Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465441
- Subject:
- NM_026641.2
- Aligned Length:
- 2331
- Identities:
- 2056
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGAGACTAAAGATATCTCTTTTAAAAGAACCAAAGCATCAAGAATTAGTAAGCTGTGTGGGCTGGACTACTGC 74
||||||||.|||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGAGACTGAAGATATCTCTCTCAAAGGAACCAAAGCATCAAGAATTAGTGAGCTGTGTGGGTTGGACTACGGC 74
Query 75 TGAAGAGCTGTATTCATGTAGTGATGATCACCAGATAGTGAAGTGGAACTTGTTAACCAGTGAAACAACTCAAA 148
.||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||.||.|||||||||||||.|..|.||
Sbjct 75 GGAGGAGCTGTACTCATGCAGTGACGACCACCAGATCGTCAAGTGGAACCTGCTAACCAGTGAAACCAGCCTAA 148
Query 149 TAGTAAAGCTTCCTGATGATATTTACCCTATTGATTTTCACTGGTTTCCAAAAAGTTTGGGTGTAAAGAAACAA 222
||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||..||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||.
Sbjct 149 TAGTCAAGCTGCCTGATGACATCTACCCGATAGACCTTCACTGGTTTCCAAAGAGTTTAGGCATAAAGAAACAG 222
Query 223 ACCCAGGCAGAAAGCTTTGTCCTCACAAGTTCTGATGGTAAATTTCATCTGATTTCCAAGTTAGGAAGAGTGGA 296
||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACGCAGGCAGAAAGCTTCGTCCTCACAAGCTCTGATGGTAAGTTTCATCTGATTTCCAAGTTAGGAAGAGTGGA 296
Query 297 AAAAAGTGTAGAAGCTCACTGTGGAGCAGTACTTGCAGGAAGATGGAATTATGAAGGAACAGCATTAGTTACAG 370
|||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct 297 AAAGAGTGTAGAAGCTCACTGTGGGGCTGTGCTCGCAGGACGATGGAATTATGAGGGGACTGCATTAGTGACAG 370
Query 371 TTGGAGAAGATGGACAAATAAAAATTTGGTCAAAGACTGGGATGCTTAGATCAACTTTAGCTCAGCAAGGAACA 444
|||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 TTGGAGAAGATGGACAAGTGAAAATCTGGTCAAAGACAGGGATGCTCAGATCAACTTTAGCCCAGCAAGGAACA 444
Query 445 CCAGTGTATTCAGTAGCGTGGGGCCCTGATTCAGAAAAGGTTCTTTATACAGCAGGCAAGCAGCTAATCATTAA 518
||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 445 CCAGTGTACTCAGTAGCCTGGGGCCCTGATTCAGAAAAGGTTCTTTATACAGCAGGCAAACAGCTCATCATTAA 518
Query 519 ACCTCTTCAACCAAATGCTAAAGTTTTGCAGTGGAAAGCTCATGATGGCATTATTTTAAAAGTAGATTGGAACT 592
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 519 ACCTCTTCAACCAAATGCTAAAGTTTTACAGTGGAAAGCCCATGATGGCATCATTTTAAAAGTCGACTGGAACT 592
Query 593 CGGTCAATGATCTTATTTTATCTGCTGGTGAAGACTGTAAATATAAGGTATGGGATAGTTACGGCCGCCCACTG 666
|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||...|||
Sbjct 593 CAGTGAATGACCTTATTTTATCTGCGGGTGAAGACTGTAAGTATAAGGTTTGGGATAGTTATGGCCGCGTGCTG 666
Query 667 TACAATTCACAACCTCATGAGCATCCCATTACTTCAGTTGCCTGGGCTCCAGATGGAGAATTATTTGCTGTTGG 740
|||...||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 667 TACGGCTCCCAGCCTCATGAGCACCCCATCACCTCAGTGGCCTGGGCTCCAGATGGGGAGTTATTTGCCGTTGG 740
Query 741 ATCGTTTCATACTTTACGCTTGTGTGATAAAACTGGGTGGTCATATGCATTAGAAAAACCCAACACTGGCAGCA 814
