Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465450
• Subject: XM_017007521.2
• Aligned Length: 1333
• Identities: 1258
• Gaps: 65

Alignment

Query    1  ------ATGGAG-CAGGGGCTGGAGGAGG---------AAGAAGAGGTGG--------ATCCCCGGA-------  43
                  .||.|| ||..|.|   |..|||         |||||.|  |||        ||.||  ||       
Sbjct    1  ATGTCTCTGAAGACATTGTC---AAAAGGGACACCCTCAAGAAAA--TGGTTTCAGAAATGCC--GACATTCAT  67

Query   44  -------TCCAG--------------------GGAGAACTGGAGAAGTTAAATCAGTCCACGGATGATATCAAC  90
                   ||.||                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  TTGCTTTTCTAGTCAAGCCTCAACTGTTTGCCGGAGAACTGGAGAAGTTAAATCAGTCCACGGATGATATCAAC  141

Query   91  AGACGGGAGACTGAACTTGAGGATGCTCGTCAGAAGTTCCGCTCTGTTCTGGTTGAAGCAACGGTGAAACTGGA  164
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  142  AGACGGGAGACTGAACTTGAGGATGCTCGTCAGAAGTTCCGCTCTGTTCTGGTTGAAGCAACGGTGAAACTGGA  215

Query  165  TGAACTGGTGAAGAAAATTGGCAAAGCTGTGGAAGACTCCAAGCCCTACTGGGAGGCACGGAGGGTGGCGAGGC  238
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  TGAACTGGTGAAGAAAATTGGCAAAGCTGTGGAAGACTCCAAGCCCTACTGGGAGGCACGGAGGGTGGCGAGGC  289

Query  239  AGGCTCAGCTGGAAGCTCAGAAAGCCACGCAGGACTTCCAGAGGGCCACAGAGGTGCTCCGTGCCGCCAAGGAG  312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  290  AGGCTCAGCTGGAAGCTCAGAAAGCCACGCAGGACTTCCAGAGGGCCACAGAGGTGCTCCGTGCCGCCAAGGAG  363

Query  313  ACCATCTCCCTGGCCGAGCAGCGGCTGCTGGAGGATGACAAGCGGCAGTTCGACTCCGCCTGGCAGGAGATGCT  386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  364  ACCATCTCCCTGGCCGAGCAGCGGCTGCTGGAGGATGACAAGCGGCAGTTCGACTCCGCCTGGCAGGAGATGCT  437

Query  387  GAATCACGCCACTCAGAGGGTCATGGAGGCGGAGCAGACCAAGACCAGGAGCGAGCTGGTGCATAAGGAGACGG  460
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  438  GAATCACGCCACTCAGAGGGTCATGGAGGCGGAGCAGACCAAGACCAGGAGCGAGCTGGTGCATAAGGAGACGG  511

Query  461  CAGCCAGGTACAATGCCGCCATGGGCCGCATGCGACAGCTGGAGAAGAAACTCAAGAGAGCCATCAACAAGTCC  534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  512  CAGCCAGGTACAATGCCGCCATGGGCCGCATGCGACAGCTGGAGAAGAAACTCAAGAGAGCCATCAACAAGTCC  585

Query  535  AAGCCTTATTTTGAACTCAAGGCAAAGTACTATGTGCAGCTCGAGCAACTGAAAAAGACTGTGGATGACCTGCA  608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  586  AAGCCTTATTTTGAACTCAAGGCAAAGTACTATGTGCAGCTCGAGCAACTGAAAAAGACTGTGGATGACCTGCA  659

Query  609  GGCCAAACTGACCCTGGCAAAAGGCGAGTACAAGATGGCCCTGAAGAACCTGGAGATGATCTCAGATGAGATCC  682
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  GGCCAAACTGACCCTGGCAAAAGGCGAGTACAAGATGGCCCTGAAGAACCTGGAGATGATCTCAGATGAGATCC  733

Query  683  ACGAGCGGCGGCGCTCCAGTGCCATGGGGCCTCGGGGATGCGGTGTTGGTGCTGAGGGCAGCAGCACATCTGTG  756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  734  ACGAGCGGCGGCGCTCCAGTGCCATGGGGCCTCGGGGATGCGGTGTTGGTGCTGAGGGCAGCAGCACATCTGTG  807

Query  757  GAGGATCTGCCAGGGAGCAAACCTGAGCCTGATGCCATTTCTGTGGCCTCGGAGGCCTTTGAAGATGACAGCTG  830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  808  GAGGATCTGCCAGGGAGCAAACCTGAGCCTGATGCCATTTCTGTGGCCTCGGAGGCCTTTGAAGATGACAGCTG  881

Query  831  TAGCAACTTTGTGTCTGAAGATGACTCGGAAACCCAGTCCGTGTCCAGCTTTAGTTCAGGACCAACAAGCCCGT  904
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  882  TAGCAACTTTGTGTCTGAAGATGACTCGGAAACCCAGTCCGTGTCCAGCTTTAGTTCAGGACCAACAAGCCCGT  955

Query  905  CTGAGATGCCTGACCAGTTCCCTGCGGTTGTGAGGCCTGGCAGCCTGGATCTGCCCAGCCCTGTGTCCCTGTCA  978
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  CTGAGATGCCTGACCAGTTCCCTGCGGTTGTGAGGCCTGGCAGCCTGGATCTGCCCAGCCCTGTGTCCCTGTCA  1029

Query  979  GAGTTTGGGATGATGTTCCCAGTGTTGGGCCCTCGAAGTGAATGCAGCGGGGCCTCCTCCCCTGAATGTGAAGT  1052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030  GAGTTTGGGATGATGTTCCCAGTGTTGGGCCCTCGAAGTGAATGCAGCGGGGCCTCCTCCCCTGAATGTGAAGT  1103

Query 1053  AGAACGAGGAGACAGGGCAGAAGGGGCAGAGAATAAAACAAGTGACAAAGCCAACAACAACCGGGGCCTCAGCA  1126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  AGAACGAGGAGACAGGGCAGAAGGGGCAGAGAATAAAACAAGTGACAAAGCCAACAACAACCGGGGCCTCAGCA  1177

Query 1127  GTAGCAGTGGCAGTGGTGGCAGCAGTAAGAGCCAAAGCAGCACCTCCCCTGAGGGCCAGGCCTTGGAGAACCGG  1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178  GTAGCAGTGGCAGTGGTGGCAGCAGTAAGAGCCAAAGCAGCACCTCCCCTGAGGGCCAGGCCTTGGAGAACCGG  1251

Query 1201  ATGAAGCAGCTCTCCCTACAGTGCTCAAAGGGAAGAGATGGAATTATTGCTGACATAAAAATGGTGCAGATTGG  1274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252  ATGAAGCAGCTCTCCCTACAGTGCTCAAAGGGAAGAGATGGAATTATTGCTGACATAAAAATGGTGCAGATTGG  1325

Query 1275  C  1275
            |
Sbjct 1326  C  1326