Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465457
- Subject:
- NM_001365765.1
- Aligned Length:
- 1853
- Identities:
- 1550
- Gaps:
- 262
Alignment
Query 1 ATGAAACAGCCCAACAGGAAAAGGAAGCTTAATATGGATTCCAAAGAGCGTTTGGATCAGGACGGACGCTTGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAACAGCCCAACAGGAAAAGGAAGCTTAATATGGATTCCAAAGAGCGTTTGGATCAGGACGGACGCTTGGA 74
Query 75 GCAAGCTGAAGAGGAAAAGAAGCCCAAGGATAGCACAACCCCTTTGAGTCACGTCCCTTCAGCGGCTGCACAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCAAGCTGAAGAGGAAAAGAAGCCCAAGGATAGCACAACCCCTTTGAGTCACGTCCCTTCAGCGGCTGCACAGG 148
Query 149 GAGCATGGTCTTGGGAGTGGTACTTGAAAGAACAGAAGGCTGTCGCAGCACCTGTTGAGCTGTTTTCCAAGGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GAGCATGGTCTTGGGAGTGGTACTTGAAAGAACAGAAGGCTGTCGCAGCACCTGTTGAGCTGTTTTCCAAGGAT 222
Query 223 CAGTCCTTTCCAGAGCATGAAAATGGTTTTCAGATTGGAATGAGATTAGAAGGCATTGATCCCCGACATCCATC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGTCCTTTCCAGAGCATGAAAATGGTTTTCAGATTGGAATGAGATTAGAAGGCATTGATCCCCGACATCCATC 296
Query 297 GGTATTCTGTGTGCTTTCTGTAGCGGAGGTTTGTGGTTACCGTCTAAGACTTCATTTTGATGGTTATTTAAGTT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTATTCTGTGTGCTTTCTGTAGCGGAGGTTTGTGGTTACCGTCTAAGACTTCATTTTGATGGTTATTTAAGTT 370
Query 371 GCTATGATTTTTGGACCAATGCTGGTTCCCCTGACATTCATCCAGTAGGATGGTGTGAAAAGACCAAACATGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCTATGATTTTTGGACCAATGCTGGTTCCCCTGACATTCATCCAGTAGGATGGTGTGAAAAGACCAAACATGAA 444
Query 445 CTGCACATCCCTAAGGGTTATAGAAAAGATAAATTTGTTTGGATGGATTACTTGAAGGCCTGCAAATTGCAAAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGCACATCCCTAAGGGTTATAGAAAAGATAAATTTGTTTGGATGGATTACTTGAAGGCCTGCAAATTGCAAAA 518
Query 519 TGCTCCAAAGAAATTATTCAGAAACAGAAGTCCTAATGGGCCAATGTCTAAAGAATTTCAGGTTGGAATGAAGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCTCCAAAGAAATTATTCAGAAACAGAAGTCCTAATGGGCCAATGTCTAAAGAATTTCAGGTTGGAATGAAGC 592
Query 593 TGGAGGCCGTGGACAGGAAGAACCCTTCCTTGGTGTGTGTGGCGACCATAGCAGATATTGTTGAAGATCGCTTA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGAGGCCGTGGACAGGAAGAACCCTTCCTTGGTGTGTGTGGCGACCATAGCAGATATTGTTGAAGATCGCTTA 666
Query 667 CTAGTGCATTTTGACAACTGGGATGATAGTTACGATTACTGGTGCGATGTTAATAGCCCTTATGTCCAGCCAGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTAGTGCATTTTGACAACTGGGATGATAGTTACGATTACTGGTGCGATGTTAATAGCCCTTATGTCCAGCCAGT 740
Query 741 TGGTTGGTGTCAGGAGAATGGAAGAACTCTGATAGCACCCCAAGGTTATCCCAATCCAGAAAATTTTTCCTGGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGTTGGTGTCAGGAGAATGGAAGAACTCTGATAGCACCCCAAGGTTATCCCAATCCAGAAAATTTTTCCTGGA 814
Query 815 CAGAATACCTGGAAGCTACTCAAACCAATGCAGTTCCTGCCAAAGTTTTTAAAATGAGGTTGCCTCATGGTTTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGAATACCTGGAAGCTACTCAAACCAATGCAGTTCCTGCCAAAGTTTTTAAAATGAGGTTGCCTCATGGTTTT 888
