Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465430
- Subject:
- XM_006715894.3
- Aligned Length:
- 2745
- Identities:
- 2409
- Gaps:
- 336
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAAGAACCAGGTATGCAGTAAGTGTGGTGAAGGCACCTATTCCTTGGGCAGTGGCATCAAATTTGATGAATG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGATGAATTGCCGGCAGGATTTTCTAACATCGCAACATTCATGGACACTGTGGTGGGCCCTTCTGACAGCAGGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CAGACGGCTGTAACAACTCTTCTTGGATCCCTCGTGGAAACTACATAGAATCTAATCGTGATGACTGCACGGTG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TCTTTGATCTATGCTGTGCACCTTAAGAAGTCAGGCTATGTCTTCTTTGAGTACCAGTATGTCGACAACAACAT 296
Query 1 ----------------------------------------ATGGACACCACCACTGACAAGTGGGTAAAACTTA 34
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTCTTTGAGTTCTTTATTCAAAATGATCAGTGCCAGGAGATGGACACCACCACTGACAAGTGGGTAAAACTTA 370
Query 35 CAGACAATGGAGAATGGGGCTCTCATTCTGTAATGCTGAAATCAGGCACAAACATACTCTACTGGAGAACTACA 108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAGACAATGGAGAATGGGGCTCTCATTCTGTAATGCTGAAATCAGGCACAAACATACTCTACTGGAGAACTACA 444
Query 109 GGCATCCTTATGGGTTCTAAGGCGGTCAAGCCTGTGCTGGTAAAAAATATCACAATTGAAGGGGTGGCGTACAC 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCATCCTTATGGGTTCTAAGGCGGTCAAGCCTGTGCTGGTAAAAAATATCACAATTGAAGGGGTGGCGTACAC 518
Query 183 ATCAGAATGTTTTCCTTGCAAGCCAGGCACATTCAGCAACAAACCAGGTTCATTCAACTGCCAGGTGTGTCCCA 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATCAGAATGTTTTCCTTGCAAGCCAGGCACATTCAGCAACAAACCAGGTTCATTCAACTGCCAGGTGTGTCCCA 592
Query 257 GAAACACCTATTCTGAGAAAGGAGCCAAAGAATGTATAAGGTGTAAAGACGACTCTCAATTTTCAGAGGAAGGA 330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAAACACCTATTCTGAGAAAGGAGCCAAAGAATGTATAAGGTGTAAAGACGACTCTCAATTTTCAGAGGAAGGA 666
Query 331 TCCAGTGAGTGTACAGAGCGCCCTCCCTGTACCACAAAAGACTATTTCCAGATCCATACTCCATGTGATGAAGA 404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCCAGTGAGTGTACAGAGCGCCCTCCCTGTACCACAAAAGACTATTTCCAGATCCATACTCCATGTGATGAAGA 740
Query 405 AGGAAAGACACAGATAATGTACAAGTGGATAGAGCCCAAAATCTGCCGGGAGGATCTCACAGATGCTATTAGAT 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGAAAGACACAGATAATGTACAAGTGGATAGAGCCCAAAATCTGCCGGGAGGATCTCACAGATGCTATTAGAT 814
Query 479 TGCCCCCTTCTGGAGAGAAGAAGGATTGTCCGCCTTGCAACCCTGGATTTTATAACAATGGATCATCTTCTTGC 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCCCCCTTCTGGAGAGAAGAAGGATTGTCCGCCTTGCAACCCTGGATTTTATAACAATGGATCATCTTCTTGC 888
Query 553 CATCCCTGTCCTCCTGGAACATTTTCAGATGGAACCAAAGAATGTAGACCATGTCCAGCAGGAACGGAGCCTGC 626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CATCCCTGTCCTCCTGGAACATTTTCAGATGGAACCAAAGAATGTAGACCATGTCCAGCAGGAACGGAGCCTGC 962
