Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465498
- Subject:
- NM_001037128.1
- Aligned Length:
- 2638
- Identities:
- 2068
- Gaps:
- 293
Alignment
Query 1 ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC 74
|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGAGAGCTTGTCAACATTCCACTGTTACAGATGCTCACCCTGGTTGCCTTCAGCGGGACTGAGAAACTTCC 74
Query 75 AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG 148
||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 AAAAGCCCCTGTCATCACCACGCCTCTTGAAACTGTAGATGCCTTGGTTGAAGAAGTAGCGACTTTCATGTGTG 148
Query 149 CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG 222
|.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 149 CCGTGGAATCCTACCCTCAGCCCGAGATTTCTTGGACCAGAAATAAAATTCTCATTAAGCTGTTTGACACCCGC 222
Query 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG 296
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGTCAGCTCCTCACCATTCTGAGCGTGGAAGACAGTGATGATGGCATCTACTGCTG 296
Query 297 CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATAGCCAACAATGGAGTGGGAGGAGCCGTGGAGAGTTGTGGTGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
Query 371 CTCGTCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAAGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC 444
|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 371 CTCGTCCTCCCATTAATGTAAAAATAATAGAGGGATTGAAGGCAGTTCTGCCGTGCACTACGATGGGTAACCCC 444
Query 445 AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG 518
||||||||.|||||.|||||.|||||.||||...|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 AAACCATCTGTGTCCTGGATCAAGGGGGACAATGCTCTCAGGGAAAATTCCAGAATCGCAGTTCTTGAATCTGG 518
Query 519 GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA 592
||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 519 GAGCTTAAGGATCCATAATGTGCAAAAGGAAGATGCAGGACAGTACCGCTGTGTGGCCAAAAACAGCCTGGGCA 592
Query 593 CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAGGAAGAAAGTGAACCCGAACAAGATACTAAAGTTTTTGCC 666
||||.||.||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||..|||||||||||||.
Sbjct 593 CAGCTTACTCCAAACTGGTGAAGCTGGAAGTGGAGGAAGACAGAGAACCTGAGCAGGACGCTAAAGTTTTTGCA 666
Query 667 AGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGCTCCTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGG 740
||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|.|||.|||||||.|||
Sbjct 667 AGAATCCTGCGTGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGTTCCTTTGTAACCCTACGCTGCACAGCAATAGG 740
Query 741 CATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGAAAACGGAAATGCTGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGA 814
|||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 741 CATCCCTGTCCCCACCATCAGCTGGATTGAAAACGGAAATGCTGTTTCTTCAGGTTCCATTCAAGAGAGTGTGA 814
Query 815 AAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGCTGTTTATCACCAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAAT 888
|||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTCCAGCTCTTCATCACAAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAAT 888
Query 889 AAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGAATGG-------------- 948
|||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGCACGGAGAAAAGTTCAGTACCGCAAAGGCTGCAGCCACTGTCAGCATAGCAGAATGGAGTAAGTCACAGAA 962
Query 949 -------------------------------------------------------------------------- 948
Sbjct 963 AGACAGCCAAGGCTACTGTGCCCAGTACAGAGGGGAGGTGTGTGATGCAGTCCTGGCGAAAGATGCTCTTGTCT 1036
Query 949 -------------------------------------------------------------------------- 948
Sbjct 1037 TCTTCAACACCTCCTACCGGGACCCCGAGGACGCCCAGGAGCTGCTGATCCACACTGCGTGGAATGAGCTGAAG 1110
Query 949 -------------------------------------------------------------------------- 948
Sbjct 1111 GCTGTGAGTCCACTGTGCCGGCCAGCTGCTGAGGCTCTGCTGTGTAACCACCTCTTCCAAGAGTGCAGCCCTGG 1184
Query 949 ----------------------------AGAGAGTACTGCTTGGCAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAAT 994
||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1185 AGTGGTACCTACTCCCATGCCCATTTGCAGAGAGTACTGCCTGGCGGTAAAGGAGCTCTTCTGTGCAAAGGAAT 1258
Query 995 GGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGAGGACTCTACAGATCCGAGATGCATTTGCTGTCC-GTGCCAGAATG 1067
|||.||.||||||||..|||.|||||.|.||.|||||||||||.|.|||||||.|.|| ||| ||.|||||.||
Sbjct 1259 GGCAGGCAATGGAAGGAAAGGCCCACCGGGGCCTCTACAGATCTGGGATGCATCTCCT-TCCGGTACCAGAGTG 1331
Query 1068 CAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACCCCACGGCCTGTGCCAGACTGCCACATCTAG--------------- 1126
|||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||..|.|||||||||.||.|||
Sbjct 1332 CAGCAAGCTTCCCAGCATGCACCGGGACCCCACAGCCTGCACAAGACTGCCATATTTAGATTATAAAAAAGAAA 1405
Query 1127 ---------CATTCCCACCAATGACGTCCTCAAAGCCAAGTGTGGACATTCCAAATCTGCCTTCCTCCTCCTCT 1191
|||||||..||||.||||||||.|.|||.||.|.||||||||||||.||||||.|||||.||
Sbjct 1406 ACATAACAACATTCCCGTCAATAACGTCCTCCAGGCCGAGCGCGGACATTCCAAACCTGCCTGCCTCCACC--- 1476
Query 1192 TCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACATACTCCATGACTGTAATAATCTCCATCATGTCCAGCTTTGCAATATTTGT 1265
||||||||..|.|||||.|||.|.|||||||||||.||.||.|||||||||.|||||||||||||..|.||||.