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATCGTTTCATACGTTACGCTTGTGTGATAAAACTGGGTGGTCATATGCTTTAGAGAAACCCAACACTGGCAGCA 814
Query 815 TATTTAATATTGCATGGTCTATCGATGGCACTCAGATTGCTGGAGCCTGTGGAAATGGACATGTCGTTTTTGCA 888
|||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||
Sbjct 815 TATTTAACATTGCGTGGTCTATTGATGGCACTCAGATCGCGGGAGCCTGTGGGAACGGGCATGTTGTCTTTGCA 888
Query 889 CATGTGGTGGAACAACATTGGGAGTGGAAAAATTTTCAAGTAACATTAACGAAAAGAAGAGCCATGCAGGTTCG 962
|||||||||||.||.|..||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||..|||||||||||||
Sbjct 889 CATGTGGTGGAGCAGCGCTGGGAGTGGAAAAATTTTCAAGTAACGCTAACGAAGAGAAGGACCATGCAGGTTCG 962
Query 963 TAATGTTCTTAATGATGCAGTGGATTTACTGGAATTCCGTGATAGAGTCATTAAAGCATCTTTGAACTATGCAC 1036
.||.|||||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|.||||
Sbjct 963 CAACGTTCTCAATGATGCCGTGGATCTCCTGGAGTTCCGGGACAGAGTCATTAAAGCATCCTTAAACCACGCAC 1036
Query 1037 ACTTAGTTGTTTCAACGTCTCTTCAATGTTACGTGTTCTCCACGAAGAACTGGAACACACCAATTATATTTGAT 1110
||||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 1037 ACTTGGTGGTCTCCACGTCCCTGCAGTGCTACGTGTTCTCTACGAAGAACTGGAATACACCACTTATATTTGAT 1110
Query 1111 CTCAAAGAAGGAACTGTTAGTTTGATTCTGCAGGCAGAAAGACATTTTCTTCTTGTAGATGGTAGTAGTATCTA 1184
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||..|..|||||||
Sbjct 1111 CTCAAAGAAGGAACTGTTAGTTTAATTCTGCAGGCAGAAAGACATTTTCTTCTGGTGGATGGCGGGGGTATCTA 1184
Query 1185 TTTATATTCATATGAAGGGCGCTTTATTTCATCTCCAAAATTTCCTGGAATGAGAACAGATATTCTGAATGCAC 1258
..|..|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1185 CCTGCACTCTTATGAAGGGCGCTTCATTTCTTCTCCAAAGTTTCCTGGCATGAGAACAGACATCCTGAACGCTC 1258
Query 1259 AGACTGTGTCTTTGAGTAATGATACCATAGCAATAAGAGACAAAGCTGATGAAAAAATAATCTTCCTCTTTGAG 1332
|||||||||||.||||.|||||.||.||||||||||..|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGACTGTGTCTCTGAGCAATGACACGATAGCAATAAAGGACAAAGCTGACGAGAAGATAATCTTCCTCTTTGAG 1332
Query 1333 GCATCAACCGGAAAGCCGTTAGGTGATGGAAAGTTTCTTTCTCATAAGAATGAAATCTTGGAAATTGCTCTGGA 1406
||.|||||.|||||.||..||||.|||||.||..||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 1333 GCGTCAACTGGAAAACCCCTAGGGGATGGGAAACTTCTTTCTCATAAGAATGAAATCTCAGAAATTGCTCTGGA 1406
Query 1407 TCAAAAAGGACTTACCAATGATAGAAAAATTGCTTTCATTGATAAAAATAGAGATCTCTGTATCACTTCTGTGA 1480
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||..|||||.|||||||
Sbjct 1407 TCAAAAAGGACTTACCAATGACAGAAAAATTGCTTTCATTGACAAGAACAGAGATCTCTACATCACCTCTGTGA 1480
Query 1481 AACGATTTGGGAAGGAAGAACAAATTATCAAGCTTGGAACAATGGTGCATACTTTGGCATGGAACGATACATGC 1554
|||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||...|||||||||
Sbjct 1481 AACGATTTGGGAAAGAAGAACAGATTATTAAACTTGGAACCATGGTACATACTTTGGCATGGTGTGATACATGC 1554