Query 627 ACTTGGCTTTGAATATAAATGGTGGAATGTCCTTCCTGGCAACATGAAAACTTCCTGCTTCAATGTTGGGAATT 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACTTGGCTTTGAATATAAATGGTGGAATGTCCTTCCTGGCAACATGAAAACTTCCTGCTTCAATGTTGGGAATT 1036
Query 701 CAAAGTGCGATGGAATGAATGGTTGGGAGGTGGCTGGAGATCATATCCAGAGTGGGGCTGGAGGTTCTGACAAT 774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAAAGTGCGATGGAATGAATGGTTGGGAGGTGGCTGGAGATCATATCCAGAGTGGGGCTGGAGGTTCTGACAAT 1110
Query 775 GATTACCTGATCTTAAACTTGCATATCCCAGGATTTAAACCACCAACATCTATGACTGGAGCCACGGGTTCTGA 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GATTACCTGATCTTAAACTTGCATATCCCAGGATTTAAACCACCAACATCTATGACTGGAGCCACGGGTTCTGA 1184
Query 849 ACTAGGAAGAATAACATTTGTCTTTGAGACCCTCTGTTCAGCTGACTGTGTTTTGTACTTCATGGTGGATATTA 922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACTAGGAAGAATAACATTTGTCTTTGAGACCCTCTGTTCAGCTGACTGTGTTTTGTACTTCATGGTGGATATTA 1258
Query 923 ATAGAAAAAGTACAAATGTGGTAGAATCGTGGGGTGGAACCAAAGAAAAACAAGCTTACACCCATATCATCTTC 996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATAGAAAAAGTACAAATGTGGTAGAATCGTGGGGTGGAACCAAAGAAAAACAAGCTTACACCCATATCATCTTC 1332
Query 997 AAGAATGCAACTTTTACATTTACATGGGCATTCCAGAGAACTAATCAGGGTCAAGATAATAGACGGTTCATCAA 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAGAATGCAACTTTTACATTTACATGGGCATTCCAGAGAACTAATCAGGGTCAAGATAATAGACGGTTCATCAA 1406
Query 1071 TGACATGGTGAAGATTTATTCTATCACAGCCACTAATGCAGTTGATGGGGTGGCGTCCTCATGCCGTGCCTGTG 1144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGACATGGTGAAGATTTATTCTATCACAGCCACTAATGCAGTTGATGGGGTGGCGTCCTCATGCCGTGCCTGTG 1480
Query 1145 CCCTCGGTTCTGAACAGTCGGGTTCATCGTGTGTCCCCTGCCCTCCAGGCCACTACATTGAGAAAGAAACCAAC 1218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCCTCGGTTCTGAACAGTCGGGTTCATCGTGTGTCCCCTGCCCTCCAGGCCACTACATTGAGAAAGAAACCAAC 1554
Query 1219 CAGTGCAAGGAATGTCCACCTGACACCTACCTGTCCATACATCAGGTCTATGGCAAAGAGGCTTGTATTCCATG 1292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAGTGCAAGGAATGTCCACCTGACACCTACCTGTCCATACATCAGGTCTATGGCAAAGAGGCTTGTATTCCATG 1628
Query 1293 CGGGCCTGGGAGTAAAAACAATCAGGACCATTCGGTTTGCTATAGTGACTGCTTTTTCTACCATGAAAAAGAAA 1366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CGGGCCTGGGAGTAAAAACAATCAGGACCATTCGGTTTGCTATAGTGACTGCTTTTTCTACCATGAAAAAGAAA 1702
Query 1367 ATCAGAGTTTGCACTATGACTTTAGCAACCTCAGCAGTGTGGGCTCATTAATGAATGGCCCCAGCTTCACCTCC 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ATCAGAGTTTGCACTATGACTTTAGCAACCTCAGCAGTGTGGGCTCATTAATGAATGGCCCCAGCTTCACCTCC 1776
Query 1441 AAAGGAACAAAATACTTCCATTTCTTCAATATCAGTTTATGTGGGCATGAGGGGAAGAAGATGGCTCTCTGTAC 1514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAAGGAACAAAATACTTCCATTTCTTCAATATCAGTTTATGTGGGCATGAGGGGAAGAAGATGGCTCTCTGTAC 1850
