Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465457
• Subject: XR_935072.1
• Aligned Length: 1835
• Identities: 1302
• Gaps: 484

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ACCTCGCGCTCCGACTCGCCCCCCGCCTGTAGCTCGGTCGGCGTTGCGGGCAGGCGCCGCTCCGCTGGGGATTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTATGCTATGCCTTGTATGACTAAGACCTCTTACCAAGAATACGTGTCAGACCATAAAACCACTGCCAAGGAGT  148

Query    1  ------------ATGAAACAGCCCAACAGGAAAAGGAAGCTTAATATGGATTCCAAAGAGCGTTTGGATCAGGA  62
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGGGGGTGGCAATGAAACAGCCCAACAGGAAAAGGAAGCTTAATATGGATTCCAAAGAGCGTTTGGATCAGGA  222

Query   63  CGGACGCTTGGAGCAAGCTGAAGAGGAAAAGAAGCCCAAGGATAGCACAACCCCTTTGAGTCACGTCCCTTCAG  136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGACGCTTGGAGCAAGCTGAAGAGGAAAAGAAGCCCAAGGATAGCACAACCCCTTTGAGTCACGTCCCTTCAG  296

Query  137  CGGCTGCACAGGGAGCATGGTCTTGGGAGTGGTACTTGAAAGAACAGAAGGCTGTCGCAGCACCTGTTGAGCTG  210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGGCTGCACAGGGAGCATGGTCTTGGGAGTGGTACTTGAAAGAACAGAAGGCTGTCGCAGCACCTGTTGAGCTG  370

Query  211  TTTTCCAAGGATCAGTCCTTTCCAGAGCATGAAAATGGTTTTCAGATTGGAATGAGATTAGAAGGCATTGATCC  284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTTCCAAGGATCAGTCCTTTCCAGAGCATGAAAATGGTTTTCAGATTGGAATGAGATTAGAAGGCATTGATCC  444

Query  285  CCGACATCCATCGGTATTCTGTGTGCTTTCTGTAGCGGAGGTTTGTGGTTACCGTCTAAGACTTCATTTTGATG  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCGACATCCATCGGTATTCTGTGTGCTTTCTGTAGCGGAGGTTTGTGGTTACCGTCTAAGACTTCATTTTGATG  518

Query  359  GTTATTTAAGTTGCTATGATTTTTGGACCAATGCTGGTTCCCCTGACATTCATCCAGTAGGATGGTGTGAAAAG  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTATTTAAGTTGCTATGATTTTTGGACCAATGCTGGTTCCCCTGACATTCATCCAGTAGGATGGTGTGAAAAG  592

Query  433  ACCAAACATGAACTGCACATCCCTAAGGGTTATAGAAAAGATAAATTTGTTTGGATGGATTACTTGAAGGCCTG  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCAAACATGAACTGCACATCCCTAAGGGTTATAGAAAAGATAAATTTGTTTGGATGGATTACTTGAAGGCCTG  666

Query  507  CAAATTGCAAAATGCTCCAAAGAAATTATTCAGAAACAGAAGTCCTAATGGGCCAATGTCTAAAGAATTTCAGG  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAAATTGCAAAATGCTCCAAAGAAATTATTCAGAAACAGAAGTCCTAATGGGCCAATGTCTAAAGAATTTCAGG  740

Query  581  TTGGAATGAAGCTGGAGGCCGTGGACAGGAAGAACCCTTCCTTGGTGTGTGTGGCGACCATAGCAGATATTGTT  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTGGAATGAAGCTGGAGGCCGTGGACAGGAAGAACCCTTCCTTGGTGTGTGTGGCGACCATAGCAGATATTGTT  814

Query  655  GAAGATCGCTTACTAGTGCATTTTGACAACTGGGATGATAGTTACGATTACTGGTGCGATGTTAATAGCCCTTA  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAAGATCGCTTACTAGTGCATTTTGACAACTGGGATGATAGTTACGATTACTGGTGCGATGTTAATAGCCCTTA  888

Query  729  TGTCCAGCCAGTTGGTTGGTGTCAGGAGAATGGAAGAACTCTGATAGCACCCCAAGGTTATCCCAATCCAGAAA  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTCCAGCCAGTTGGTTGGTGTCAGGAGAATGGAAGAACTCTGATAGCACCCCAAGGTTATCCCAATCCAGAAA  962