Query 889 CTGCCAAATATGAAACTTGAAGTTGTGGATAAACGGAACCCCAGGTTAATTCGTGTTGCTACGATTGTAGATGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGCCAAATATGAAACTTGAAGTTGTGGATAAACGGAACCCCAGGTTAATTCGTGTTGCTACGATTGTAGATGT 962
Query 963 TGATGACCAAAGAGTAAAGGTTCATTTTGATGGTTGGGACCATAAGTATGACTACTGGGTGGAGGCAGACAGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGATGACCAAAGAGTAAAGGTTCATTTTGATGGTTGGGACCATAAGTATGACTACTGGGTGGAGGCAGACAGCC 1036
Query 1037 CTGATATCCACCCGATCGGATGGTGTGATGTCACAGGGCATCCACTGGAAGTGCCACAGCGAACGAATGACCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGATATCCACCCGATCGGATGGTGTGATGTCACAGGGCATCCACTGGAAGTGCCACAGCGAACGAATGACCTG 1110
Query 1111 AAGATCCTTCCAGGTCAAGCTGTCTGTCCTACTCCCGGGTGCCGAGGAATAGGCCATATCCGTGGTCCACGTTA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGATCCTTCCAGGTCAAGCTGTCTGTCCTACTCCCGGGTGCCGAGGAATAGGCCATATCCGTGGTCCACGTTA 1184
Query 1185 TTCGGGACATCACAGTGCTTTTGGCTGCCCGTATTCAGACATGAACTTGAAAAAGGAGGCAACACTTCACGATC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTCGGGACATCACAGTGCTTTTGGCTGCCCGTATTCAGACATGAACTTGAAAAAGGAGGCAACACTTCACGATC 1258
Query 1259 GTTTGAGAGAACAAACACAGGCAAATTTGGAATCAGACTCTTCACATTCAAAATCAAAAAGCCTCTGTAGTTTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTTTGAGAGAACAAACACAGGCAAATTTGGAATCAGACTCTTCACATTCAAAATCAAAAAGCCTCTGTAGTTTG 1332
Query 1333 AACTTCAATGGAAAACATGAAAAGGTGAACAGTCAGCCCAGACTTGTACAGCAGGCAAAGTGTTTGAAAATCAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AACTTCAATGGAAAACATGAAAAGGTGAACAGTCAGCCCAGACTTGTACAGCAGGCAAAGTGTTTGAAAATCAA 1406
Query 1407 AGGAAAAGAAGATATTGACTTGGATAATCTCTTCAGAG----------------------GCCGAGTG------ 1452
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.| |||
Sbjct 1407 AGGAAAAGAAGATATTGACTTGGATAATCTCTTCAGAGAATACTCGGTGGAGCAGGCGCAGCAG-GTGCTTCAC 1479
Query 1453 ----CGGTGGCTCATGCC-----TGTAATCCCAGCACTTT--GGGA----GGCCGAGGCAGGCAG-ATCA---C 1507
|.|||.| ||||.| |||.|.|||| |.|||| |||| ..||..||||||.|| |.|| |
Sbjct 1480 CAGTCAGTGTC-CATGTCCACGGTGTCAGCCCA-CCCTTTTCGGGACCTTCCCCTCGGCAGGGAGCAACACTGC 1551
Query 1508 GAGAT-----CAGGAGATCAAGACCATCCTGGCCAACGCAGTGAAAC--------------------------- 1549
.||.| ||||.|.....|| |||||.|||||.|..||||..||
Sbjct 1552 AAGTTGCTTCCAGGCGTGGCTGA-CATCCGGGCCAGCCAAGTGGCACGTTGGACTGTGGATGAGGTGGCTGAGT 1624
Query 1550 ----CCCGTCTCTAC--------CAAAA--ATAC----------AAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCGGGC-- 1597
.|.||||||.| .||.| ||.| ||.||| .||| .|.|.|..|||
Sbjct 1625 TTGTACAGTCTCTTCTGGGCTGTGAAGAGCATGCCAAGTGCTTTAAGAAA-GAGC------AGATCGATGGCAA 1691
Query 1598 -GCCTA-------------------------------------------------------------------- 1602
||||.
Sbjct 1692 AGCCTTCCTGCTTCTGACACAGACGGACATTGTCAAAGTGATGAAGATCAAACTGGGCCCAGCACTGAAGATTT 1765
Query 1603 -------------------------------------------------------------------------- 1602
Sbjct 1766 ACAACTCTATCCTGATGTTCAGGCATTCCCAGGAACTCCCTGAAGAAGATATTGCCTCAGGCCAAGAAGTCAGG 1839
Query 1603 --- 1602
Sbjct 1840 GGA 1842