Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465484
• Subject: XM_006516392.3
• Aligned Length: 1365
• Identities: 1209
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGCTGTCCCGATCCCGCTGTGTGTCTCGGGCGTTCAGCCGCTCGCTCTCCGCCTTCCAGAAGGGGAACTGCCC  74
            |||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGTCCCGGTCACGCTGCGTGTCCCGGGCGTTCAGCCGCTCGCTTTCTGCCTTCCAGAAGGGGAACTGCCC  74

Query   75  TCTAGGGAGACGTTCCCTGCCTGGGGTCTCCTTATGCCAGGGACCAGGTTACCCTAACAGCAGGAAGGTTGTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||.|||.|||||||.|.||||
Sbjct   75  TCTAGGGAGACGTTCCCTGCCTGGGGTCTCCTTATGTCGGGGACCAGGTTACCCTGACAACAGGAAGATGGTCA  148

Query  149  TTAACA---ACAGTGTCTTCAGTGTTCGCTTTTTCAGAACTACAGCTGTATGCAAGGATGACTTGGTTACAGTC  219
            ||||||   ..||.||||||||.||||||||.|||..|||.||.|||||.||||||.||||..||.|.||||||
Sbjct  149  TTAACAGTGGTAGCGTCTTCAGGGTTCGCTTCTTCCAAACCACGGCTGTGTGCAAGAATGATGTGATAACAGTC  222

Query  220  AAAACCCCAGCGTTTGCAGAATCTGTCACAGAGGGAGATGTCAGGTGGGAGAAAGCTGTTGGAGACACAGTTGC  293
            .|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||
Sbjct  223  CAAACCCCAGCGTTTGCAGAGTCTGTCACAGAGGGAGATGTCAGGTGGGAGAAAGCTGTTGGAGATGCGGTTGC  296

Query  294  AGAAGATGAAGTGGTTTGTGAGATTGAAACTGACAAGACATCTGTGCAGGTTCCATCACCAGCAAATGGCGTGA  367
            |||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||.|.|
Sbjct  297  AGAAGATGAAGTGGTGTGTGAGATTGAGACAGACAAGACTTCTGTGCAGGTTCCGTCGCCAGCAAATGGCATCA  370

Query  368  TTGAAGCTCTTTTGGTACCTGATGGGGGAAAAGTCGAAGGAGGCACTCCACTTTTCACACTCAGGAAAACTGGT  441
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||   |
Sbjct  371  TTGAAGCTCTTTTGGTACCCGATGGGGGCAAAGTTGAAGGAGGAACTCCTCTGTTCACACTCAGGAAAAC---T  441

Query  442  GCTGCTCCTGCTAAGGCCAAGCCGGCTGAAGCTCCTGCTGCTGCAGCCCCAAAAGCAGAACCTACAGCA---GC  512
            ||||||||||||||||||||.||.||||||.|||   |||||.||||||..||||||||.||..|||||   ||
Sbjct  442  GCTGCTCCTGCTAAGGCCAAACCAGCTGAAACTC---CTGCTCCAGCCCACAAAGCAGAGCCCGCAGCACCGGC  512

Query  513  GGCAGTTCCTCCCCCTGCAGCACCCATACCCACTCAGATGCCACCGGTGCCCTCGCCCTCACAACCTCCTTCTG  586
            |||...|||||||||.||||||||..|.|.|||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||.
Sbjct  513  GGCCCCTCCTCCCCCCGCAGCACCTGTGCTCACTCAGATGCCACCAGTGCCCTCACCCTCACAGCCTCCTTCTA  586

Query  587  GCAAACCTGTGTCTGCAGTAAAACCCACTGTTGCCCCACCACTAGCTGAGCCAGGAGCTGGCAAAGGTCTGCGT  660
            |||||||.|||||||||.||||||||||||.||||||.|||||.||||||.|||||||||..||||||||||||
Sbjct  587  GCAAACCAGTGTCTGCAATAAAACCCACTGCTGCCCCTCCACTGGCTGAGGCAGGAGCTGCTAAAGGTCTGCGT  660