Query 1515 CAACAATATAACAGACTTTACAGTAAAAGAAATAGTGGCAGGGTCAGATGATTACACAAATTTGGTAGGGGCAT 1588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAACAATATAACAGACTTTACAGTAAAAGAAATAGTGGCAGGGTCAGATGATTACACAAATTTGGTAGGGGCAT 1924
Query 1589 TTGTATGCCAGTCAACAATTATTCCTTCTGAAAGTAAGGGTTTCCGAGCAGCCTTATCATCACAATCCATCATT 1662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTGTATGCCAGTCAACAATTATTCCTTCTGAAAGTAAGGGTTTCCGAGCAGCCTTATCATCACAATCCATCATT 1998
Query 1663 CTGGCAGATACATTCATAGGAGTCACAGTTGAAACCACATTGAAAAATATTAATATAAAAGAAGATATGTTCCC 1736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTGGCAGATACATTCATAGGAGTCACAGTTGAAACCACATTGAAAAATATTAATATAAAAGAAGATATGTTCCC 2072
Query 1737 AGTTCCAACAAGCCAAATACCAGATGTGCATTTCTTTTATAAGTCTTCTACAGCAACAACATCTTGTATTAATG 1810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGTTCCAACAAGCCAAATACCAGATGTGCATTTCTTTTATAAGTCTTCTACAGCAACAACATCTTGTATTAATG 2146
Query 1811 GCCGATCAACTGCTGTGAAAATGAGGTGTAATCCTACTAAATCTGGAGCAGGAGTGATTTCAGTCCCCAGCAAG 1884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GCCGATCAACTGCTGTGAAAATGAGGTGTAATCCTACTAAATCTGGAGCAGGAGTGATTTCAGTCCCCAGCAAG 2220
Query 1885 TGCCCAGCAGGTACCTGTGATGGGTGTACGTTCTATTTCCTGTGGGAGAGTGCTGAAGCTTGCCCTCTGTGTAC 1958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TGCCCAGCAGGTACCTGTGATGGGTGTACGTTCTATTTCCTGTGGGAGAGTGCTGAAGCTTGCCCTCTGTGTAC 2294
Query 1959 GGAGCATGACTTCCATGAGATTGAGGGAGCCTGCAAGAGAGGATTTCAGGAAACCTTGTATGTGTGGAATGAAC 2032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GGAGCATGACTTCCATGAGATTGAGGGAGCCTGCAAGAGAGGATTTCAGGAAACCTTGTATGTGTGGAATGAAC 2368
Query 2033 CTAAATGGTGCATTAAAGGAATTTCTTTGCCTGAGAAAAAGTTGGCAACCTGTGAAACGGTTGACTTTTGGCTG 2106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CTAAATGGTGCATTAAAGGAATTTCTTTGCCTGAGAAAAAGTTGGCAACCTGTGAAACGGTTGACTTTTGGCTG 2442
Query 2107 AAGGTGGGAGCCGGTGTGGGAGCTTTTACTGCCGTTTTGCTGGTGGCTCTGACCTGCTACTTCTGGAAAAAGAA 2180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AAGGTGGGAGCCGGTGTGGGAGCTTTTACTGCCGTTTTGCTGGTGGCTCTGACCTGCTACTTCTGGAAAAAGAA 2516
Query 2181 TCAAAAACTGGAATACAAATATTCCAAGTTAGTAATGACGACTAACTCAAAAGAGTGTGAACTCCCGGCTGCAG 2254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TCAAAAACTGGAATACAAATATTCCAAGTTAGTAATGACGACTAACTCAAAAGAGTGTGAACTCCCGGCTGCAG 2590
Query 2255 ACAGTTGTGCTATCATGGAAGGAGAAGATAATGAAGAGGAAGTTGTATATTCCAATAAACAGTCACTACTAGGA 2328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 ACAGTTGTGCTATCATGGAAGGAGAAGATAATGAAGAGGAAGTTGTATATTCCAATAAACAGTCACTACTAGGA 2664
Query 2329 AAACTCAAATCTTTGGCAACCAAGGAAAAAGAAGACCATTTTGAATCTGTTCAACTGAAAACCTCAAGATCCCC 2402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AAACTCAAATCTTTGGCAACCAAGGAAAAAGAAGACCATTTTGAATCTGTTCAACTGAAAACCTCAAGATCCCC 2738
Query 2403 AAATATA 2409
|||||||
Sbjct 2739 AAATATA 2745