Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465498
• Subject: NM_001037129.1
• Aligned Length: 2614
• Identities: 2068
• Gaps: 269

Alignment

Query    1  ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC  74
            |||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGAGAGCTTGTCAACATTCCACTGTTACAGATGCTCACCCTGGTTGCCTTCAGCGGGACTGAGAAACTTCC  74

Query   75  AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG  148
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  AAAAGCCCCTGTCATCACCACGCCTCTTGAAACTGTAGATGCCTTGGTTGAAGAAGTAGCGACTTTCATGTGTG  148

Query  149  CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG  222
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  149  CCGTGGAATCCTACCCTCAGCCCGAGATTTCTTGGACCAGAAATAAAATTCTCATTAAGCTGTTTGACACCCGC  222

Query  223  TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG  296
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  TACAGCATCCGGGAGAATGGTCAGCTCCTCACCATTCTGAGCGTGGAAGACAGTGATGATGGCATCTACTGCTG  296

Query  297  CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA  370
            ||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATAGCCAACAATGGAGTGGGAGGAGCCGTGGAGAGTTGTGGTGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA  370

Query  371  CTCGTCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAAGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC  444
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  371  CTCGTCCTCCCATTAATGTAAAAATAATAGAGGGATTGAAGGCAGTTCTGCCGTGCACTACGATGGGTAACCCC  444

Query  445  AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG  518
            ||||||||.|||||.|||||.|||||.||||...|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACCATCTGTGTCCTGGATCAAGGGGGACAATGCTCTCAGGGAAAATTCCAGAATCGCAGTTCTTGAATCTGG  518

Query  519  GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA  592
            ||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  519  GAGCTTAAGGATCCATAATGTGCAAAAGGAAGATGCAGGACAGTACCGCTGTGTGGCCAAAAACAGCCTGGGCA  592

Query  593  CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAGGAAGAAAGTGAACCCGAACAAGATACTAAAGTTTTTGCC  666
            ||||.||.||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||..|||||||||||||.
Sbjct  593  CAGCTTACTCCAAACTGGTGAAGCTGGAAGTGGAGGAAGACAGAGAACCTGAGCAGGACGCTAAAGTTTTTGCA  666

Query  667  AGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGCTCCTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGG  740
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|.|||.|||||||.|||
Sbjct  667  AGAATCCTGCGTGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGTTCCTTTGTAACCCTACGCTGCACAGCAATAGG  740

Query  741  CATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGAAAACGGAAATGCTGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGA  814
            |||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATCCCTGTCCCCACCATCAGCTGGATTGAAAACGGAAATGCTGTTTCTTCAGGTTCCATTCAAGAGAGTGTGA  814

Query  815  AAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGCTGTTTATCACCAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAAT  888
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTCCAGCTCTTCATCACAAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAAT  888

Query  889  AAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGAATGG--------------  948
            |||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||              
Sbjct  889  AAGCACGGAGAAAAGTTCAGTACCGCAAAGGCTGCAGCCACTGTCAGCATAGCAGAATGGAGTAAGTCACAGAA  962

Query  949  --------------------------------------------------------------------------  948
                                                                                      
Sbjct  963  AGACAGCCAAGGCTACTGTGCCCAGTACAGAGGGGAGGTGTGTGATGCAGTCCTGGCGAAAGATGCTCTTGTCT  1036

Query  949  --------------------------------------------------------------------------  948
                                                                                      
Sbjct 1037  TCTTCAACACCTCCTACCGGGACCCCGAGGACGCCCAGGAGCTGCTGATCCACACTGCGTGGAATGAGCTGAAG  1110

Query  949  --------------------------------------------------------------------------  948
                                                                                      
Sbjct 1111  GCTGTGAGTCCACTGTGCCGGCCAGCTGCTGAGGCTCTGCTGTGTAACCACCTCTTCCAAGAGTGCAGCCCTGG  1184

Query  949  ----------------------------AGAGAGTACTGCTTGGCAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAAT  994
                                        ||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1185  AGTGGTACCTACTCCCATGCCCATTTGCAGAGAGTACTGCCTGGCGGTAAAGGAGCTCTTCTGTGCAAAGGAAT  1258

Query  995  GGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGAGGACTCTACAGATCCGAGATGCATTTGCTGTCC-GTGCCAGAATG  1067
            |||.||.||||||||..|||.|||||.|.||.|||||||||||.|.|||||||.|.|| ||| ||.|||||.||
Sbjct 1259  GGCAGGCAATGGAAGGAAAGGCCCACCGGGGCCTCTACAGATCTGGGATGCATCTCCT-TCCGGTACCAGAGTG  1331

Query 1068  CAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACCCCACGGCCTGTGCCAGACTGCCACATCTAGCATTCCCACCAATGA  1141
            |||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||..|.|||||||||.||.||||||||||..||||.|
Sbjct 1332  CAGCAAGCTTCCCAGCATGCACCGGGACCCCACAGCCTGCACAAGACTGCCATATTTAGCATTCCCGTCAATAA  1405

Query 1142  CGTCCTCAAAGCCAAGTGTGGACATTCCAAATCTGCCTTCCTCCTCCTCTTCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACA  1215
            |||||||.|.|||.||.|.||||||||||||.||||||.|||||.||   ||||||||..|.|||||.|||.|.
Sbjct 1406  CGTCCTCCAGGCCGAGCGCGGACATTCCAAACCTGCCTGCCTCCACC---TCTTCCTTTGCCGTCTCGCCTGCG  1476

