTTGCCGGGAGCTGGAGTCAGTGTTCCATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATT  1554

Query 1303  TGTGTTAGAAAGAATGCAGACACCTTTGAAGTGTTGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAG  1376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGTGTTAGAAAGAATGCAGACACCTTTGAAGTGTTGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAG  1628

Query 1377  CCAGCAATCCTGCCACCTCAAGCCTTGCGGAGCCAAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCATGAGTCTACAAAGAG  1450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||.|.|.|||||
Sbjct 1629  CCAGCAATCCTGCCACCTCAAGCCTTGCGGAGCCAAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCAT--GTGTTCCAAGAG  1700

Query 1451  CCATGCTCACCAGG-------------CC---AAGT--------------------------------------  1470
            |  ||    |||||             ||   ||||                                      
Sbjct 1701  C--TG----CCAGGGTGGCTTTCGGGTCCGGGAAGTGCGGTGTCTGTCTGATGACATGACTCTAAGTAACCTCT  1768

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1769  GTGACCCTCAGTTGAAACCAGAAGAGAGAGAATCTTGTAACCCTCAGGACTGTGTCCCTGAAGTTGATGAAAAC  1842

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1843  TGCAAGGACAAGTACTACAACTGCAACGTGGTGGTCCAGGCAAGACTCTGTGTCTACAACTACTACAAGACCGC  1916

Query 1471  ----------------------------------------------------------  1470
                                                                      
Sbjct 1917  CTGCTGTGCCTCCTGCACCCGTGTGGCCAACAGGCAGACGGGCTTCCTGGGGAGCAGA  1974