Sbjct 1477 TCTTCCTTTGCCGTCTCGCCTGCGTACTCCATGACCGTCATCATCTCCATCGTGTCCAGCTTTGCCCTGTTTGC 1550
Query 1266 GCTTCTTACCATAACTACTCTCTATTGCTGCCGAAGAAGAAAACAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAATCAGCAG 1339
.|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||..|.|
Sbjct 1551 TCTTCTCACCATCGCTACTCTCTATTGCTGCCGAAGGAGGAAAGAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAGTCGACCG 1624
Query 1340 CAGTAACCCTCACCACACTGCCTTCTGAGCTCTTACTAGATAGACTTCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATG 1413
|.||.|||||||||||..|||||||.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 CGGTGACCCTCACCACGTTGCCTTCCGAGCTCCTGCTGGATAGGCTCCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATG 1698
Query 1414 CCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTGCTCAGCCTGGAGTATCCAAGGAATAACATTGAATATGTGAGAGACATCGG 1487
||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct 1699 CCACTCCTTCTGAATCCTAAGTTGCTCAGCCTGGAGTATCCGAGGAATAACATTGAGTATGTCCGAGACATCGG 1772
Query 1488 AGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTTTCAAGCAAGGGCACCAGGCTTACTTCCCTATGAACCTTTCACTATGGTGG 1561
||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 AGAGGGGGCGTTTGGAAGAGTCTTCCAAGCAAGGGCCCCTGGCTTGCTGCCTTATGAACCTTTCACTATGGTGG 1846
Query 1562 CAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAGCCTCGGCAGATATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCTCATGGCA 1635
|.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1847 CCGTGAAGATGCTTAAGGAAGAGGCCTCTGCAGACATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCGGCCCTCATGGCA 1920
Query 1636 GAATTTGACAACCCTAACATTGTGAAGCTATTAGGAGTGTGTGCTGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGCTCTTTGA 1709
||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1921 GAGTTTGACAACCCCAACATTGTGAAACTCTTAGGTGTGTGTGCCGTTGGGAAGCCGATGTGTCTGCTCTTTGA 1994
Query 1710 ATACATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGCAGCATGTCCCCTCACACCGTGTGCAGCCTCAGTCACA 1783
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1995 ATATATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGAAGTATGTCCCCGCACACTGTTTGCAGCCTCAGCCACA 2068
Query 1784 GTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGGTCTCCAGCCCTGGGCCCCCACCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCTTTGCATT 1857
|||||.||||.|.||||||||.|||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 2069 GTGACCTGTCCACGAGGGCTCGGGTGTCTAGCCCTGGTCCTCCACCACTGTCCTGTGCAGAACAGCTCTGCATT 2142
Query 1858 GCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCTTACCTCTCAGAACGTAAGTTTGTTCACCGAGATTTAGCCACCAGGAA 1931
||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 2143 GCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCCTACCTTTCAGAGCGCAAGTTTGTCCACCGGGACTTAGCTACCAGGAA 2216
Query 1932 CTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGTGGTGAAAATTGCCGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTACTCAGCAGACT 2005
|||||||||.||.||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2217 CTGCCTGGTTGGGGAGACCATGGTGGTGAAAATTGCAGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTATTCCGCAGACT 2290
Query 2006 ACTACAAAGCTAATGAAAACGACGCTATCCCTATCCGTTGGATGCCACCAGAGTCCATTTTTTATAACCGCTAC 2079
|||||||||||.|||.|||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 2291 ACTACAAAGCTGATGGAAATGACGCCATCCCTATCCGCTGGATGCCGCCCGAGTCTATCTTCTACAACCGCTAC 2364
Query 2080 ACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCCTATGGCGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGCCTGCAGCCCTACTA 2153
||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2365 ACCACTGAGTCGGATGTATGGGCCTATGGTGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGGCTGCAGCCCTACTA 2438
Query 2154 TGGGATGGCCCATGAGGAGGTCATTTACTACGTGCGAGATGGCAACATCCTCTCCTGCCCTGAGAACTGCCCCG 2227
|||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2439 TGGAATGGCCCACGAGGAGGTCATTTACTATGTGAGAGATGGCAACATCCTCGCCTGCCCTGAGAACTGCCCCT 2512
Query 2228 TGGAGCTGTACAATCTCATGCGTCTATGTTGGAGCAAGCTGCCTGCAGACAGACCCAGTTTCACCAGTATTCAC 2301
||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||..||||||.|||
Sbjct 2513 TGGAACTGTACAACCTCATGCGCCTGTGTTGGAGCAAGCTGCCTGCTGATAGACCCAGCTTCTGCAGTATCCAC 2586
Query 2302 CGAATTCTGGAACGCATGTGTGAGAGGGCAGAGGGAACTGTGAGTGTC 2349
.|.||.|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||
Sbjct 2587 AGGATCCTGCAGCGCATGTGCGAGAGAGCAGAGGGAACGGTGGGTGTC 2634