Query  661  TCAGAACATCGGGAGAAAATGAACAGGATGCGGCAGCGCATTGCTCAGCGTCTGAAGGAGGCCCAGAATACATG  734
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  661  TCAGAACATCGGGAGAAAATGAACAGGATGCGGCAGCGCATCGCCCAGCGTCTGAAGGAAGCCCAGAACACGTG  734

Query  735  TGCAATGCTGACAACTTTTAATGAGATTGACATGAGTAACATCCAGGAGATGAGGGCTCGGCACAAAGAGGCTT  808
            ||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  735  TGCAATGCTGACGACTTTCAATGAGGTTGACATGAGTAACATACAAGAGATGAGAGCTCGGCACAAGGATGCTT  808

Query  809  TTTTGAAGAAACATAACCTCAAACTAGGCTTCATGTCGGCATTTGTGAAGGCCTCAGCCTTTGCCTTGCAGGAA  882
            |..||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  809  TCCTGAAAAAACATAACCTCAAATTAGGCTTCATGTCAGCATTTGTGAAGGCCTCGGCGTTCGCCTTGCAGGAG  882

Query  883  CAGCCTGTTGTAAATGCAGTGATTGACGACACAACCAAAGAGGTGGTGTATAGGGATTATATTGACATCAGTGT  956
            ||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  883  CAGCCTGTTGTAAATGCAGTGATTGATGATGCAACCAAGGAAGTGGTGTATAGAGATTATATTGACATCAGTGT  956

Query  957  TGCAGTGGCCACCCCACGGGGTCTGGTGGTTCCAGTCATCAGGAATGTGGAAGCTATGAATTTTGCAGATATTG  1030
            ||||||.||.|||||..|||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|.|||||||||||
Sbjct  957  TGCAGTTGCTACCCCGAGGGGTCTCGTGGTTCCTGTCATCAGGAATGTGGAAACTATGAACTATGCAGATATTG  1030

Query 1031  AACGGACCATCACTGAACTGGGAGAGAAGGCCCGAAAGAATGAACTTGCCATTGAAGATATGGATGGCGGTACC  1104
            ||||||||||.|.||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1031  AACGGACCATTAATGAACTAGGAGAGAAGGCCCGGAAGAATGAACTTGCCATTGAAGATATGGATGGTGGTACC  1104

Query 1105  TTCACCATTAGCAATGGAGGCGTTTTTGGCTCGCTCTTTGGAACACCCATTATCAACCCCCCTCAGTCTGCCAT  1178
            ||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1105  TTCACCATCAGCAACGGAGGAGTTTTTGGCTCACTTTTTGGAACACCCATTATCAACCCCCCTCAATCTGCCAT  1178

Query 1179  CCTGGGGATGCATGGCATCTTTGACAGGCCAGTGGCTATAGGAGGCAAGGTAGAGGTGCGGCCCATGATGTACG  1252
            ||||||.|||||.|.|||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1179  CCTGGGCATGCACGCCATCTTTGACAGGCCTGTGGCTGTGGGAGGCAAGGTGGAAGTTCGACCTATGATGTATG  1252

Query 1253  TGGCACTGACCTATGATCACCGGCTGATTGATGGCAGAGAGGCTGTGACTTTCCTCCGCAAAATCAAGGCAGCG  1326
            |.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1253  TAGCCCTGACCTATGACCACCGGCTGATTGATGGCAGAGAGGCTGTGACTTTCCTCCGAAAAATCAAGGCAGCA  1326

Query 1327  GTAGAGGATCCCAGAGTCCTCCTCCTGGATCTT  1359
            |||||.|||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1327  GTAGAAGATCCAAGAGTCCTCCTCCTAGACCTT  1359