Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465313
• Subject: XM_017022585.1
• Aligned Length: 2030
• Identities: 1459
• Gaps: 568

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAATGACCCAATTATGTATGTCCAGAAAGCAGTAGAAGTATCCGGGAGGTACAGTGTGCATCCTACAACAAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AAGCCATTCATGGGCCGGTTTTATGAGTGGGAACCATTTGCAGAAGAGCATTGGCTGTGATGACTACTTAGGCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCGACAAAGTCGTGGACAAATGTGGGGTGTGTGGAGGAGACAACACGGGCTGTCAGGTTGTGTCGGGCGTGTTT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  AAGCATGCCCTCACCAGCCTGGGCTACCACCGCGTCGTGGAGATTCCCGAGGGAGCCACGAAAATCAACATCAC  296

Query    1  ----ATGTACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGGACGCTCCATCATCAATGGGAACTGGG  70
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGATGTACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGGACGCTCCATCATCAATGGGAACTGGG  370

Query   71  CAATTGATCGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCTACAAGCGTCCAAATGAGATTTCGAGC  144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAATTGATCGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCTACAAGCGTCCAAATGAGATTTCGAGC  444

Query  145  ACTGCCGGAGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTGGATGTCTACATGATACACCAGCAGCC  218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTGCCGGAGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTGGATGTCTACATGATACACCAGCAGCC  518

Query  219  AAACCCAGGCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCATCAGCCCCCAGGTGCCACCCCACAGGA  292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAACCCAGGCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCATCAGCCCCCAGGTGCCACCCCACAGGA  592

Query  293  GACCAGGGGAACCCTTCAATGGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCCAGGAGGAGGGAGAACAGAAAGGGAGG  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GACCAGGGGAACCCTTCAATGGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCCAGGAGGAGGGAGAACAGAAAGGGAGG  666

Query  367  AACGAGGAGAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACCTCAGAATCGGCACAGACCTTCCCAGT  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACGAGGAGAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACCTCAGAATCGGCACAGACCTTCCCAGT  740

Query  441  CAGGCATCCAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCCACCAGCACCGCAGCCCCCACGGCGCA  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGGCATCCAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCCACCAGCACCGCAGCCCCCACGGCGCA  814

Query  515  GCCGGGATCACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGACCTGTGGGAAAGGATCGCAGTACCCT  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCGGGATCACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGACCTGTGGGAAAGGATCGCAGTACCCT  888

Query  589  ATTTTCCGCTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGTTACTGTGACTCCAGCATGAAGCCGAC  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTTTCCGCTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGTTACTGTGACTCCAGCATGAAGCCGAC  962

Query  663  CCCCGAGGAGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGACATCGGGGAGTGGTCTGAGTGCAGCA  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCCGAGGAGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGACATCGGGGAGTGGTCTGAGTGCAGCA  1036

Query  737  AGACCTGTGGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGGTGTACGCCAACCGCAGCCTGACGGTG  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACCTGTGGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGGTGTACGCCAACCGCAGCCTGACGGTG  1110

Query  811  CAGCCCTACCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACCTGCCAACTCAAGATCTGCAGCGAGTG  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGCCCTACCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACCTGCCAACTCAAGATCTGCAGCGAGTG  1184

Query  885  GCAGATCCGGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGGACAGAGGACCCGTGATGTGAAGTGTG  958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCAGATCCGGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGGACAGAGGACCCGTGATGTGAAGTGTG  1258

Query  959  TGAGCAACATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGCTCCGGCCGAATGACATTGAGAACTGC  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGAGCAACATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGCTCCGGCCGAATGACATTGAGAACTGC  1332

Query 1033  GACATGGGACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAAAGGTGCTCAGCGGAGTGTGGGGCCGG  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACATGGGACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAAAGGTGCTCAGCGGAGTGTGGGGCCGG  1406

Query 1107  AGTGCGGACACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCTGCCCCTGGAGGGCTGTGGGAACAACC  1180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGTGCGGACACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCTGCCCCTGGAGGGCTGTGGGAACAACC  1480

Query 1181  GGCCGGCAGAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGGTGGAGTGGTTTGCCGGGAGCTGGAGT  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGCCGGCAGAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGGTGGAGTGGTTTGCCGGGAGCTGGAGT  1554

Query 1255  CAGTGTTCCATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATTTGTGTTAGAAAGAATGCAGACACCTT  1328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGTGTTCCATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATTTGTGTTAGAAAGAATGCAGACACCTT  1628

Query 1329  TGAAGTGTTGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAGCCAGCAATCCTGCCACCTCAAGCCTT  1402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAAGTGTTGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAGCCAGCAATCCTGCCACCTCAAGCCTT  1702

Query 1403  GCGGAGCCAAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCATGAGTCTACAAAGAGCCATGCTCACCAGG------------  1464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||.|.|.||||||  ||    |||||            
Sbjct 1703  GCGGAGCCAAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCAT--GTGTTCCAAGAGC--TG----CCAGGGTGGCTTTCGGG  1768

Query 1465  -CC---AAGT----------------------------------------------------------------  1470
             ||   ||||                                                                
Sbjct 1769  TCCGGGAAGTGCGGTGTCTGTCTGATGACATGACTCTAAGTAACCTCTGTGACCCTCAGTTGAAACCAGAAGAG  1842

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1843  AGAGAATCTTGTAACCCTCAGGACTGTGTCCCTGAAGTTGATGAAAACTGCAAGGACAAGTACTACAACTGCAA  1916

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1917  CGTGGTGGTCCAGGCAAGACTCTGTGTCTACAACTACTACAAGACCGCCTGCTGTGCCTCCTGCACCCGTGTGG  1990

Query 1471  --------------------------------  1470
                                            
Sbjct 1991  CCAACAGGCAGACGGGCTTCCTGGGGAGCAGA  2022