Query 1555 AATATCCTTTGTGGACTTCAAGATACTCGATTTATAGTGTGGTATTACCCCAATACAGTTTATGTGGACAGAGA 1628
||||||||.||||||.||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||.|||||..||||||||||||||||
Sbjct 1555 AATATCCTCTGTGGAATTCAAGATACTCGATTCACAGTATGGTATTACCCTAATACCATTTATGTGGACAGAGA 1628
Query 1629 CATTTTGCCTAAAACATTATATGAAAGGGATGCAAGTGAATTTAGTAAAAATCCCCATATTGTGAGTTTTGTTG 1702
||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||.|||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1629 CATTCTGCCTAAAACATTGTACGAAAGAGATGCAAGTGAATATAGTAAAAACCCGCATATAGTGAGTTTTGTTG 1702
Query 1703 GAAATCAAGTAACTATTAGAAGAGCTGATGGCTCCCTGGTTCACATCAGCATAACACCATATCCTGCTATTCTC 1776
|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||.||.|||
Sbjct 1703 GAAATCAGGTAACTATAAGAAGAGCTGATGGCTCCCTGGTGCACATCAGCATATCACCGTACCCCGCCATCCTC 1776
Query 1777 CATGAATATGTAAGCAGTTCAAAATGGGAAGATGCTGTGAGACTTTGTCGCTTTGTTAAGGAGCAAACCATGTG 1850
|||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1777 CATGAGTATGTGAGCAGCTCCAAGTGGGAAGAGGCTGTAAGGCTTTGCCGCTTTGTTAAGGAGCAAAGCATGTG 1850
Query 1851 GGCTTGTCTAGCTGCTATGGCAGTTGCTAATCGAGATATGACTACTGCAGAAATAGCCTATGCAGCAATTGGTG 1924
||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 1851 GGCTTGCCTAGCGGCTATGGCTGTTGCTAATCGAGATATGGTCACTGCAGAAATAGCCTATGCAGCAGTTGGGG 1924
Query 1925 AAATTGATAAGGTTCAGTACATCAATTCTATAAAAAATCTTCCATCTAAAGAATCAAAAATGGCCCACATACTA 1998
||||||||||.||||.||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1925 AAATTGATAAAGTTCGGTACATCAATGCTATAAAAGATCTTCCATCTAGAGAGTCAAAAATGGCCCACATACTC 1998
Query 1999 CTGTTTAGTGGGAACATACAGGAGGCTGAAATAGTACTTCTTCAGGCTGGCCTTGTTTATCAAGCAATCCAGAT 2072
.||||||||||||||||.|||||||||||||.|||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1999 ATGTTTAGTGGGAACATCCAGGAGGCTGAAACAGTCCTGCTCCAGGCTGGCCTTGTTTATCAAGCCATACAGAT 2072
Query 2073 CAATATTAATCTCTACAACTGGGAAAGGGCACTGGAATTGGCTGTAAAATACAAAACACATGTTGATACAGTTC 2146
|||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 2073 CAACATTAATCTCTATAACTGGGAAAGGGCGCTGGAGTTGGCTGTAAAATACAAAACCCACGTTGATACAGTGC 2146
Query 2147 TTGCTTACCGTCAAAAGTTTTTGGAGACATTTGGTAAACAGGAAACTAATAAACGATACTTGCATTATGCAGAA 2220
|.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 2147 TCGCTTATCGTCAGAAGTTCTTGGACACATTTGGTAAACAGGAAACTAATAAACGATATTTACAATATGCAGAG 2220
Query 2221 GGTCTCCAAATAGATTGGGAGAAAATCAAAGCCAAAATTGAGATGGAAATTACAAAAGAAAGAGAGCAATCATC 2294
||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|.||||||
Sbjct 2221 GGCCTCCAAATAGACTGGGAGAAAATCAAAGCCAAAATTGAGATGGAAATTACTAAAGAACGAGACCGATCATC 2294
Query 2295 AAGCAGCCAATCCAGCAAGAGTATAGGTTTAAAGCCC 2331
.|||.||||.||||||||||||.|.||.|||||||.|
Sbjct 2295 CAGCGGCCAGTCCAGCAAGAGTGTGGGCTTAAAGCAC 2331