Query  803  ATTTTTCCTGGACAGAATACCTGGAAGCTACTCAAACCAATGCAGTTCCTGCCAAAGTTTTTAAAATGAGGTTG  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATTTTTCCTGGACAGAATACCTGGAAGCTACTCAAACCAATGCAGTTCCTGCCAAAGTTTTTAAAATGAGGTTG  1036

Query  877  CCTCATGGTTTTCTGCCAAATATGAAACTTGAAGTTGTGGATAAACGGAACCCCAGGTTAATTCGTGTTGCTAC  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTCATGGTTTTCTGCCAAATATGAAACTTGAAGTTGTGGATAAACGGAACCCCAGGTTAATTCGTGTTGCTAC  1110

Query  951  GATTGTAGATGTTGATGACCAAAGAGTAAAGGTTCATTTTGATGGTTGGGACCATAAGTATGACTACTGGGTGG  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATTGTAGATGTTGATGACCAAAGAGTAAAGGTTCATTTTGATGGTTGGGACCATAAGTATGACTACTGGGTGG  1184

Query 1025  AGGCAGACAGCCCTGATATCCACCCGATCGGATGGTGTGATGTCACAGGGCATCCACTGGAAGTGCCACAGCGA  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1185  AGGCAGACAGCCCTGATATCCACCCGATCGGATGGTGTGATGTCACAGGGCATCCACTGGAAGTGCCACAGC--  1256

Query 1099  ACGAATGACCTGAAGATCCTTCCAGGTCAAGCTGTCTGTCCTACTCCCGGGTGCCGAGGAATAGGCCATATCCG  1172
            || |.|||                                            |||.|||.|.||..||.| |||
Sbjct 1257  AC-ATTGA--------------------------------------------GCCAAGGTAGAGTGCACA-CCG  1284

Query 1173  TGGTCCACGTTATTCGGGACATCACAGTGCTTTTGGCTGCCCGTATTCAGACATGAACTTGAAAAAGGAGGCAA  1246
            |||                 |||.||  ||||.||            ||||.||  |||||        .||| 
Sbjct 1285  TGG-----------------ATCTCA--GCTTCTG------------CAGAAAT--ACTTG--------TGCA-  1316

Query 1247  CACTTCACGATCGTTTGAGAGAACAAACACAGGCAAATTTGGAATC--AGACTCTTCACATTCAAAATCAAAAA  1318
                                            |.|||||||  |.|  |||| |.|.|.||||         ||
Sbjct 1317  --------------------------------GTAAATTTG--AGCCAAGAC-CATAATATTC---------AA  1346

Query 1319  GCCTCTGTAGTTTGAACTTCAATGGAAAACATGAAAAGGTGAACAGTCAGCCCAGACTTGTACAGCAGGCAAAG  1392
            ||| ||                             |||           ||||||.||..|.|||        |
Sbjct 1347  GCC-CT-----------------------------AAG-----------GCCCAGTCTCTTGCAG--------G  1371

Query 1393  TGTTTGAAAATCA---AAGGAAAAGAAGATATTGACTTGGATAA-TCTCTTCA-GAGGCCGAGTGCGGTGGCTC  1461
            ||.||  |..|||   ..|||||          .||||||..|| .|||  || ||.|  ||.||         
Sbjct 1372  TGCTT--AGCTCATGTCCGGAAA----------CACTTGGTGAAGGCTC--CAGGATG--GAATG---------  1420

Query 1462  ATGCCTGTAATC--CCAGCACTTTGGGAGG---CCGAGGCAGGCA-GA-TCACGA-------GATCAGGAGA--  1519
             ||||   |.||  ||||||    |||..|   ||.|||...||| || ||.|.|       |||   ||||  
Sbjct 1421  -TGCC---AGTCCACCAGCA----GGGCAGCCCCCCAGGACTGCATGACTCTCCATGCTGTGGAT---GAGAAC  1483

Query 1520  -------------TCAAGACCATCCTGGCCAAC-GCAG--------TGAAACCCCGTCTCTACCAAAAAT----  1567
                         |||  .||.|||||.||  | .|||        |.||||    .||||..||.||||    
Sbjct 1484  GGCTGTACTTACGTCA--CCCTTCCTGCCC--CTTCAGCCCTTGTTTTAAAC----ACTCTTTCAGAAATCAGA  1549

Query 1568  -----ACAA--------AAAAT-----------TAGCCAGGCGTGGTGGCGGGCGCCTA  1602
                 ||||        |||||           ||                        
Sbjct 1550  GCTAAACAATGCAGAATAAAATATTTGATTATGTA------------------------  1584