Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465338
• Subject: XM_006534441.3
• Aligned Length: 1130
• Identities: 852
• Gaps: 235

Alignment

Query    1  ATGGANGCAAATGGGAGCCAAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT  74
            |||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCAAATGGGAGCCCAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT  74

Query   75  CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT  148

Query  149  GTATGGTCATGAGAGATCCCACTACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACGTTCGCAGACCCAGCAAGT  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTATGGTCATGAGAGATCCCACAACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACCTTCGCAGACCCAGCAAGT  222

Query  223  GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCCAAAGTTGCATTTCCTCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCAAAAGTTGCATTTCCTCG  296

Query  297  TCGAGCGCAACC--------------------------------------------------------------  308
            ||||||||||||                                                              
Sbjct  297  TCGAGCGCAACCTAAGAGTCAAGAGCAGGGAGGCTCCTGGAAACGCACATGGACCACGGTCCAAGCTCGGGCTG  370

Query  309  ----------CAAGATGGTCACGAGAACAAAGAAAATATTTGTAGGCGGGTTATCTGCGAACACAGTAGTGGAA  372
                      |.||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  CCTCAGGTGACCAGATGGTCACAAGAACAAAGAAAATCTTCGTAGGAGGATTGTCTGCAAACACAGTAGTGGAA  444

Query  373  GATGTAAAGCAATATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTGGAAGATGCAATGCTGATGTTTGATAAAACTACCAACAG  446
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  445  GATGTAAAGCAGTATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTAGAGGATGCGATGCTGATGTTCGACAAAACCACCAACAG  518

Query  447  GCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACTTTTGAGAATGAAGATGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCATG  520
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACCTTTGAGAATGAAGACGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCATG  592

Query  521  AAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAGGC  594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAGGC  666

Query  595  CGGGCCCGGGGACTGCCTTACACCATGGACGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGATATCCCAACTTCGT  668
            |||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  667  CGGGCCCGGGGGCTGCCATACACCATGGATGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGCTACCCCAACTTTGT  740

Query  669  GGCGACCTATGGCCGTGGCTACCCCGGATTTGCTCCAAGCTATGGCTATCAGTTCCCAG---------------  727
            |||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||               
Sbjct  741  GGCAACCTATGGCAGAGGCTACCCCGGATTTGCTCCTAGCTATGGCTACCAGTTCCCAGCCCTATTACCATATT  814

Query  728  ---------GCTTCCCAGCAGCGGCTTATGGACCAGTGGCAGCAGCGGCGGTGGCGGCAGCAAGAGGATC----  788
                     |||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||..|||||||    
Sbjct  815  TAAATGCAAGCTTCCCGGCGGCAGCTTATGGACCAGTGGCAGCGGCAGCTGTGGCAGCGGCTCGAGGATCAGGA  888

Query  789  ----------------------------------------------AGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGGAGGC  816
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTGCACACGTCCTCTCAGACACTCTTCTGAGCACGCTCAGCAGGAAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGGAGGC  962

Query  817  TTCCCGGGGGCCAACAGCCCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGGGGAA  890
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTCCCGGGGGCCAACAGCCCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGGGGAA  1036

Query  891  TTACATAAGTGCGGCCAGCCCACAGCCGGGCTCGGGCTTCGGCCACGGCATAGCTGGACCTTTGATTGCAACGG  964
            |||||                                                                     
Sbjct 1037  TTACA---------------------------------------------------------------------  1041

Query  965  CCTTTACAAATGGATACCAT  984
                                
Sbjct 1042  --------------------  1041