Query 1216  TACTCCATGACTGTAATAATCTCCATCATGTCCAGCTTTGCAATATTTGTGCTTCTTACCATAACTACTCTCTA  1289
            |||||||||||.||.||.|||||||||.|||||||||||||..|.||||..|||||.|||||..||||||||||
Sbjct 1477  TACTCCATGACCGTCATCATCTCCATCGTGTCCAGCTTTGCCCTGTTTGCTCTTCTCACCATCGCTACTCTCTA  1550

Query 1290  TTGCTGCCGAAGAAGAAAACAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAATCAGCAGCAGTAACCCTCACCACACTGCCTT  1363
            ||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||..|.||.||.|||||||||||..||||||
Sbjct 1551  TTGCTGCCGAAGGAGGAAAGAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAGTCGACCGCGGTGACCCTCACCACGTTGCCTT  1624

Query 1364  CTGAGCTCTTACTAGATAGACTTCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTG  1437
            |.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1625  CCGAGCTCCTGCTGGATAGGCTCCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCACTCCTTCTGAATCCTAAGTTG  1698

Query 1438  CTCAGCCTGGAGTATCCAAGGAATAACATTGAATATGTGAGAGACATCGGAGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTT  1511
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1699  CTCAGCCTGGAGTATCCGAGGAATAACATTGAGTATGTCCGAGACATCGGAGAGGGGGCGTTTGGAAGAGTCTT  1772

Query 1512  TCAAGCAAGGGCACCAGGCTTACTTCCCTATGAACCTTTCACTATGGTGGCAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAG  1585
            .|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1773  CCAAGCAAGGGCCCCTGGCTTGCTGCCTTATGAACCTTTCACTATGGTGGCCGTGAAGATGCTTAAGGAAGAGG  1846

Query 1586  CCTCGGCAGATATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCTCATGGCAGAATTTGACAACCCTAACATTGTG  1659
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1847  CCTCTGCAGACATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCGGCCCTCATGGCAGAGTTTGACAACCCCAACATTGTG  1920

Query 1660  AAGCTATTAGGAGTGTGTGCTGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGCTCTTTGAATACATGGCCTATGGTGACCTCAA  1733
            ||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  AAACTCTTAGGTGTGTGTGCCGTTGGGAAGCCGATGTGTCTGCTCTTTGAATATATGGCCTATGGTGACCTCAA  1994

Query 1734  TGAGTTCCTCCGCAGCATGTCCCCTCACACCGTGTGCAGCCTCAGTCACAGTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGG  1807
            ||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||.||||.|.||||||||.||
Sbjct 1995  TGAGTTCCTCCGAAGTATGTCCCCGCACACTGTTTGCAGCCTCAGCCACAGTGACCTGTCCACGAGGGCTCGGG  2068

Query 1808  TCTCCAGCCCTGGGCCCCCACCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCTTTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATG  1881
            |.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069  TGTCTAGCCCTGGTCCTCCACCACTGTCCTGTGCAGAACAGCTCTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATG  2142

Query 1882  GCTTACCTCTCAGAACGTAAGTTTGTTCACCGAGATTTAGCCACCAGGAACTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGT  1955
            ||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||.||||||
Sbjct 2143  GCCTACCTTTCAGAGCGCAAGTTTGTCCACCGGGACTTAGCTACCAGGAACTGCCTGGTTGGGGAGACCATGGT  2216

Query 1956  GGTGAAAATTGCCGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTACTCAGCAGACTACTACAAAGCTAATGAAAACGACG  2029
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|||.|||.||||
Sbjct 2217  GGTGAAAATTGCAGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTATTCCGCAGACTACTACAAAGCTGATGGAAATGACG  2290

Query 2030  CTATCCCTATCCGTTGGATGCCACCAGAGTCCATTTTTTATAACCGCTACACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCC  2103
            |.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 2291  CCATCCCTATCCGCTGGATGCCGCCCGAGTCTATCTTCTACAACCGCTACACCACTGAGTCGGATGTATGGGCC  2364

Query 2104  TATGGCGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGCCTGCAGCCCTACTATGGGATGGCCCATGAGGAGGTCAT  2177
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 2365  TATGGTGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGGCTGCAGCCCTACTATGGAATGGCCCACGAGGAGGTCAT  2438

Query 2178  TTACTACGTGCGAGATGGCAACATCCTCTCCTGCCCTGAGAACTGCCCCGTGGAGCTGTACAATCTCATGCGTC  2251
            ||||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 2439  TTACTATGTGAGAGATGGCAACATCCTCGCCTGCCCTGAGAACTGCCCCTTGGAACTGTACAACCTCATGCGCC  2512

Query 2252  TATGTTGGAGCAAGCTGCCTGCAGACAGACCCAGTTTCACCAGTATTCACCGAATTCTGGAACGCATGTGTGAG  2325
            |.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||..||||||.|||.|.||.|||.|.||||||||.|||
Sbjct 2513  TGTGTTGGAGCAAGCTGCCTGCTGATAGACCCAGCTTCTGCAGTATCCACAGGATCCTGCAGCGCATGTGCGAG  2586

Query 2326  AGGGCAGAGGGAACTGTGAGTGTC  2349
            ||.|||||||||||.|||.|||||
Sbjct 2587  AGAGCAGAGGGAACGGTGGGTGTC  2610